Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 CASP10-204ENST00000346817 3926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 ZSCAN26-204ENST00000614088 2321 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 IL6ST-212ENST00000522633 1878 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 AL356489.2-201ENST00000566968 3528 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 DHX9P1-201ENST00000436565 3076 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 CDC42SE2-201ENST00000360515 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 NUP107-202ENST00000378905 2859 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 CACNB4-273ENST00000638091 4061 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 DMXL2-202ENST00000449909 7465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 TPTE2-205ENST00000400230 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 OR5F1-201ENST00000278409 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 SNORA73.1-201ENST00000363107 205 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 SNORA2.3-201ENST00000383920 135 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 RNA5SP122-201ENST00000384457 108 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 C8orf22-202ENST00000399653 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 EEF1B2P8-201ENST00000414101 671 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 AL132671.1-201ENST00000415736 308 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 AC073521.1-201ENST00000418679 625 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 AC068058.1-201ENST00000435782 389 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 LINC01133-202ENST00000443364 1266 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 LINC01911-201ENST00000450667 806 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 EIF4A1P11-201ENST00000451239 222 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 EIF4A2P2-201ENST00000455776 1070 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 AL133244.1-201ENST00000456007 258 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 OR2A1-AS1-202ENST00000467944 422 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 AC138866.2-201ENST00000508650 584 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 GYPA-208ENST00000512064 441 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 AC100782.1-201ENST00000520778 590 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 BUD31P1-201ENST00000521828 359 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 AC087379.1-201ENST00000524613 993 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 OR7G1-201ENST00000541538 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 AC010197.1-201ENST00000541860 578 ntTSL 4 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 AC073569.1-201ENST00000548469 667 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 AL512310.9-201ENST00000553311 948 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 AC068112.1-201ENST00000580057 346 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 AC004825.2-201ENST00000616634 455 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 OR2L3-202ENST00000641161 2830 ntAPPRIS P1 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 TM4SF1-202ENST00000472441 3115 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 TMEM255A-202ENST00000371352 2879 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 USP26-203ENST00000511190 3665 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 PIGN-229ENST00000638936 4233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 EEF1A1P42-201ENST00000613436 1331 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 OR13C1P-202ENST00000641378 2919 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 KATNAL1-201ENST00000380615 7551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 C4orf17-201ENST00000326581 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 TRIQK-206ENST00000518748 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 ABCC9-201ENST00000261200 8293 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 FAT3-204ENST00000525166 18699 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 EED-206ENST00000527888 1422 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 CLHC1-203ENST00000406076 1777 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 MTTP-201ENST00000265517 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 AC017104.4-201ENST00000636283 1592 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 ZCCHC6-203ENST00000375948 958 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 S100G-201ENST00000380200 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 TRGV10-201ENST00000390341 512 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 TRGV8-201ENST00000390343 468 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 KRTAP29-1-201ENST00000391353 1026 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 KRTAP3-2-201ENST00000391587 702 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 EFCAB9-201ENST00000398186 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 AC012499.1-201ENST00000412133 741 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 AC004552.1-201ENST00000419089 348 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 PDSS1P1-201ENST00000422953 1114 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 FABP7P1-201ENST00000424004 391 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 DPY19L1P2-201ENST00000426647 915 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 AL158073.1-201ENST00000426848 1104 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 AL031428.1-201ENST00000427154 666 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 RPS27P18-201ENST00000431701 247 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 FSIP2-AS1-202ENST00000436557 689 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 AL137076.1-201ENST00000441046 551 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 AC135371.1-201ENST00000446964 453 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 LINC01344-202ENST00000449842 571 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 AC022431.1-201ENST00000450941 438 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 RPS26P3-201ENST00000470205 348 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 RN7SL41P-201ENST00000476144 297 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 AC090543.2-201ENST00000483963 348 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 AC004057.1-201ENST00000485827 348 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 AL117692.1-201ENST00000494283 713 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 AC055758.1-201ENST00000494509 569 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 AC006499.4-201ENST00000510947 694 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 RNA5SP373-201ENST00000517271 95 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 AC005740.3-201ENST00000520882 344 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 AC010768.4-201ENST00000528183 520 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 TRDN-204ENST00000542443 1294 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 AC107958.1-201ENST00000556576 290 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 AF107885.2-202ENST00000557653 448 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 LINC00933-205ENST00000560917 449 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 AC007066.2-202ENST00000566531 914 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 CCDC58P1-201ENST00000578567 430 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 ARGFXP2-201ENST00000579304 949 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 AL136084.2-212ENST00000589976 654 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 AC067773.1-201ENST00000603284 1094 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 AL356056.1-205ENST00000608904 651 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 AL359091.2-201ENST00000609303 556 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 AC098617.1-203ENST00000609865 277 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 OR2L8-201ENST00000623922 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 SMG1P1-206ENST00000431681 2913 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 ADAM18-202ENST00000379866 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 AC134882.1-201ENST00000603738 1676 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
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