Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 RPL23AP37-201ENST00000479658 549 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 PLSCR5-202ENST00000482567 1018 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 AC000372.1-201ENST00000488818 646 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 AC004889.1-208ENST00000489077 423 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 FXN-205ENST00000498653 856 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 AC091435.2-201ENST00000514586 565 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 AC011131.1-201ENST00000521224 252 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 AC091819.2-201ENST00000522292 490 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 LINC02443-204ENST00000544717 754 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 AC034102.2-201ENST00000548861 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 AC012464.2-201ENST00000551257 779 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 AC079075.1-201ENST00000559543 878 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 LINC02284-202ENST00000560924 566 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 Metazoa_SRP.181-201ENST00000616636 288 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 AC012414.7-202ENST00000622705 1090 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 OR9Q2-202ENST00000641291 3774 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 LINC00919-201ENST00000561513 1658 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 AL359922.3-201ENST00000624779 1670 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 CRISP1-204ENST00000507853 1793 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 THAP12P4-201ENST00000528321 2266 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 MYBPC1-204ENST00000452455 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 IPO11-203ENST00000409534 1725 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 GPR18-201ENST00000340807 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 HIST1H1A-201ENST00000244573 648 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 OR13G1-201ENST00000359688 1046 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 AC135895.1-201ENST00000360528 1058 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 MIR105-2-201ENST00000385083 81 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 NT5C3A-206ENST00000409787 840 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 AF015720.1-201ENST00000412240 349 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 LINC01829-201ENST00000414404 571 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 AL627308.1-201ENST00000435693 821 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 RPS26P2-201ENST00000440331 348 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 Z80107.2-201ENST00000445127 392 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 OTX2P1-201ENST00000450956 354 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 RN7SL30P-201ENST00000488416 306 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 LINC02278-201ENST00000512170 500 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 LINC01493-201ENST00000530102 460 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 AC007527.1-201ENST00000535528 313 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 WDR61-205ENST00000558459 884 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 LINC01859-201ENST00000565584 1024 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 SNORA74C-1-201ENST00000580726 201 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 AC209154.1-201ENST00000582156 337 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 AC008738.1-201ENST00000590117 375 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 AC009303.3-201ENST00000591103 736 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 AL353811.1-202ENST00000602614 618 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 BNIP3P7-201ENST00000605641 516 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 SNORA35B-201ENST00000607417 129 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 AC211433.2-201ENST00000608433 387 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 Metazoa_SRP.111-201ENST00000614073 259 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 AC008115.4-201ENST00000619780 775 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 AC019206.1-201ENST00000621938 425 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 AC005086.4-201ENST00000623065 213 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 TEX41-254ENST00000626394 423 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 WDR75-207ENST00000631047 270 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 AC083843.2-201ENST00000568248 6253 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 PNLIPRP3-201ENST00000369230 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 AP001284.1-201ENST00000528393 2118 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 PPP1R2P3-201ENST00000522232 1991 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 ERC2-201ENST00000288221 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 PABPC1P6-201ENST00000445594 1829 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 SPINK5-201ENST00000256084 3535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 KIF23-206ENST00000558585 2296 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 HGF-201ENST00000222390 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 DGKH-206ENST00000536612 3957 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 LINGO2-201ENST00000308675 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 NKIRAS1-209ENST00000614374 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 OR5M3-201ENST00000312240 1051 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 RNA5SP455-201ENST00000365190 119 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 RNU6ATAC21P-201ENST00000408656 126 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 GTF2IP5-201ENST00000414608 731 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 LINC00364-201ENST00000415120 611 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 AC017078.1-201ENST00000416146 368 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 LINC02529-201ENST00000429657 772 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 LINC02257-202ENST00000433576 720 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 AC093414.1-201ENST00000434712 514 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 AL445644.1-201ENST00000436524 751 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 AC115618.2-201ENST00000453810 450 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 APOA2-207ENST00000470459 416 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 DEFB109F-201ENST00000491870 277 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 RN7SL244P-201ENST00000493405 297 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 AC119150.1-201ENST00000507143 563 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 AC097491.1-201ENST00000507857 672 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 ATG10-208ENST00000513634 618 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 AC116424.1-203ENST00000513940 671 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 AC246817.2-206ENST00000520570 582 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 AC008641.1-201ENST00000523781 248 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 RERGL-202ENST00000536890 367 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 AC104938.1-202ENST00000563041 630 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 OOSP1P2-201ENST00000579644 351 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 MIR1269B-201ENST00000580405 75 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 SLC14A2-AS1-201ENST00000585759 494 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 AC024592.1-202ENST00000590441 341 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 AC105094.2-202ENST00000590968 566 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 AC130352.1-201ENST00000602979 661 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 OR10X1-201ENST00000623167 981 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 LINC01739-205ENST00000641890 573 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 193.8 ms