Protein–RNA interactions for Protein: D3YUH6

Ube2d4, Ubiquitin-conjugating enzyme E2D 4, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d4D3YUH6 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2d4D3YUH6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2d4D3YUH6 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2d4D3YUH6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2d4D3YUH6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2d4D3YUH6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ube2d4D3YUH6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2d4D3YUH6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2d4D3YUH6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2d4D3YUH6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2d4D3YUH6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2d4D3YUH6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ube2d4D3YUH6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2d4D3YUH6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2d4D3YUH6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ube2d4D3YUH6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2d4D3YUH6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ube2d4D3YUH6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2d4D3YUH6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2d4D3YUH6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2d4D3YUH6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2d4D3YUH6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2d4D3YUH6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ube2d4D3YUH6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2d4D3YUH6 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube2d4D3YUH6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2d4D3YUH6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2d4D3YUH6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube2d4D3YUH6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ube2d4D3YUH6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2d4D3YUH6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2d4D3YUH6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2d4D3YUH6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2d4D3YUH6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2d4D3YUH6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2d4D3YUH6 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2d4D3YUH6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2d4D3YUH6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2d4D3YUH6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2d4D3YUH6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2d4D3YUH6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2d4D3YUH6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2d4D3YUH6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2d4D3YUH6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2d4D3YUH6 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2d4D3YUH6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2d4D3YUH6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2d4D3YUH6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2d4D3YUH6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2d4D3YUH6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2d4D3YUH6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2d4D3YUH6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2d4D3YUH6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2d4D3YUH6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2d4D3YUH6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2d4D3YUH6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2d4D3YUH6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2d4D3YUH6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2d4D3YUH6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2d4D3YUH6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2d4D3YUH6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2d4D3YUH6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2d4D3YUH6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2d4D3YUH6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2d4D3YUH6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2d4D3YUH6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2d4D3YUH6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2d4D3YUH6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2d4D3YUH6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2d4D3YUH6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2d4D3YUH6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2d4D3YUH6 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2d4D3YUH6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2d4D3YUH6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2d4D3YUH6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2d4D3YUH6 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ube2d4D3YUH6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2d4D3YUH6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2d4D3YUH6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2d4D3YUH6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2d4D3YUH6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2d4D3YUH6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2d4D3YUH6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2d4D3YUH6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2d4D3YUH6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2d4D3YUH6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2d4D3YUH6 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2d4D3YUH6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2d4D3YUH6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2d4D3YUH6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2d4D3YUH6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2d4D3YUH6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2d4D3YUH6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2d4D3YUH6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2d4D3YUH6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2d4D3YUH6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2d4D3YUH6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2d4D3YUH6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2d4D3YUH6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2d4D3YUH6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms