Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 OR6K2-201ENST00000359610 975 ntAPPRIS P1 BASIC8.37□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 Y_RNA.77-201ENST00000362962 107 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 SSX5-203ENST00000376923 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 RNA5SP91-201ENST00000390902 119 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 CACNB4-203ENST00000397327 2112 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 AL355300.1-201ENST00000412439 187 ntTSL 3 BASIC8.37□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 SLC9B1P4-201ENST00000421957 1288 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 LINC01674-201ENST00000427446 504 ntTSL 3 BASIC8.37□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 CRIP1P1-201ENST00000427567 185 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 ARF4P4-201ENST00000439608 520 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 RPL36AP39-201ENST00000445859 318 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 AC073072.2-201ENST00000447425 348 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 MACROD2-IT1-201ENST00000448536 665 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC8.37□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 RPS17P11-201ENST00000474297 293 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 SETP6-201ENST00000479329 568 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 MTND2P14-201ENST00000482139 351 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 AC105384.2-201ENST00000508433 640 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 ZCCHC10-207ENST00000509437 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 LINC02113-201ENST00000510302 336 ntTSL 3 BASIC8.37□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 LINC02497-201ENST00000515292 507 ntTSL 3 BASIC8.37□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 AC133065.1-201ENST00000572017 575 ntTSL 3 BASIC8.37□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 AC003991.1-201ENST00000594469 484 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 AC024075.3-201ENST00000601687 453 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 AL513327.3-201ENST00000602618 469 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 Z82195.1-201ENST00000604558 398 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 AL139286.2-201ENST00000606838 396 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 AC131235.4-201ENST00000609288 620 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 TUSC7.1-201ENST00000610969 165 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 Metazoa_SRP.70-201ENST00000612622 273 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 NADK2-211ENST00000617628 744 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 ZNF227-208ENST00000589005 2943 ntTSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 LINC02141-201ENST00000568279 6586 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 XPNPEP3-201ENST00000357137 7988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 ZNF107-205ENST00000613690 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 AC106872.5-201ENST00000508856 1416 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 OR7A5-201ENST00000322301 4216 ntAPPRIS P1 BASIC8.37□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 RNF19BPY-201ENST00000458209 1550 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 CASC19-281ENST00000642118 1554 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 SEC22A-201ENST00000309934 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 AC007998.4-201ENST00000612496 2533 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 ZNF283-201ENST00000324461 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 KRTAP23-1-201ENST00000334160 211 ntAPPRIS P1 BASIC8.36□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 IFNA10-201ENST00000357374 963 ntAPPRIS P1 BASIC8.36□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 OR5B17-201ENST00000357377 946 ntAPPRIS P1 BASIC8.36□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 SNORA64.1-201ENST00000362600 132 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 RNA5SP394-201ENST00000364216 119 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 TYRP1-201ENST00000381136 872 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 RNU6-207P-201ENST00000384137 107 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 HMGB1P20-201ENST00000402555 677 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 SNORA11.3-201ENST00000408471 128 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 LYST-AS1-201ENST00000412098 521 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 AC098872.1-201ENST00000413304 543 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 AC079809.1-201ENST00000415468 276 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 KCNMA1-AS3-201ENST00000418515 701 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 LINC01762-201ENST00000423907 454 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 AP001476.3-201ENST00000429512 415 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 NPM1P25-201ENST00000429734 854 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 AC079807.1-201ENST00000429993 481 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 AC084290.1-201ENST00000434995 374 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 MIR99AHG-205ENST00000435697 716 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 AC073052.1-201ENST00000440417 714 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 AC068631.1-205ENST00000455926 409 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 AC091976.1-201ENST00000458002 448 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 RNU7-125P-201ENST00000458760 62 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 NAA50-206ENST00000493454 964 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 SPTSSB-202ENST00000497137 880 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 AC097535.1-201ENST00000515263 332 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 AC109830.1-202ENST00000515491 860 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 SNORA70.20-201ENST00000516848 126 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 AC025437.2-201ENST00000518103 548 ntTSL 4 BASIC8.36□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 AC087276.4-201ENST00000530042 444 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 PDZD9-203ENST00000537222 1068 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 LINC02327-205ENST00000550990 472 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 EEF1B2P4-201ENST00000551398 348 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 AL390816.1-201ENST00000553990 322 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 AL359219.2-201ENST00000555184 348 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 AC103968.1-201ENST00000557841 573 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 DPPA2P4-201ENST00000563717 878 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 AC009097.1-201ENST00000567077 406 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 AL050403.2-203ENST00000603180 558 ntTSL 4 BASIC8.36□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 AC073648.5-201ENST00000603502 305 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 Metazoa_SRP.43-201ENST00000616394 271 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 AL590410.1-201ENST00000617925 333 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 SNORA11.6-201ENST00000619030 128 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 ARHGAP20-206ENST00000533353 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 ARHGAP21-202ENST00000376410 3526 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 UGDH-205ENST00000506179 3021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 RALYL-211ENST00000523850 1684 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 DSC2-202ENST00000280904 12325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 MYBPC1-209ENST00000547509 3749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 MIPOL1-204ENST00000539062 2389 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 DSC2-201ENST00000251081 4826 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 EEF1A1P30-201ENST00000429708 1315 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.8 ms