Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR81

ARHGEF3, Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 526 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3Q9NR81 LINC01619-207ENST00000551843 2205 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
ARHGEF3Q9NR81 KMT2D-201ENST00000301067 19419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ARHGEF3Q9NR81 PPEF1-201ENST00000349874 2687 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ARHGEF3Q9NR81 AP001605.1-201ENST00000420186 2603 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
ARHGEF3Q9NR81 SEC31A-226ENST00000508479 3397 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ARHGEF3Q9NR81 EPS8-209ENST00000542903 1858 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ARHGEF3Q9NR81 CPNE4-214ENST00000617767 3556 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ARHGEF3Q9NR81 LINC02401-201ENST00000550185 3059 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
ARHGEF3Q9NR81 UGT2B17-201ENST00000317746 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
ARHGEF3Q9NR81 RYR3-209ENST00000634418 15078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ARHGEF3Q9NR81 HIST1H2BD-201ENST00000289316 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
ARHGEF3Q9NR81 GKN1-201ENST00000377938 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
ARHGEF3Q9NR81 AL355615.1-201ENST00000406187 641 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ARHGEF3Q9NR81 AL390774.1-201ENST00000411924 246 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ARHGEF3Q9NR81 AL121878.1-201ENST00000418638 859 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ARHGEF3Q9NR81 NENFP1-201ENST00000419476 466 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ARHGEF3Q9NR81 MTCO2P21-201ENST00000419780 677 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ARHGEF3Q9NR81 C9orf57-202ENST00000424431 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
ARHGEF3Q9NR81 TCEAL3-AS1-201ENST00000424887 361 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ARHGEF3Q9NR81 AL606490.7-201ENST00000433136 191 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ARHGEF3Q9NR81 AC015983.1-201ENST00000441577 373 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ARHGEF3Q9NR81 AC245517.2-201ENST00000442890 346 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ARHGEF3Q9NR81 LINC01376-204ENST00000449124 626 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ARHGEF3Q9NR81 CBX1P2-201ENST00000453841 458 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ARHGEF3Q9NR81 AL122001.1-201ENST00000457027 370 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ARHGEF3Q9NR81 SNORD11.1-201ENST00000459482 85 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ARHGEF3Q9NR81 AL603882.1-201ENST00000463059 681 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ARHGEF3Q9NR81 AC008379.1-201ENST00000463655 464 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ARHGEF3Q9NR81 AC087071.2-201ENST00000483283 575 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ARHGEF3Q9NR81 AC091544.1-201ENST00000484702 348 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ARHGEF3Q9NR81 AC073610.1-201ENST00000489971 396 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ARHGEF3Q9NR81 RN7SL447P-201ENST00000494711 245 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ARHGEF3Q9NR81 HMGB1P3-201ENST00000502802 616 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ARHGEF3Q9NR81 AC021106.1-201ENST00000509020 1058 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ARHGEF3Q9NR81 AC024132.3-201ENST00000513616 649 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ARHGEF3Q9NR81 LINC02497-201ENST00000515292 507 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ARHGEF3Q9NR81 SEPT10P1-201ENST00000517342 1162 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ARHGEF3Q9NR81 AC090424.1-201ENST00000535243 736 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ARHGEF3Q9NR81 AL121594.2-201ENST00000541658 472 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ARHGEF3Q9NR81 AC126177.5-201ENST00000549599 178 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ARHGEF3Q9NR81 AC009852.2-201ENST00000567898 485 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ARHGEF3Q9NR81 AC008752.1-201ENST00000590046 408 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ARHGEF3Q9NR81 BNIP3P24-201ENST00000593398 557 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ARHGEF3Q9NR81 AL513327.3-201ENST00000602618 469 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ARHGEF3Q9NR81 AC133644.2-201ENST00000608142 540 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
ARHGEF3Q9NR81 CACNB4-243ENST00000637217 8188 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ARHGEF3Q9NR81 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
ARHGEF3Q9NR81 CDON-206ENST00000531738 5803 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
ARHGEF3Q9NR81 KIAA1328-201ENST00000280020 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
ARHGEF3Q9NR81 ELMO1-203ENST00000396045 2524 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
ARHGEF3Q9NR81 SUPT3H-202ENST00000371459 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
ARHGEF3Q9NR81 VNN2-206ENST00000525270 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
ARHGEF3Q9NR81 MFSD4BP1-201ENST00000513330 1552 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ARHGEF3Q9NR81 PPP1R2P3-201ENST00000522232 1991 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ARHGEF3Q9NR81 EDA2R-203ENST00000396050 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ARHGEF3Q9NR81 ETV1-208ENST00000420159 6231 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ARHGEF3Q9NR81 ZNF33A-203ENST00000432900 3994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
ARHGEF3Q9NR81 SSX1-201ENST00000376919 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
ARHGEF3Q9NR81 OR51F1-201ENST00000380383 960 ntAPPRIS P5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ARHGEF3Q9NR81 SIRPD-201ENST00000381621 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ARHGEF3Q9NR81 KRTAP22-2-201ENST00000382830 293 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ARHGEF3Q9NR81 SNORA70.6-201ENST00000383934 134 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ARHGEF3Q9NR81 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ARHGEF3Q9NR81 RNY3P9-201ENST00000384727 106 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ARHGEF3Q9NR81 AL590609.3-201ENST00000411815 210 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ARHGEF3Q9NR81 AL445213.1-201ENST00000412589 747 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ARHGEF3Q9NR81 TEX41-203ENST00000420472 765 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ARHGEF3Q9NR81 PTP4A1P7-201ENST00000423476 514 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ARHGEF3Q9NR81 LINC00502-201ENST00000423621 445 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ARHGEF3Q9NR81 AC006041.1-201ENST00000425322 328 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ARHGEF3Q9NR81 AC092648.1-201ENST00000425870 423 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ARHGEF3Q9NR81 RPL12P28-201ENST00000430852 489 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ARHGEF3Q9NR81 AL035246.1-201ENST00000433554 1255 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ARHGEF3Q9NR81 AL137076.1-201ENST00000441046 551 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ARHGEF3Q9NR81 LINC00448-202ENST00000448411 433 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ARHGEF3Q9NR81 EIF4EBP2P1-201ENST00000450009 343 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ARHGEF3Q9NR81 RNU1-88P-201ENST00000459274 128 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ARHGEF3Q9NR81 RPL21P18-201ENST00000469899 480 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ARHGEF3Q9NR81 SLC9A9-AS1-201ENST00000479030 518 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ARHGEF3Q9NR81 OR5H3P-201ENST00000502817 919 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ARHGEF3Q9NR81 AC008427.1-201ENST00000503102 655 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ARHGEF3Q9NR81 LINC02271-202ENST00000506379 596 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ARHGEF3Q9NR81 GAPDHP62-201ENST00000515313 990 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ARHGEF3Q9NR81 AP001207.2-201ENST00000519490 539 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ARHGEF3Q9NR81 AC103855.1-201ENST00000525926 564 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ARHGEF3Q9NR81 SNHG1-204ENST00000537068 629 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ARHGEF3Q9NR81 CDKN3-206ENST00000541304 1070 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ARHGEF3Q9NR81 LINC01619-209ENST00000552277 571 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ARHGEF3Q9NR81 MTCYBP27-201ENST00000555160 670 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ARHGEF3Q9NR81 AC106028.2-201ENST00000555325 464 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ARHGEF3Q9NR81 CSNK1A1P1-202ENST00000563423 981 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ARHGEF3Q9NR81 OR1F2P-201ENST00000570470 933 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ARHGEF3Q9NR81 AC217774.1-201ENST00000578936 517 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ARHGEF3Q9NR81 AP005242.1-201ENST00000583946 467 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ARHGEF3Q9NR81 AC011824.3-201ENST00000585093 563 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ARHGEF3Q9NR81 AC040904.1-201ENST00000590850 223 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ARHGEF3Q9NR81 AL022067.1-201ENST00000602426 454 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ARHGEF3Q9NR81 AL160237.3-201ENST00000604114 1013 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ARHGEF3Q9NR81 OR7A19P-201ENST00000608051 733 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ARHGEF3Q9NR81 LAMTOR5-AS1-217ENST00000608152 407 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.4 ms