Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 AL357832.1-201ENST00000427460 420 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 RPL23AP4-201ENST00000427757 463 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 ARPP21-215ENST00000432682 1015 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 AF127577.2-201ENST00000436429 824 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 AC068489.1-201ENST00000453706 261 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 RPS4XP12-201ENST00000461747 709 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 AC124242.1-202ENST00000499554 1052 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 AC010468.3-201ENST00000508225 458 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 NSMCE2-206ENST00000519010 848 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 AC073862.1-201ENST00000537998 409 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 AC091814.1-201ENST00000545258 719 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 AC110023.1-201ENST00000554318 457 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 PWRN3-201ENST00000566797 849 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 TMF1P1-201ENST00000576058 373 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 APOC2-203ENST00000590360 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 Z98949.1-211ENST00000596813 773 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 AC100827.5-201ENST00000615883 426 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 AL445528.2-201ENST00000620582 470 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 AC103798.2-201ENST00000624292 632 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 ZNF429-209ENST00000618549 1889 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 AC092747.4-201ENST00000620519 1861 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 CHRM2-203ENST00000445907 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 AC133552.1-201ENST00000569988 4007 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 LMNTD1-207ENST00000539744 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 AC104623.2-202ENST00000623477 4002 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 RBMS3-202ENST00000383766 2757 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 AL359715.3-201ENST00000569267 2123 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 AC115220.1-201ENST00000330020 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 GPX8-201ENST00000296734 3245 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 AC093849.1-201ENST00000563631 2209 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 SEC24D-211ENST00000511481 2626 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 RAD1P1-201ENST00000231383 813 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 RN7SKP103-201ENST00000363848 320 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 RNU1-146P-201ENST00000364015 165 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 RGS10-201ENST00000369101 738 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 PPIAP9-201ENST00000403866 498 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 Z80107.2-201ENST00000445127 392 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 AL512328.1-202ENST00000452640 850 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 DNAJB5P1-201ENST00000454004 806 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 CFHR2-203ENST00000476712 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 LINC01612-201ENST00000504509 469 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 RPL37-204ENST00000508493 553 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 AC091912.1-201ENST00000511351 248 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 AC025524.2-211ENST00000519990 1173 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 ARL6IP1P3-201ENST00000524544 560 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 AP000676.2-201ENST00000529711 301 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 AP002373.2-201ENST00000541631 1060 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 CR383656.14-201ENST00000551951 406 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 AC124784.1-201ENST00000552426 571 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 AC087477.4-201ENST00000560586 542 ntTSL 4 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 AC021483.2-201ENST00000567415 758 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 AC046158.2-201ENST00000568764 707 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 AC015912.1-201ENST00000574826 538 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 AC008555.3-201ENST00000603717 442 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 AC009597.2-201ENST00000604659 592 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 STATH-208ENST00000615994 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 AL445493.3-201ENST00000619568 477 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 AP006248.3-201ENST00000623580 594 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 AP001784.1-201ENST00000624107 428 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 AC093495.1-217ENST00000627385 428 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 FRG1EP-201ENST00000634469 770 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 PWRN2-202ENST00000567246 4295 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 AL121950.1-201ENST00000624993 2077 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 CYP3A7-CYP3A51P-202ENST00000620220 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 LIX1-AS1-201ENST00000504578 1793 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 AC089984.1-201ENST00000552780 1431 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 SLITRK4-202ENST00000356928 3074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 OR10G4-203ENST00000641722 3301 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 GLRA2-202ENST00000355020 1730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 OR2J3-202ENST00000641151 3297 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 SSMEM1-201ENST00000297819 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 AL133270.1-201ENST00000402635 279 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 AL353692.2-201ENST00000407054 335 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 SNORA79B-201ENST00000410557 148 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 IFNA17-201ENST00000413767 980 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 AC098820.3-201ENST00000414135 976 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 EI24P4-201ENST00000423683 1078 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 LINC01690-201ENST00000424837 576 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 AL450384.1-201ENST00000433526 413 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 KCNIP1-205ENST00000434108 726 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 AL136140.1-201ENST00000436113 473 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 AL772161.1-201ENST00000439130 476 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 ZNF736P6Y-201ENST00000447526 1213 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 KCNMB2-AS1-205ENST00000451742 844 ntTSL 4 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 AC108729.2-201ENST00000476543 840 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 SH3GLB1-202ENST00000482504 1199 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 CD200R1-205ENST00000490004 778 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 MGST2-204ENST00000506797 634 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 AC106806.2-201ENST00000509365 500 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 LINC02483-201ENST00000512043 1143 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 SCARNA20.4-201ENST00000516969 131 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 MS4A6A-210ENST00000529054 1160 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 AC131532.1-201ENST00000555596 519 ntTSL 4 BASIC6.4□□□□□ -1.38
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