Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 OR11H3P-201ENST00000554547 982 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 AC079075.1-201ENST00000559543 878 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 C15orf41-205ENST00000563167 772 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 H3F3BP2-201ENST00000583907 357 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 PRPF19P1-201ENST00000584766 898 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 AL121989.1-201ENST00000585888 746 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 AF230666.2-201ENST00000602328 725 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 AC095055.1-201ENST00000603472 1113 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 AL391597.1-201ENST00000618707 694 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 AC135068.5-201ENST00000624197 983 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 MTCO1P1-201ENST00000624263 1081 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 CEP97-201ENST00000341893 8361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 ENPP2-207ENST00000522167 1695 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 ADGRL2-209ENST00000370727 5164 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 MRPL35-202ENST00000337109 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 FAM114A2-210ENST00000520313 1394 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 MEG8-223ENST00000638012 3757 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 STEAP2-205ENST00000394629 2261 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 LINC00704-201ENST00000430998 1478 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 AC012618.3-205ENST00000637896 1496 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 ASAH2-204ENST00000447815 2311 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 SMG1P4-204ENST00000523028 4131 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 ARHGAP24-201ENST00000264343 4572 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 PPP1R2P3-201ENST00000522232 1991 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 ELF1-204ENST00000625359 2032 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 PDE4B-201ENST00000329654 3998 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 ERMN-201ENST00000397283 3760 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 OR10K1-203ENST00000641432 3775 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 PIH1D2-201ENST00000280350 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 AC017079.1-201ENST00000333650 415 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 SNORA17.1-201ENST00000362945 126 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 SNORD56.6-201ENST00000384569 71 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 RAB28P1-201ENST00000411517 641 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 AC097717.1-233ENST00000413557 460 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 COX5BP7-201ENST00000414780 274 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 SRSF1P1-201ENST00000424058 520 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 EIF2S2P3-201ENST00000428356 999 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 PIH1D2-202ENST00000431456 1245 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 AL161621.1-201ENST00000444796 340 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 AC037198.2-201ENST00000478845 733 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 GYPA-203ENST00000503627 318 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 AC093909.2-201ENST00000505178 437 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 AC079858.1-201ENST00000507842 448 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 LINC00992-202ENST00000514186 564 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 UBE2Q2P10-201ENST00000514854 900 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 SCARNA20.4-201ENST00000516969 131 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 AF181450.1-201ENST00000522980 410 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 HNRNPRP2-201ENST00000528421 743 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 AC090023.2-201ENST00000540875 545 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 SETP1-201ENST00000556014 845 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 AC040958.1-201ENST00000561102 201 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 RPL10P14-201ENST00000565265 298 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 AC018558.3-201ENST00000567902 572 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 MTCYBP13-201ENST00000578634 1093 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 AC005084.1-201ENST00000605160 304 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 GMCL1P2-201ENST00000605230 823 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 AC105402.3-203ENST00000608822 885 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 AC105265.3-202ENST00000610188 459 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 BNIP3P41-202ENST00000616656 861 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 AC012593.1-212ENST00000627058 580 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 EIF3E-206ENST00000519030 1324 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 GAPT-202ENST00000396776 3016 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 FGF13-202ENST00000315930 19519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 AL356317.1-201ENST00000396110 1436 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 PSG1-204ENST00000436291 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 PANDAR-201ENST00000629595 1506 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 SEC31A-201ENST00000264405 3447 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 LINS1-214ENST00000561308 1612 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 SELL-201ENST00000236147 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 RAPH1-207ENST00000423104 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 AL450326.2-201ENST00000421913 1962 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 AL731532.2-201ENST00000623542 1953 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 CRYAB-201ENST00000227251 848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 AC010132.2-201ENST00000295493 1043 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 OR4C11-201ENST00000302231 1045 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 OR6X1-201ENST00000327930 1058 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 AC007618.1-201ENST00000366455 732 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 LINC00474-201ENST00000374014 769 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 IL6ST-204ENST00000381293 612 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 SNORA51.8-201ENST00000384234 132 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 EFCAB9-201ENST00000398186 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 LINC00342-201ENST00000412393 654 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 OR5K2-201ENST00000427338 1060 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 AL360081.1-201ENST00000428299 555 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 AC092811.1-201ENST00000428642 397 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 GSTM5P1-201ENST00000434751 660 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 AL807757.1-201ENST00000437846 424 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 AC012512.1-201ENST00000446594 718 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 LINC00448-202ENST00000448411 433 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 AC243772.1-201ENST00000451620 410 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 PRPF38AP1-201ENST00000451976 933 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 RPS3AP53-201ENST00000454716 778 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 TRBV2-201ENST00000455382 421 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
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