Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 RN7SKP115-201ENST00000363177 317 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ARL2-SNX15V9GYD0 RNA5SP510-201ENST00000364697 99 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ARL2-SNX15V9GYD0 CARD16-202ENST00000375706 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
ARL2-SNX15V9GYD0 RNU1-44P-201ENST00000384453 163 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ARL2-SNX15V9GYD0 AL590762.2-201ENST00000395798 571 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ARL2-SNX15V9GYD0 DEFB113-201ENST00000398718 249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
ARL2-SNX15V9GYD0 AC009804.1-201ENST00000400949 179 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ARL2-SNX15V9GYD0 PRR21-201ENST00000408934 1170 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
ARL2-SNX15V9GYD0 TBCAP2-201ENST00000416175 326 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ARL2-SNX15V9GYD0 CENPIP1-201ENST00000425713 902 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ARL2-SNX15V9GYD0 AC068481.1-202ENST00000428379 555 ntTSL 4 BASIC3.64□□□□□ -1.83
ARL2-SNX15V9GYD0 RPL23AP25-201ENST00000430973 463 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ARL2-SNX15V9GYD0 AC008278.2-201ENST00000438178 409 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
ARL2-SNX15V9GYD0 AL355613.1-201ENST00000451856 480 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
ARL2-SNX15V9GYD0 AC097484.1-201ENST00000471148 389 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ARL2-SNX15V9GYD0 APOPT1-204ENST00000473127 739 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
ARL2-SNX15V9GYD0 AC090013.1-201ENST00000485147 480 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ARL2-SNX15V9GYD0 CLEC19A-204ENST00000493231 557 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
ARL2-SNX15V9GYD0 RPS6P4-201ENST00000494693 758 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ARL2-SNX15V9GYD0 AC008592.2-201ENST00000506070 571 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
ARL2-SNX15V9GYD0 AC097103.1-201ENST00000512398 273 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
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ARL2-SNX15V9GYD0 AC022826.1-201ENST00000519383 805 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ARL2-SNX15V9GYD0 AC021242.2-201ENST00000522765 454 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
ARL2-SNX15V9GYD0 AC087783.1-201ENST00000527135 564 ntTSL 4 BASIC3.64□□□□□ -1.83
ARL2-SNX15V9GYD0 OR7E128P-201ENST00000532736 1024 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ARL2-SNX15V9GYD0 AC124068.1-201ENST00000563131 678 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ARL2-SNX15V9GYD0 AC007601.2-201ENST00000566957 502 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
ARL2-SNX15V9GYD0 AC009139.2-201ENST00000569032 566 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
ARL2-SNX15V9GYD0 AC129507.1-204ENST00000573601 503 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
ARL2-SNX15V9GYD0 AP005119.2-201ENST00000579735 1105 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ARL2-SNX15V9GYD0 AL499605.1-201ENST00000604628 403 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ARL2-SNX15V9GYD0 CASP1-217ENST00000640184 327 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
ARL2-SNX15V9GYD0 NUF2-202ENST00000367900 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC02471-203ENST00000641941 4752 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ARL2-SNX15V9GYD0 TEX26-201ENST00000380473 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
ARL2-SNX15V9GYD0 WDR89-201ENST00000267522 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
ARL2-SNX15V9GYD0 INTS6-220ENST00000497989 3022 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
ARL2-SNX15V9GYD0 AC018529.3-201ENST00000624212 2254 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ARL2-SNX15V9GYD0 PPIP5K2-201ENST00000321521 15407 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC9B1-202ENST00000394789 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
ARL2-SNX15V9GYD0 TBC1D31-210ENST00000521676 3256 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
ARL2-SNX15V9GYD0 PPP1R9A-208ENST00000456331 10090 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
ARL2-SNX15V9GYD0 VDAC3-201ENST00000022615 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
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ARL2-SNX15V9GYD0 IL1RL1-201ENST00000233954 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
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ARL2-SNX15V9GYD0 C8orf22-202ENST00000399653 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
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ARL2-SNX15V9GYD0 IFITM8P-201ENST00000522529 394 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
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ARL2-SNX15V9GYD0 KIRREL3-AS2-201ENST00000532988 492 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
ARL2-SNX15V9GYD0 AC012555.2-201ENST00000549448 413 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
ARL2-SNX15V9GYD0 AL138974.1-201ENST00000551227 741 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
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ARL2-SNX15V9GYD0 AL359237.1-202ENST00000556168 487 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
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ARL2-SNX15V9GYD0 AC010551.2-201ENST00000569200 416 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
ARL2-SNX15V9GYD0 TTN-AS1-226ENST00000588716 604 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
ARL2-SNX15V9GYD0 TTN-AS1-237ENST00000590743 812 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
ARL2-SNX15V9GYD0 OR7A5-202ENST00000594432 1029 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
ARL2-SNX15V9GYD0 AC008638.3-201ENST00000603341 463 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ARL2-SNX15V9GYD0 AL591926.8-201ENST00000616876 211 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ARL2-SNX15V9GYD0 AC074276.2-201ENST00000619891 348 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ARL2-SNX15V9GYD0 WWOX-217ENST00000620008 450 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
ARL2-SNX15V9GYD0 AL356121.2-201ENST00000624715 780 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ARL2-SNX15V9GYD0 AC072062.1-209ENST00000627336 772 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
ARL2-SNX15V9GYD0 GLIPR1L2-202ENST00000378692 1903 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
ARL2-SNX15V9GYD0 FLJ46284-201ENST00000504861 3421 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
ARL2-SNX15V9GYD0 PHC3-215ENST00000495893 12666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
ARL2-SNX15V9GYD0 KIF3A-203ENST00000403231 2181 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
ARL2-SNX15V9GYD0 CYP4Z2P-201ENST00000423332 1512 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
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