Protein–RNA interactions for Protein: A2AGT5

Ckap5, Cytoskeleton-associated protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap5A2AGT5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ckap5A2AGT5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ckap5A2AGT5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ckap5A2AGT5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ckap5A2AGT5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ckap5A2AGT5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ckap5A2AGT5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ckap5A2AGT5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ckap5A2AGT5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ckap5A2AGT5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ckap5A2AGT5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ckap5A2AGT5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ckap5A2AGT5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ckap5A2AGT5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ckap5A2AGT5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ckap5A2AGT5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ckap5A2AGT5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ckap5A2AGT5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ckap5A2AGT5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ckap5A2AGT5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ckap5A2AGT5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ckap5A2AGT5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ckap5A2AGT5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ckap5A2AGT5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ckap5A2AGT5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ckap5A2AGT5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ckap5A2AGT5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ckap5A2AGT5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ckap5A2AGT5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ckap5A2AGT5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ckap5A2AGT5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ckap5A2AGT5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ckap5A2AGT5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ckap5A2AGT5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ckap5A2AGT5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ckap5A2AGT5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ckap5A2AGT5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ckap5A2AGT5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ckap5A2AGT5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ckap5A2AGT5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ckap5A2AGT5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ckap5A2AGT5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ckap5A2AGT5 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ckap5A2AGT5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ckap5A2AGT5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ckap5A2AGT5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ckap5A2AGT5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ckap5A2AGT5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ckap5A2AGT5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ckap5A2AGT5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ckap5A2AGT5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ckap5A2AGT5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ckap5A2AGT5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ckap5A2AGT5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ckap5A2AGT5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ckap5A2AGT5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ckap5A2AGT5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ckap5A2AGT5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ckap5A2AGT5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ckap5A2AGT5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ckap5A2AGT5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ckap5A2AGT5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ckap5A2AGT5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ckap5A2AGT5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ckap5A2AGT5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ckap5A2AGT5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ckap5A2AGT5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ckap5A2AGT5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ckap5A2AGT5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ckap5A2AGT5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ckap5A2AGT5 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ckap5A2AGT5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ckap5A2AGT5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ckap5A2AGT5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ckap5A2AGT5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ckap5A2AGT5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ckap5A2AGT5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ckap5A2AGT5 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ckap5A2AGT5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ckap5A2AGT5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ckap5A2AGT5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ckap5A2AGT5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ckap5A2AGT5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ckap5A2AGT5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ckap5A2AGT5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ckap5A2AGT5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ckap5A2AGT5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ckap5A2AGT5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ckap5A2AGT5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ckap5A2AGT5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ckap5A2AGT5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ckap5A2AGT5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ckap5A2AGT5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ckap5A2AGT5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ckap5A2AGT5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ckap5A2AGT5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ckap5A2AGT5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ckap5A2AGT5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ckap5A2AGT5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ckap5A2AGT5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9 ms