Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD43

PTPRH, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase H, humanhuman

Predictions only

Length 1,115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRHQ9HD43 AC022098.3-201ENST00000590715 315 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 OR7E18P-201ENST00000592589 702 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 AC073254.1-207ENST00000600482 714 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 AC016957.2-201ENST00000616998 848 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 AC078880.5-201ENST00000617845 421 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 U6.48-201ENST00000618523 106 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 AC005618.4-201ENST00000625053 554 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 AC245427.3-201ENST00000632041 51 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 AC097495.1-201ENST00000637675 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 RUVBL2-214ENST00000640699 153 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 OR52B5P-202ENST00000641118 1110 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 ZNF611-201ENST00000319783 3153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
PTPRHQ9HD43 RAD17-201ENST00000282891 2135 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
PTPRHQ9HD43 DCLRE1A-201ENST00000361384 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
PTPRHQ9HD43 SMG1P6-201ENST00000532337 2930 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
PTPRHQ9HD43 VDAC3-201ENST00000022615 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
PTPRHQ9HD43 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
PTPRHQ9HD43 AC007681.1-201ENST00000604271 3438 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.47
PTPRHQ9HD43 TMEM161BP1-201ENST00000457388 1457 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
PTPRHQ9HD43 HHLA2-209ENST00000489514 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRHQ9HD43 FAM81B-201ENST00000283357 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRHQ9HD43 BMPR1APS1-201ENST00000403332 1598 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRHQ9HD43 TCP11-207ENST00000418521 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRHQ9HD43 AQP9-201ENST00000219919 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRHQ9HD43 AL132640.2-201ENST00000559968 1698 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRHQ9HD43 PSG9-202ENST00000270077 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRHQ9HD43 LIX1-AS1-201ENST00000504578 1793 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRHQ9HD43 OR4K17-201ENST00000315543 1032 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRHQ9HD43 OR14C36-201ENST00000317861 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRHQ9HD43 OR9K1P-201ENST00000326513 941 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRHQ9HD43 LINC01317-201ENST00000366209 779 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRHQ9HD43 OR5L2-201ENST00000378397 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRHQ9HD43 RNU6-354P-201ENST00000383862 107 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRHQ9HD43 RNU6-610P-201ENST00000384264 107 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRHQ9HD43 TRGV5-201ENST00000390344 552 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRHQ9HD43 AC092675.1-201ENST00000409490 561 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRHQ9HD43 AC025946.1-201ENST00000413286 430 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRHQ9HD43 AL365184.1-201ENST00000413801 572 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRHQ9HD43 AC062031.1-201ENST00000414967 747 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRHQ9HD43 AC003659.1-201ENST00000424251 465 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRHQ9HD43 AC011891.1-201ENST00000437088 432 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRHQ9HD43 AC006994.1-201ENST00000438212 839 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRHQ9HD43 AC073465.2-201ENST00000440938 498 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRHQ9HD43 DARS-AS1-206ENST00000446492 488 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRHQ9HD43 AL591363.1-201ENST00000450091 483 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRHQ9HD43 AL606490.1-201ENST00000452266 765 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRHQ9HD43 LINC01014-203ENST00000455307 548 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRHQ9HD43 PSAT1P4-201ENST00000466500 526 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRHQ9HD43 OR2AO1P-201ENST00000476497 403 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRHQ9HD43 MTND3P3-201ENST00000505004 126 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRHQ9HD43 MTCO3P27-201ENST00000514397 196 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRHQ9HD43 RNU6-941P-201ENST00000516346 108 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRHQ9HD43 SCARNA20.4-201ENST00000516969 131 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRHQ9HD43 AC136777.2-201ENST00000522979 358 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRHQ9HD43 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRHQ9HD43 MS4A1-205ENST00000528313 928 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRHQ9HD43 OR8G3P-201ENST00000533406 921 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRHQ9HD43 OR7G1-201ENST00000541538 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRHQ9HD43 CA1-224ENST00000542576 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRHQ9HD43 LINC02293-202ENST00000548385 358 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRHQ9HD43 ARPP19-205ENST00000563566 568 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRHQ9HD43 LINC02168-201ENST00000565327 352 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRHQ9HD43 AC126365.2-201ENST00000580630 379 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRHQ9HD43 AC133794.1-201ENST00000602731 914 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRHQ9HD43 AC125494.3-201ENST00000602759 455 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRHQ9HD43 AL139124.1-201ENST00000609123 421 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRHQ9HD43 LINC00976-202ENST00000628064 534 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRHQ9HD43 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRHQ9HD43 AC100757.1-201ENST00000616872 1835 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRHQ9HD43 ABI2-204ENST00000295851 22209 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRHQ9HD43 VN2R3P-201ENST00000422626 1412 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRHQ9HD43 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRHQ9HD43 PLEKHS1-204ENST00000369310 2046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRHQ9HD43 OR55B1P-203ENST00000641518 2602 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRHQ9HD43 AL451142.2-201ENST00000429076 2090 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRHQ9HD43 AC092447.5-201ENST00000429367 2741 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRHQ9HD43 AJ009632.2-202ENST00000634644 1513 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPRHQ9HD43 TRPC4-203ENST00000358477 2955 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRHQ9HD43 CALN1-203ENST00000395276 9189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRHQ9HD43 ADAM29-213ENST00000615367 3386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRHQ9HD43 GAPVD1-206ENST00000394104 6737 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRHQ9HD43 OR4N5-201ENST00000333629 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRHQ9HD43 RN7SKP185-201ENST00000362813 326 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRHQ9HD43 RNA5SP27-201ENST00000363839 119 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRHQ9HD43 RNU6-1005P-201ENST00000384519 107 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRHQ9HD43 IGLV7-43-201ENST00000390298 385 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRHQ9HD43 AC093719.1-202ENST00000392735 373 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRHQ9HD43 CABYR-204ENST00000399499 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRHQ9HD43 ATF1P1-201ENST00000406040 927 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRHQ9HD43 AL355615.1-201ENST00000406187 641 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRHQ9HD43 RNA5SP487-201ENST00000410186 122 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRHQ9HD43 RPS6P14-201ENST00000425165 719 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRHQ9HD43 AL354714.4-201ENST00000427339 575 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRHQ9HD43 AL353597.2-202ENST00000434901 373 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRHQ9HD43 AL136099.1-201ENST00000436492 557 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRHQ9HD43 AC245427.2-201ENST00000438839 263 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRHQ9HD43 CNOT7P2-201ENST00000441051 832 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRHQ9HD43 AC245047.2-201ENST00000441060 530 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRHQ9HD43 AC068489.1-201ENST00000453706 261 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPRHQ9HD43 BX546450.1-201ENST00000454307 482 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.8 ms