Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rrn3B2RS91 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rrn3B2RS91 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rrn3B2RS91 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rrn3B2RS91 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rrn3B2RS91 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rrn3B2RS91 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rrn3B2RS91 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rrn3B2RS91 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rrn3B2RS91 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rrn3B2RS91 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rrn3B2RS91 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rrn3B2RS91 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rrn3B2RS91 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rrn3B2RS91 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rrn3B2RS91 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rrn3B2RS91 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rrn3B2RS91 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rrn3B2RS91 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rrn3B2RS91 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rrn3B2RS91 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rrn3B2RS91 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rrn3B2RS91 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rrn3B2RS91 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rrn3B2RS91 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rrn3B2RS91 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rrn3B2RS91 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rrn3B2RS91 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rrn3B2RS91 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rrn3B2RS91 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rrn3B2RS91 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Rrn3B2RS91 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Rrn3B2RS91 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rrn3B2RS91 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rrn3B2RS91 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rrn3B2RS91 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rrn3B2RS91 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rrn3B2RS91 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rrn3B2RS91 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rrn3B2RS91 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rrn3B2RS91 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rrn3B2RS91 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rrn3B2RS91 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Rrn3B2RS91 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rrn3B2RS91 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Rrn3B2RS91 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rrn3B2RS91 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rrn3B2RS91 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rrn3B2RS91 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rrn3B2RS91 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rrn3B2RS91 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rrn3B2RS91 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rrn3B2RS91 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rrn3B2RS91 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rrn3B2RS91 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
Rrn3B2RS91 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rrn3B2RS91 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rrn3B2RS91 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rrn3B2RS91 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rrn3B2RS91 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rrn3B2RS91 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rrn3B2RS91 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rrn3B2RS91 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rrn3B2RS91 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rrn3B2RS91 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rrn3B2RS91 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rrn3B2RS91 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rrn3B2RS91 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rrn3B2RS91 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rrn3B2RS91 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rrn3B2RS91 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rrn3B2RS91 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rrn3B2RS91 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rrn3B2RS91 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rrn3B2RS91 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rrn3B2RS91 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Rrn3B2RS91 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rrn3B2RS91 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rrn3B2RS91 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rrn3B2RS91 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rrn3B2RS91 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rrn3B2RS91 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rrn3B2RS91 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rrn3B2RS91 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rrn3B2RS91 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rrn3B2RS91 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rrn3B2RS91 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rrn3B2RS91 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rrn3B2RS91 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rrn3B2RS91 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rrn3B2RS91 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rrn3B2RS91 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rrn3B2RS91 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rrn3B2RS91 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rrn3B2RS91 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rrn3B2RS91 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rrn3B2RS91 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rrn3B2RS91 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rrn3B2RS91 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rrn3B2RS91 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms