Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 A1CF-206ENST00000395489 9517 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 HAUS3-201ENST00000243706 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 ARL17A-202ENST00000336125 3945 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AL033543.1-201ENST00000623440 13454 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 MECOM-209ENST00000472280 3593 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 CEACAMP10-201ENST00000489959 1721 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 NAMPTP1-201ENST00000440465 2514 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 SLC2A14-218ENST00000543909 4125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC092378.1-202ENST00000500117 2296 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 CYBRD1-203ENST00000409484 1493 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 GJA10-203ENST00000638915 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 TRMT10A-202ENST00000394876 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC012668.3-202ENST00000417485 1642 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC087258.1-203ENST00000545400 1629 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 BPESC1-201ENST00000418282 3522 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 MDM4-217ENST00000621032 5592 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 PCNX4-201ENST00000317623 17339 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AMY1B-202ENST00000370080 1787 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 NT5C3A-203ENST00000396152 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 PHYHIPL-201ENST00000373878 3569 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 NUMB-203ENST00000359560 3309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AL353743.4-201ENST00000422653 1547 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 SEMA5A-AS1-201ENST00000510879 1679 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 NPHP3-AS1-202ENST00000504440 2507 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC093297.3-201ENST00000607056 2517 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 DDX18P6-201ENST00000450119 1997 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 OR4M1-201ENST00000315957 1116 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 RPL24P4-201ENST00000326586 421 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 PPIAP24-201ENST00000328558 471 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 DEFB106A-201ENST00000335186 303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 DEFB106B-201ENST00000335479 316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 RNU6-707P-201ENST00000364647 95 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 ST3GAL3-212ENST00000372362 468 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 IFNA21-201ENST00000380225 1024 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 MFAP5-202ENST00000396549 1195 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 FBXO11-203ENST00000405808 299 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 RN7SKP146-201ENST00000410242 334 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 RPL26P37-201ENST00000411983 438 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 TEX38-202ENST00000415500 566 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 LINC01709-201ENST00000415532 634 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AL359633.2-201ENST00000415787 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 RNGTTP1-201ENST00000420965 728 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 E2F3-IT1-201ENST00000433182 400 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 FBXW12-203ENST00000436231 1117 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 TMX2P1-201ENST00000436507 708 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC010105.1-201ENST00000437290 385 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AL138767.3-201ENST00000438082 495 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 RPL12P49-201ENST00000441100 121 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AL591363.1-201ENST00000450091 483 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 TVP23CP1-201ENST00000450317 639 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 LINC01825-201ENST00000452381 850 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 NDUFB3-204ENST00000454214 547 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AL512303.1-201ENST00000458693 465 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 RPSAP39-201ENST00000467439 883 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 MARK2P8-201ENST00000476069 952 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC107021.1-202ENST00000480247 555 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 CCDC11P1-201ENST00000503137 1162 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC117522.3-201ENST00000507974 584 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC024589.1-201ENST00000512207 263 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 LINC02201-203ENST00000514657 674 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC069272.1-201ENST00000514843 680 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
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FOXE3Q13461 LINC00534-201ENST00000517400 793 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 ATP6V0E1-202ENST00000517669 502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC084768.1-201ENST00000518926 923 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 ST3GAL3-232ENST00000531451 420 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 TMEM116-208ENST00000549537 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 CFL2-206ENST00000556161 546 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AL096869.1-201ENST00000557622 559 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC084782.2-201ENST00000561934 839 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AP003115.1-201ENST00000569849 463 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC090912.2-203ENST00000581177 477 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC015818.6-201ENST00000584274 634 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 MIR212-201ENST00000586026 110 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC091132.1-201ENST00000588189 547 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC011921.2-201ENST00000589465 152 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC006557.3-201ENST00000592926 517 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC012594.1-252ENST00000595011 876 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 BMS1P7-201ENST00000602440 1052 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC114477.1-201ENST00000605097 605 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 Metazoa_SRP.77-201ENST00000616915 252 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 TEX41-256ENST00000626411 368 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC245427.3-201ENST00000632041 51 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 LINC01739-205ENST00000641890 573 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 DGKB-202ENST00000402815 5595 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 LINC01152-201ENST00000472655 3578 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 ADAL-201ENST00000389651 1559 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
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