Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 SLCO1C1-208ENST00000545102 2868 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CTNNA3Q9UI47 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CTNNA3Q9UI47 AC106895.2-201ENST00000511291 1824 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CTNNA3Q9UI47 CFAP221-215ENST00000598644 1532 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CTNNA3Q9UI47 EHBP1-202ENST00000405015 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CTNNA3Q9UI47 SMG1P4-204ENST00000523028 4131 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CTNNA3Q9UI47 NKIRAS1-209ENST00000614374 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CTNNA3Q9UI47 IL5-201ENST00000231454 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CTNNA3Q9UI47 AC135895.1-201ENST00000360528 1058 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CTNNA3Q9UI47 AL672167.2-201ENST00000377164 879 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CTNNA3Q9UI47 OR6C64P-201ENST00000419708 825 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CTNNA3Q9UI47 AC079790.1-201ENST00000420365 507 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CTNNA3Q9UI47 AC009478.1-201ENST00000429816 562 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CTNNA3Q9UI47 LINC02476-202ENST00000431071 559 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CTNNA3Q9UI47 SCAND3P1-201ENST00000439854 1060 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CTNNA3Q9UI47 AC073052.1-201ENST00000440417 714 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CTNNA3Q9UI47 AC114877.1-201ENST00000446601 582 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CTNNA3Q9UI47 AL356981.1-201ENST00000454879 684 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CTNNA3Q9UI47 THOC7-AS1-201ENST00000468961 673 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CTNNA3Q9UI47 RN7SL591P-201ENST00000496150 292 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CTNNA3Q9UI47 AC104071.1-201ENST00000505636 602 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CTNNA3Q9UI47 AC084024.3-201ENST00000520598 562 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CTNNA3Q9UI47 AL390334.1-201ENST00000556395 450 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CTNNA3Q9UI47 MIR4330-201ENST00000579077 105 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CTNNA3Q9UI47 AC011507.1-201ENST00000585364 567 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CTNNA3Q9UI47 FAM25E-202ENST00000608562 189 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CTNNA3Q9UI47 AC243960.7-201ENST00000623532 707 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CTNNA3Q9UI47 AC087821.1-201ENST00000623639 567 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CTNNA3Q9UI47 C2orf83-206ENST00000642055 453 ntAPPRIS P3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CTNNA3Q9UI47 AC021242.1-201ENST00000507315 2035 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 DNAH8-201ENST00000327475 14360 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 SMARCA2-201ENST00000302401 2242 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 DOCK9-207ENST00000442173 7643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 GBA3-205ENST00000511446 2018 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 ECT2L-201ENST00000367682 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 MAPK10-236ENST00000638313 3971 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 AK9-204ENST00000424296 6326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 FGF13-202ENST00000315930 19519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 OR2D2-201ENST00000299459 1110 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 RNU6-673P-201ENST00000365084 104 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 SNORA81-201ENST00000408493 178 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 LINC00364-201ENST00000415120 611 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 OR13Z1P-201ENST00000416141 834 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 DPH5-204ENST00000427040 609 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 EIF2S2P3-201ENST00000428356 999 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 VDAC1P6-201ENST00000430062 855 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 AL713851.1-201ENST00000438753 918 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 AP001434.1-201ENST00000444977 287 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 Z73495.1-201ENST00000444982 147 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 AC025423.4-201ENST00000553141 785 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 EDDM3DP-201ENST00000554692 434 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 LINC02188-201ENST00000562064 550 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 AC005692.2-201ENST00000566521 596 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 LINC00511-212ENST00000581183 657 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 DARS-AS1-211ENST00000595061 720 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 AC112694.2-201ENST00000623697 768 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 RNF123-214ENST00000629802 207 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 AC002384.2-201ENST00000636036 790 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 SP110-202ENST00000258382 2080 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 ANXA1-201ENST00000257497 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 FTX-210ENST00000603037 8347 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 OTOGL-204ENST00000547103 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 BMPR1B-202ENST00000394931 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 FABP4-201ENST00000256104 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 OR10A5-201ENST00000299454 1054 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 OR6X1-201ENST00000327930 1058 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 RPS4XP9-201ENST00000405151 780 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 OR2AH1P-201ENST00000425717 928 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 AL354714.4-201ENST00000427339 575 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 RBMY2QP-201ENST00000429799 1147 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 AC092162.1-201ENST00000432828 434 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 AC092159.1-201ENST00000433724 493 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 PRPF38AP2-201ENST00000438179 851 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 AC114982.2-201ENST00000461396 358 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 AL035454.1-201ENST00000470758 433 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 BTG4P1-201ENST00000510421 183 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 AC083923.2-203ENST00000520512 372 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 THUMPD3-AS1-215ENST00000521609 793 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 HMMR-AS1-202ENST00000521666 800 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 RGS5-219ENST00000528019 512 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 MIR4697-201ENST00000582977 78 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 AC011487.3-201ENST00000593607 453 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 AC007193.1-201ENST00000599645 448 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 AC016252.1-201ENST00000609721 474 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 AC091953.3-201ENST00000623220 236 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 DDHD2-202ENST00000517385 4113 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 ATP2C1-205ENST00000504381 3498 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 ZNF568-214ENST00000616085 3542 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 RGS5-212ENST00000618415 5812 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 PATJ-213ENST00000613764 4172 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 INTS6P1-201ENST00000504674 2530 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CTNNA3Q9UI47 UGT2A1-203ENST00000503640 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.8 ms