Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 MOCS2-203ENST00000450852 1337 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 ANXA1-201ENST00000257497 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 ANAPC1P1-201ENST00000426186 2145 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 FOXP2-209ENST00000393498 2617 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 RABL3-201ENST00000273375 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 PTK2-206ENST00000517712 3351 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 CLCA1-202ENST00000394711 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 RGS4-202ENST00000367908 2606 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 SAMSN1-206ENST00000619120 2028 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 TDO2-208ENST00000536354 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 LINC00919-201ENST00000561513 1658 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 AL162425.1-201ENST00000423637 1525 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 OR8I2-201ENST00000302124 1010 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 CFAP126-201ENST00000367974 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 AL021331.1-201ENST00000402817 582 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 AC098820.3-201ENST00000414135 976 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 GJA6P-201ENST00000415117 1042 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 AL356056.1-206ENST00000424615 407 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 AC074367.1-201ENST00000438685 1125 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 RPS15AP29-201ENST00000445539 400 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 EIF4EBP2P1-201ENST00000450009 343 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 MTCYBP14-201ENST00000457471 715 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 AP002371.1-201ENST00000463604 433 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 RN7SL808P-201ENST00000496066 299 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 AC112206.2-204ENST00000504068 793 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 LINC02270-201ENST00000505386 610 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 NRG1-IT1-201ENST00000520444 758 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 AC092709.1-201ENST00000521355 1045 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 LINC02552-203ENST00000545630 583 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 AC022196.1-202ENST00000559570 462 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 NDUFB4P11-201ENST00000560510 395 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 MTCYBP13-201ENST00000578634 1093 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 AP005433.1-201ENST00000582939 620 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 AC017076.1-201ENST00000607613 578 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 AC009032.1-201ENST00000617574 431 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 AC023510.2-201ENST00000622162 746 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 AC020763.5-201ENST00000623298 430 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 AC112694.2-201ENST00000623697 768 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 AL353662.3-201ENST00000625131 237 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 ZNF33A-201ENST00000307441 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 ZNF83-204ENST00000545872 2633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 MAP3K2-201ENST00000344908 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 FSHB-202ENST00000417547 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 LMNTD1-207ENST00000539744 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 AP002518.1-201ENST00000534904 3837 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 AC087257.1-201ENST00000506925 2639 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 OR4F5-202ENST00000641515 2618 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 INTS6P1-201ENST00000504674 2530 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 DCLRE1A-201ENST00000361384 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 OR2T7-202ENST00000641557 3409 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 ADAM18-201ENST00000265707 2388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 ALB-219ENST00000621085 1418 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 Z95331.1-201ENST00000623075 23112 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 AL158835.1-203ENST00000415305 3149 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 DIRC1-201ENST00000308100 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 SNORA2.3-201ENST00000383920 135 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 OR1F12-201ENST00000402365 945 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 RBMY2QP-201ENST00000429799 1147 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
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TRAF1Q13077 AL034380.1-201ENST00000448791 306 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
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TRAF1Q13077 AC015912.1-201ENST00000574826 538 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 AC008536.1-201ENST00000602872 669 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 AC018695.5-201ENST00000605872 315 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 AL139022.2-201ENST00000606934 443 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 AP005432.2-201ENST00000608162 586 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 CTSLP2-203ENST00000628708 493 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 ZNRD1ASP-221ENST00000637794 1074 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 LINC00507-201ENST00000540882 1935 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 SPART-202ENST00000438666 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 ZNF525-202ENST00000474037 3890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 CLCA3P-201ENST00000284054 2407 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 ZNF790-201ENST00000356725 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 SLC26A7-208ENST00000523719 2902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 ERI2-202ENST00000357967 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 AC099654.3-201ENST00000447087 1546 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 DDHD2-202ENST00000517385 4113 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
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