Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

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Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 AJ239321.1-201ENST00000424255 564 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SREBF2Q12772 RPL12P34-201ENST00000424532 479 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SREBF2Q12772 AC106901.1-201ENST00000425086 698 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SREBF2Q12772 AL591178.1-201ENST00000439239 454 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SREBF2Q12772 AC004994.1-201ENST00000447057 313 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SREBF2Q12772 LINC02265-201ENST00000510551 957 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SREBF2Q12772 FOXD1-AS1-201ENST00000514661 424 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SREBF2Q12772 SNORA70.11-201ENST00000515987 138 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SREBF2Q12772 SNORA70.13-201ENST00000516116 138 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SREBF2Q12772 RNA5SP464-201ENST00000516251 108 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SREBF2Q12772 NPM1P52-201ENST00000518264 846 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SREBF2Q12772 IGHVIII-2-1-201ENST00000518843 291 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SREBF2Q12772 AC012339.2-201ENST00000523996 453 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SREBF2Q12772 MTERF3-205ENST00000524341 776 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SREBF2Q12772 AC099518.4-204ENST00000567047 380 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SREBF2Q12772 FAM60CP-201ENST00000591086 664 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SREBF2Q12772 GXYLT1P4-203ENST00000616580 641 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SREBF2Q12772 CR381572.2-201ENST00000624852 397 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SREBF2Q12772 HPVC1-201ENST00000629899 1198 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SREBF2Q12772 ARMCX5-201ENST00000246174 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SREBF2Q12772 LRRN3-201ENST00000308478 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SREBF2Q12772 AC090220.1-201ENST00000593078 1699 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SREBF2Q12772 SEC31A-209ENST00000500777 3610 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SREBF2Q12772 OFD1P8Y-201ENST00000449148 1433 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SREBF2Q12772 ZNF83-202ENST00000536937 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SREBF2Q12772 ATP5A1P4-201ENST00000556888 1605 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SREBF2Q12772 AP000808.1-201ENST00000512200 3252 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SREBF2Q12772 AL132656.3-201ENST00000606384 1595 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SREBF2Q12772 AL078595.2-201ENST00000605309 1780 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SREBF2Q12772 AC018628.1-201ENST00000624147 3819 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SREBF2Q12772 CKAP5-202ENST00000354558 6428 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SREBF2Q12772 SETDB2-201ENST00000258672 2138 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SREBF2Q12772 DAZ4-205ENST00000440066 1891 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SREBF2Q12772 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SREBF2Q12772 GSTM2-206ENST00000442650 1478 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SREBF2Q12772 AC120036.2-201ENST00000509729 1474 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SREBF2Q12772 RPL26-201ENST00000293842 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SREBF2Q12772 RNU6-1331P-201ENST00000363658 106 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SREBF2Q12772 MIR589-201ENST00000385238 99 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SREBF2Q12772 CACYBP-203ENST00000406752 243 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SREBF2Q12772 RNA5SP251-201ENST00000410614 137 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SREBF2Q12772 AC019070.1-201ENST00000415008 1024 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SREBF2Q12772 AL353801.1-201ENST00000425541 425 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SREBF2Q12772 MAGI2-AS1-201ENST00000428298 472 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SREBF2Q12772 PCBP1-AS1-224ENST00000429599 1045 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SREBF2Q12772 POU6F2-AS1-201ENST00000433519 381 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SREBF2Q12772 CASP12-204ENST00000433738 709 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SREBF2Q12772 NDUFA5P1-201ENST00000433858 341 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SREBF2Q12772 AL139120.1-201ENST00000443652 358 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SREBF2Q12772 CDC27P1-201ENST00000445384 715 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SREBF2Q12772 AC017099.1-201ENST00000448261 1028 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SREBF2Q12772 AL161912.1-201ENST00000448475 524 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SREBF2Q12772 AL500527.1-201ENST00000448532 255 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SREBF2Q12772 CEACAMP6-201ENST00000452007 574 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SREBF2Q12772 AC104849.1-201ENST00000462623 405 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SREBF2Q12772 AC025181.1-201ENST00000477507 416 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SREBF2Q12772 RPL7P41-201ENST00000485823 957 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SREBF2Q12772 RPL21P129-201ENST00000491732 478 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SREBF2Q12772 AC108941.2-201ENST00000506796 716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SREBF2Q12772 AC138701.1-201ENST00000524329 714 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SREBF2Q12772 OR4A43P-201ENST00000532938 908 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SREBF2Q12772 DERA-209ENST00000532964 854 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SREBF2Q12772 DEFB109F-202ENST00000542600 509 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SREBF2Q12772 AC104002.2-201ENST00000553919 318 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SREBF2Q12772 LINC02319-201ENST00000555852 349 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SREBF2Q12772 NPM1P42-201ENST00000560329 862 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SREBF2Q12772 AC103876.1-201ENST00000568634 418 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SREBF2Q12772 AC010528.1-201ENST00000568714 739 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SREBF2Q12772 AC068025.2-201ENST00000584958 419 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SREBF2Q12772 AC138035.1-202ENST00000604669 683 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SREBF2Q12772 AC008833.1-201ENST00000611633 691 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SREBF2Q12772 AC104307.1-201ENST00000616142 196 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SREBF2Q12772 SLC26A5-207ENST00000393729 2422 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SREBF2Q12772 LINC00616-205ENST00000514600 2017 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SREBF2Q12772 LRRC49-223ENST00000560369 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SREBF2Q12772 CCDC62-205ENST00000537566 3537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SREBF2Q12772 USP50-205ENST00000616326 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SREBF2Q12772 NRG3-202ENST00000372142 3136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SREBF2Q12772 NHSL2-204ENST00000631375 12593 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SREBF2Q12772 IFI16-202ENST00000340979 2732 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SREBF2Q12772 CNTNAP4-205ENST00000476707 4355 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SREBF2Q12772 IL13RA2-201ENST00000243213 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SREBF2Q12772 IRAK4-203ENST00000448290 1381 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SREBF2Q12772 SOX2-OT-218ENST00000498731 3576 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SREBF2Q12772 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SREBF2Q12772 LINC01902-203ENST00000637369 7356 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SREBF2Q12772 ZFX-211ENST00000539115 6801 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SREBF2Q12772 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SREBF2Q12772 CAPRIN2-203ENST00000417045 3535 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SREBF2Q12772 AC022893.1-201ENST00000517664 3549 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SREBF2Q12772 XIRP2-203ENST00000409195 12675 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SREBF2Q12772 RYR3-209ENST00000634418 15078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SREBF2Q12772 AC083899.1-201ENST00000454465 3819 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SREBF2Q12772 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SREBF2Q12772 HSPD1P8-201ENST00000400121 1658 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SREBF2Q12772 EIF4EBP2-201ENST00000373218 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SREBF2Q12772 VWC2L-201ENST00000312504 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SREBF2Q12772 KCNH5-201ENST00000322893 11290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SREBF2Q12772 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SREBF2Q12772 NKIRAS1-209ENST00000614374 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
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