Protein–RNA interactions for Protein: A2AGX3

Prdm11, PR domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm11A2AGX3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Prdm11A2AGX3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Prdm11A2AGX3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Prdm11A2AGX3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Prdm11A2AGX3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Prdm11A2AGX3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Prdm11A2AGX3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Prdm11A2AGX3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Prdm11A2AGX3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Prdm11A2AGX3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Prdm11A2AGX3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Prdm11A2AGX3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Prdm11A2AGX3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Prdm11A2AGX3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Prdm11A2AGX3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Prdm11A2AGX3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Prdm11A2AGX3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Prdm11A2AGX3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Prdm11A2AGX3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Prdm11A2AGX3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Prdm11A2AGX3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Prdm11A2AGX3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Prdm11A2AGX3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Prdm11A2AGX3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Prdm11A2AGX3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Prdm11A2AGX3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Prdm11A2AGX3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Prdm11A2AGX3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Prdm11A2AGX3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Prdm11A2AGX3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Prdm11A2AGX3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Prdm11A2AGX3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Prdm11A2AGX3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Prdm11A2AGX3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Prdm11A2AGX3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Prdm11A2AGX3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Prdm11A2AGX3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Prdm11A2AGX3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Prdm11A2AGX3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Prdm11A2AGX3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Prdm11A2AGX3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Prdm11A2AGX3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Prdm11A2AGX3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Prdm11A2AGX3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Prdm11A2AGX3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Prdm11A2AGX3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Prdm11A2AGX3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Prdm11A2AGX3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Prdm11A2AGX3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Prdm11A2AGX3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Prdm11A2AGX3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Prdm11A2AGX3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Prdm11A2AGX3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Prdm11A2AGX3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Prdm11A2AGX3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Prdm11A2AGX3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Prdm11A2AGX3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Prdm11A2AGX3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Prdm11A2AGX3 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Prdm11A2AGX3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Prdm11A2AGX3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Prdm11A2AGX3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Prdm11A2AGX3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Prdm11A2AGX3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Prdm11A2AGX3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Prdm11A2AGX3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Prdm11A2AGX3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Prdm11A2AGX3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Prdm11A2AGX3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Prdm11A2AGX3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Prdm11A2AGX3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Prdm11A2AGX3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Prdm11A2AGX3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Prdm11A2AGX3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Prdm11A2AGX3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Prdm11A2AGX3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Prdm11A2AGX3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Prdm11A2AGX3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Prdm11A2AGX3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Prdm11A2AGX3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Prdm11A2AGX3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Prdm11A2AGX3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Prdm11A2AGX3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Prdm11A2AGX3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Prdm11A2AGX3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Prdm11A2AGX3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Prdm11A2AGX3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Prdm11A2AGX3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Prdm11A2AGX3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Prdm11A2AGX3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Prdm11A2AGX3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Prdm11A2AGX3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Prdm11A2AGX3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Prdm11A2AGX3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Prdm11A2AGX3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Prdm11A2AGX3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Prdm11A2AGX3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Prdm11A2AGX3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Prdm11A2AGX3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Prdm11A2AGX3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms