Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 RNU6-1320P-201ENST00000390838 107 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
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SS18Q15532 LINC01493-201ENST00000530102 460 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SS18Q15532 AC005868.1-201ENST00000536421 331 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
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