Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Clrn2B2RVW2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Clrn2B2RVW2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Clrn2B2RVW2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Clrn2B2RVW2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Clrn2B2RVW2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Clrn2B2RVW2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Clrn2B2RVW2 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Clrn2B2RVW2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Clrn2B2RVW2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Clrn2B2RVW2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Clrn2B2RVW2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Clrn2B2RVW2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Clrn2B2RVW2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Clrn2B2RVW2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Clrn2B2RVW2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Clrn2B2RVW2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Clrn2B2RVW2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Clrn2B2RVW2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Clrn2B2RVW2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Clrn2B2RVW2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Clrn2B2RVW2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Clrn2B2RVW2 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Clrn2B2RVW2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Clrn2B2RVW2 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Clrn2B2RVW2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Clrn2B2RVW2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Clrn2B2RVW2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Clrn2B2RVW2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Clrn2B2RVW2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Clrn2B2RVW2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Clrn2B2RVW2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Clrn2B2RVW2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Clrn2B2RVW2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Clrn2B2RVW2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Clrn2B2RVW2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Clrn2B2RVW2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Clrn2B2RVW2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Clrn2B2RVW2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Clrn2B2RVW2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Clrn2B2RVW2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Clrn2B2RVW2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Clrn2B2RVW2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Clrn2B2RVW2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Clrn2B2RVW2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Clrn2B2RVW2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Clrn2B2RVW2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Clrn2B2RVW2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Clrn2B2RVW2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Clrn2B2RVW2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Clrn2B2RVW2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Clrn2B2RVW2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Clrn2B2RVW2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Clrn2B2RVW2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Clrn2B2RVW2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Clrn2B2RVW2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Clrn2B2RVW2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Clrn2B2RVW2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Clrn2B2RVW2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Clrn2B2RVW2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Clrn2B2RVW2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Clrn2B2RVW2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Clrn2B2RVW2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Clrn2B2RVW2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Clrn2B2RVW2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Clrn2B2RVW2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Clrn2B2RVW2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Clrn2B2RVW2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Clrn2B2RVW2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Clrn2B2RVW2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Clrn2B2RVW2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Clrn2B2RVW2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Clrn2B2RVW2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Clrn2B2RVW2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Clrn2B2RVW2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Clrn2B2RVW2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Clrn2B2RVW2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Clrn2B2RVW2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Clrn2B2RVW2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Clrn2B2RVW2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Clrn2B2RVW2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Clrn2B2RVW2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Clrn2B2RVW2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Clrn2B2RVW2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Clrn2B2RVW2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Clrn2B2RVW2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Clrn2B2RVW2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Clrn2B2RVW2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Clrn2B2RVW2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Clrn2B2RVW2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Clrn2B2RVW2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Clrn2B2RVW2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Clrn2B2RVW2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Clrn2B2RVW2 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Clrn2B2RVW2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Clrn2B2RVW2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Clrn2B2RVW2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Clrn2B2RVW2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Clrn2B2RVW2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Clrn2B2RVW2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms