Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 YWHAQP9-201ENST00000445891 512 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 LINC00440-201ENST00000446579 734 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 AC117430.1-201ENST00000474711 801 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 AC020900.1-201ENST00000502568 565 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 LINC02196-201ENST00000512838 568 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 HAND2-AS1-235ENST00000515376 951 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 RNA5SP271-201ENST00000516700 88 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 AP001207.3-201ENST00000520268 491 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 AC010306.1-201ENST00000523223 1117 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 ANKRD49-206ENST00000540349 573 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 AP000763.3-201ENST00000542598 334 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 BICD1-206ENST00000551086 423 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 AC016526.2-201ENST00000554225 520 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 AC040918.1-201ENST00000560056 632 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 AC104151.1-201ENST00000563764 323 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 AC007601.2-201ENST00000566957 502 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 AC009097.1-201ENST00000567077 406 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 MRPS21P8-201ENST00000569196 235 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 AP003117.1-201ENST00000602771 554 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 PPATP2-201ENST00000605635 508 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 FAM72A-208ENST00000607379 1139 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 AL161457.2-204ENST00000609241 869 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 SDR42E1P1-201ENST00000611327 477 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 STMN1P1-201ENST00000617809 440 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 AK6-205ENST00000618980 483 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 C8orf59-213ENST00000619594 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 COPS7B-225ENST00000631349 189 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 AP002008.2-205ENST00000637111 1091 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 AL049767.1-202ENST00000637826 242 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 DLG1-213ENST00000443183 2516 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 AC025031.4-201ENST00000621248 3271 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 NSRP1P1-201ENST00000444067 1693 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 FAM205BP-203ENST00000455647 3752 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 AL138820.1-201ENST00000617901 5305 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 BBX-203ENST00000402543 3980 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 RAB23-201ENST00000317483 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 ZMYND11-209ENST00000402736 3950 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 OR2L13-202ENST00000641714 1948 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 PRSS37-201ENST00000350549 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 RNU105B-201ENST00000364478 208 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 CFHR1-202ENST00000367424 1070 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 GPR52-201ENST00000367685 1088 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 TRGV10-201ENST00000390341 512 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 AL078604.1-201ENST00000404609 466 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 MIR1178-201ENST00000408396 91 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 AL512622.1-201ENST00000414106 481 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 AL158827.1-201ENST00000416300 391 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 AC009498.1-201ENST00000419860 541 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 AL512661.1-201ENST00000434586 1253 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 LINC01350-202ENST00000439633 623 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 ATP5LP2-201ENST00000440646 311 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 AL162419.1-201ENST00000440674 873 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 HRAT17-201ENST00000447785 547 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 AC016027.4-201ENST00000450866 277 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 SDC4P-201ENST00000453285 601 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 AC010894.4-201ENST00000454203 457 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 OSTCP1-201ENST00000455507 450 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 OR2A1-AS1-202ENST00000467944 422 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 AC098847.1-201ENST00000473094 348 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 RN7SL717P-201ENST00000478343 297 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 AL035404.1-201ENST00000497982 568 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 AC106895.1-202ENST00000502956 777 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 OR7E99P-201ENST00000505750 922 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 OSMR-AS1-201ENST00000506463 800 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 KHDC1P1-201ENST00000511053 508 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 AC108043.1-201ENST00000512696 574 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
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FOXD4Q12950 AC099520.1-208ENST00000518276 472 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
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FOXD4Q12950 AC078899.1-201ENST00000521432 1185 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 AP003086.3-201ENST00000527030 365 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 AP000753.2-201ENST00000540307 423 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 SDHAF2-208ENST00000543265 438 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 C15orf41-203ENST00000562489 715 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 AC007225.2-201ENST00000562529 256 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 AL390726.5-202ENST00000564800 256 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 PWRN1-208ENST00000567647 561 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 AC122134.1-202ENST00000569111 1201 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 OR7E18P-201ENST00000592589 702 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 Z98949.1-228ENST00000595093 798 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 AC125494.3-201ENST00000602759 455 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 AL138900.3-201ENST00000607010 629 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 AC004921.1-201ENST00000608884 733 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 AL359513.1-201ENST00000614364 557 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 Metazoa_SRP.179-201ENST00000619020 241 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 FAM27E2-201ENST00000619668 403 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 AL023881.1-201ENST00000621088 301 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 PDCD6IPP1-202ENST00000622242 1064 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 MIR6719-201ENST00000622428 87 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 AC097460.3-201ENST00000623099 442 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 AC067852.7-201ENST00000623270 535 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 C8orf89-203ENST00000625134 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 LINC00836-203ENST00000628620 1179 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 LEUTX-202ENST00000638280 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 ANKRD30A-202ENST00000374660 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXD4Q12950 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
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