Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LHF2

Vsig10l2, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 10-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsig10l2A0A140LHF2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vsig10l2A0A140LHF2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vsig10l2A0A140LHF2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Vsig10l2A0A140LHF2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Vsig10l2A0A140LHF2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Vsig10l2A0A140LHF2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Vsig10l2A0A140LHF2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Vsig10l2A0A140LHF2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vsig10l2A0A140LHF2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vsig10l2A0A140LHF2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vsig10l2A0A140LHF2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vsig10l2A0A140LHF2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vsig10l2A0A140LHF2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vsig10l2A0A140LHF2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vsig10l2A0A140LHF2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vsig10l2A0A140LHF2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vsig10l2A0A140LHF2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vsig10l2A0A140LHF2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vsig10l2A0A140LHF2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vsig10l2A0A140LHF2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vsig10l2A0A140LHF2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Vsig10l2A0A140LHF2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vsig10l2A0A140LHF2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vsig10l2A0A140LHF2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vsig10l2A0A140LHF2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vsig10l2A0A140LHF2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vsig10l2A0A140LHF2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Vsig10l2A0A140LHF2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vsig10l2A0A140LHF2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Vsig10l2A0A140LHF2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vsig10l2A0A140LHF2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vsig10l2A0A140LHF2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vsig10l2A0A140LHF2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vsig10l2A0A140LHF2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vsig10l2A0A140LHF2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vsig10l2A0A140LHF2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vsig10l2A0A140LHF2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vsig10l2A0A140LHF2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vsig10l2A0A140LHF2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vsig10l2A0A140LHF2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Vsig10l2A0A140LHF2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vsig10l2A0A140LHF2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vsig10l2A0A140LHF2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vsig10l2A0A140LHF2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vsig10l2A0A140LHF2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vsig10l2A0A140LHF2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vsig10l2A0A140LHF2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vsig10l2A0A140LHF2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vsig10l2A0A140LHF2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vsig10l2A0A140LHF2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vsig10l2A0A140LHF2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vsig10l2A0A140LHF2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vsig10l2A0A140LHF2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vsig10l2A0A140LHF2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vsig10l2A0A140LHF2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vsig10l2A0A140LHF2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vsig10l2A0A140LHF2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Vsig10l2A0A140LHF2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vsig10l2A0A140LHF2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vsig10l2A0A140LHF2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vsig10l2A0A140LHF2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vsig10l2A0A140LHF2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vsig10l2A0A140LHF2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vsig10l2A0A140LHF2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vsig10l2A0A140LHF2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vsig10l2A0A140LHF2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vsig10l2A0A140LHF2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vsig10l2A0A140LHF2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vsig10l2A0A140LHF2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vsig10l2A0A140LHF2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vsig10l2A0A140LHF2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vsig10l2A0A140LHF2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vsig10l2A0A140LHF2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vsig10l2A0A140LHF2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vsig10l2A0A140LHF2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vsig10l2A0A140LHF2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Vsig10l2A0A140LHF2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vsig10l2A0A140LHF2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vsig10l2A0A140LHF2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vsig10l2A0A140LHF2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Vsig10l2A0A140LHF2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vsig10l2A0A140LHF2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vsig10l2A0A140LHF2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vsig10l2A0A140LHF2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vsig10l2A0A140LHF2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vsig10l2A0A140LHF2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vsig10l2A0A140LHF2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Vsig10l2A0A140LHF2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Vsig10l2A0A140LHF2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Vsig10l2A0A140LHF2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Vsig10l2A0A140LHF2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Vsig10l2A0A140LHF2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Vsig10l2A0A140LHF2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Vsig10l2A0A140LHF2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vsig10l2A0A140LHF2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Vsig10l2A0A140LHF2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vsig10l2A0A140LHF2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vsig10l2A0A140LHF2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vsig10l2A0A140LHF2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vsig10l2A0A140LHF2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms