Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

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Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 MED1-201ENST00000300651 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CENPFP49454 DNAH3-201ENST00000261383 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CENPFP49454 KLHL4-201ENST00000373114 2445 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CENPFP49454 PEX26-201ENST00000329627 18445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CENPFP49454 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CENPFP49454 ARRDC3-201ENST00000265138 4188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CENPFP49454 RN7SL132P-201ENST00000478131 296 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CENPFP49454 FAM19A1-201ENST00000478136 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CENPFP49454 RN7SL600P-201ENST00000581811 299 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CENPFP49454 AC069061.3-201ENST00000582254 823 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CENPFP49454 ZNF415P1-201ENST00000582279 1166 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CENPFP49454 KAT6B-201ENST00000287239 8287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CENPFP49454 NBPF12-206ENST00000617844 6326 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CENPFP49454 UNC13B-210ENST00000636694 8012 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CENPFP49454 LINC02456-201ENST00000635615 1323 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CENPFP49454 SEMA3A-201ENST00000265362 8225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CENPFP49454 MPDZ-204ENST00000381022 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CENPFP49454 DOCK4-AS1-201ENST00000452714 2494 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CENPFP49454 CARF-203ENST00000414439 2099 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CENPFP49454 LINC01478-201ENST00000587877 2068 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CENPFP49454 TAS2R19-201ENST00000390673 1002 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CENPFP49454 AL451140.1-201ENST00000430534 371 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CENPFP49454 RPL23AP52-201ENST00000439311 478 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CENPFP49454 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CENPFP49454 AC022336.1-201ENST00000475510 337 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CENPFP49454 OR10J4-201ENST00000504970 935 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CENPFP49454 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CENPFP49454 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CENPFP49454 AP005436.1-201ENST00000531454 488 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CENPFP49454 RPS15A-203ENST00000563390 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CENPFP49454 MIR6875-201ENST00000617506 72 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CENPFP49454 ACTR3BP5-201ENST00000448440 1479 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CENPFP49454 HYDIN-206ENST00000393567 15719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
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CENPFP49454 UGT2B15-201ENST00000338206 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CENPFP49454 RIMKLB-207ENST00000538135 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CENPFP49454 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CENPFP49454 ASTE1-208ENST00000514044 2504 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
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CENPFP49454 CPM-201ENST00000338356 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
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CENPFP49454 STEAP2-203ENST00000394622 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
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CENPFP49454 LRMP-201ENST00000354454 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
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CENPFP49454 ANK3-202ENST00000355288 3811 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
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CENPFP49454 BPY2B-204ENST00000615850 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CENPFP49454 BPY2C-204ENST00000618574 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
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CENPFP49454 GREM1-203ENST00000622074 14606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
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CENPFP49454 AL354984.3-201ENST00000604803 325 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CENPFP49454 AC048338.2-201ENST00000623601 684 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CENPFP49454 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CENPFP49454 METTL8-217ENST00000612742 8132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
CENPFP49454 LINC00690-201ENST00000429949 1365 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
CENPFP49454 SLC4A8-202ENST00000358657 11731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
CENPFP49454 NPIPB9-201ENST00000357796 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
CENPFP49454 MAP3K20-201ENST00000338983 7179 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
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