Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 AC023421.1-201ENST00000590535 1785 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 ANKRD30A-204ENST00000602533 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 AL607077.1-201ENST00000401718 499 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 AL034374.1-201ENST00000406329 351 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 MIR1182-201ENST00000408363 97 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 AC073136.2-201ENST00000417282 849 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 AC018832.1-201ENST00000428171 566 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 RBMY2QP-201ENST00000429799 1147 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 AL450992.2-201ENST00000434182 506 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 AL161722.2-201ENST00000434731 981 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 AL591719.2-201ENST00000437400 386 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 PA2G4P6-201ENST00000438325 1197 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 MTND6P18-201ENST00000439477 513 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 GABRG3-AS1-201ENST00000439938 970 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 AC099063.2-201ENST00000446360 662 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 AL592431.1-201ENST00000451090 317 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 AL035446.1-201ENST00000455011 453 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 snoU13.20-201ENST00000459180 104 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 AC108161.1-201ENST00000461060 402 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 AC096741.1-201ENST00000472250 846 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 AC092957.1-201ENST00000473299 570 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 PANCR-201ENST00000503456 493 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 AC005674.1-201ENST00000503493 459 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 AC084871.1-201ENST00000508020 628 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 AC022360.1-201ENST00000521058 340 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 CLMN-206ENST00000556441 452 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 LINC00687-203ENST00000558175 696 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 AC020659.1-204ENST00000562920 400 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 AC011447.4-201ENST00000587562 111 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 AL109935.2-201ENST00000587737 395 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 AC092902.2-219ENST00000608488 822 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 AL513314.2-204ENST00000619187 459 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 DARS-AS1-230ENST00000631306 530 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 OBSCN-214ENST00000636875 23907 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 TNRC6B-201ENST00000301923 15958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 ZNF845-201ENST00000458035 4311 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 CYP3A43-203ENST00000342499 1396 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 AJ009632.2-202ENST00000634644 1513 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 FCRL2-203ENST00000368181 1669 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 VPS41-203ENST00000395969 3181 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 SEC24D-211ENST00000511481 2626 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 EYA1-203ENST00000388740 3788 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 CASC19-284ENST00000642142 1868 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 LMNTD1-207ENST00000539744 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 NPM1-203ENST00000393820 1598 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 LINC00862-204ENST00000637098 1400 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 OR8I2-201ENST00000302124 1010 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 OR1L3-201ENST00000304820 1118 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 IKZF3-202ENST00000346243 1296 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 RNA5SP455-201ENST00000365190 119 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 S100G-201ENST00000380200 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 AC034195.1-201ENST00000420000 559 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 AC092570.3-201ENST00000420113 693 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 ANAPC1P1-201ENST00000426186 2145 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 AC092447.2-201ENST00000435487 669 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 PSMD10P3-201ENST00000437000 448 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 IKZF3-212ENST00000439016 1246 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 PARGP1-202ENST00000440803 790 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 MORC1-AS1-201ENST00000480826 564 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 SLC9A9-AS2-201ENST00000490153 327 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 RPS24P16-201ENST00000497294 392 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 AC231760.1-201ENST00000498002 260 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 AF186190.1-201ENST00000517470 480 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 AC013644.1-202ENST00000523166 499 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 AC137590.1-201ENST00000542422 495 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 LINC01859-201ENST00000565584 1024 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 DIAPH2-AS1-204ENST00000579945 974 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 AC024940.4-201ENST00000605507 246 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 MYBPC1-201ENST00000361466 3899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 ROS1-201ENST00000368507 7417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 MUM1L1-202ENST00000357175 4173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 AC131971.1-201ENST00000332881 1482 ntBASIC6.02□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 AL359538.1-201ENST00000453498 1710 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CCDC96Q2M329 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CCDC96Q2M329 RMST-202ENST00000541282 2099 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CCDC96Q2M329 WDR63-201ENST00000294664 2995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CCDC96Q2M329 XKR4-201ENST00000327381 19880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CCDC96Q2M329 DYNC1I2-201ENST00000340296 2589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CCDC96Q2M329 RN7SKP125-201ENST00000410481 302 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CCDC96Q2M329 IFNA17-201ENST00000413767 980 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CCDC96Q2M329 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CCDC96Q2M329 AL353689.2-201ENST00000433837 440 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CCDC96Q2M329 RPL19P16-201ENST00000433839 588 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CCDC96Q2M329 KCNIP1-205ENST00000434108 726 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CCDC96Q2M329 BTBD7P2-201ENST00000441962 620 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CCDC96Q2M329 FHP1-201ENST00000442741 703 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CCDC96Q2M329 EIF2S2P4-201ENST00000461070 984 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CCDC96Q2M329 AP000797.2-201ENST00000475768 606 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CCDC96Q2M329 RN7SL97P-201ENST00000486780 299 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CCDC96Q2M329 AC000372.1-201ENST00000488818 646 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CCDC96Q2M329 UBA52P3-201ENST00000491303 382 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CCDC96Q2M329 RPS12P31-201ENST00000491419 398 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CCDC96Q2M329 AC023424.1-201ENST00000496058 459 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms