Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Frmpd4A2AFR3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Frmpd4A2AFR3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Frmpd4A2AFR3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Frmpd4A2AFR3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Frmpd4A2AFR3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Frmpd4A2AFR3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Frmpd4A2AFR3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Frmpd4A2AFR3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Frmpd4A2AFR3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Frmpd4A2AFR3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Frmpd4A2AFR3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Frmpd4A2AFR3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Frmpd4A2AFR3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Frmpd4A2AFR3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Frmpd4A2AFR3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Frmpd4A2AFR3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Frmpd4A2AFR3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Frmpd4A2AFR3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Frmpd4A2AFR3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Frmpd4A2AFR3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Frmpd4A2AFR3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Frmpd4A2AFR3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Frmpd4A2AFR3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Frmpd4A2AFR3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Frmpd4A2AFR3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Frmpd4A2AFR3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Frmpd4A2AFR3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Frmpd4A2AFR3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Frmpd4A2AFR3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Frmpd4A2AFR3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Frmpd4A2AFR3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Frmpd4A2AFR3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Frmpd4A2AFR3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Frmpd4A2AFR3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Frmpd4A2AFR3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Frmpd4A2AFR3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Frmpd4A2AFR3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Frmpd4A2AFR3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Frmpd4A2AFR3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Frmpd4A2AFR3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Frmpd4A2AFR3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Frmpd4A2AFR3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Frmpd4A2AFR3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Frmpd4A2AFR3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Frmpd4A2AFR3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Frmpd4A2AFR3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Frmpd4A2AFR3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Frmpd4A2AFR3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Frmpd4A2AFR3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Frmpd4A2AFR3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Frmpd4A2AFR3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Frmpd4A2AFR3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Frmpd4A2AFR3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Frmpd4A2AFR3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Frmpd4A2AFR3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Frmpd4A2AFR3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Frmpd4A2AFR3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Frmpd4A2AFR3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Frmpd4A2AFR3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Frmpd4A2AFR3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Frmpd4A2AFR3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Frmpd4A2AFR3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Frmpd4A2AFR3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Frmpd4A2AFR3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Frmpd4A2AFR3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Frmpd4A2AFR3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
Frmpd4A2AFR3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
Frmpd4A2AFR3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Frmpd4A2AFR3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Frmpd4A2AFR3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Frmpd4A2AFR3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Frmpd4A2AFR3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Frmpd4A2AFR3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Frmpd4A2AFR3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Frmpd4A2AFR3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Frmpd4A2AFR3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Frmpd4A2AFR3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Frmpd4A2AFR3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Frmpd4A2AFR3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Frmpd4A2AFR3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Frmpd4A2AFR3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Frmpd4A2AFR3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Frmpd4A2AFR3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Frmpd4A2AFR3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Frmpd4A2AFR3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Frmpd4A2AFR3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Frmpd4A2AFR3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Frmpd4A2AFR3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Frmpd4A2AFR3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Frmpd4A2AFR3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Frmpd4A2AFR3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Frmpd4A2AFR3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Frmpd4A2AFR3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Frmpd4A2AFR3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Frmpd4A2AFR3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Frmpd4A2AFR3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Frmpd4A2AFR3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Frmpd4A2AFR3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Frmpd4A2AFR3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms