Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 AP001267.3-202ENST00000525992 448 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 AP000763.3-201ENST00000542598 334 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 MIR4307HG-201ENST00000548170 822 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 NELL2-211ENST00000548826 559 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 LINC02329-201ENST00000554753 511 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 AC018558.1-201ENST00000562591 459 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 RBM22P12-201ENST00000567098 1255 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 MIR4789-201ENST00000577469 82 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 AC008752.1-201ENST00000590046 408 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 AC079315.1-201ENST00000602952 623 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 AC011374.2-201ENST00000607135 526 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 CU638689.1-201ENST00000623225 897 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 CU634019.4-201ENST00000623347 897 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 AC097655.1-201ENST00000635075 318 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 ZNF573-208ENST00000536220 2257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 MFAP1-201ENST00000267812 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 MAP9-208ENST00000515654 2044 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 AC010531.4-202ENST00000569872 1718 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 ZNF415-203ENST00000500065 2496 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 UGT2B26P-201ENST00000508672 1613 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 SLC26A5-207ENST00000393729 2422 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 PNLIPRP3-201ENST00000369230 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 PROX1-205ENST00000498508 8498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 PSMC6-201ENST00000445930 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 KDM3B-209ENST00000542866 3634 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 SLC1A3-201ENST00000265113 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 MOSPD2-201ENST00000380492 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 TMEM99-201ENST00000301665 2058 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 NFE2L2-204ENST00000423513 1382 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 MIR375-201ENST00000362103 64 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 RNU5B-1-201ENST00000363286 116 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 OR1L6-202ENST00000373684 1044 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 MIR551A-201ENST00000385042 96 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 RNU6-244P-201ENST00000391028 104 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 AL603865.2-201ENST00000401679 213 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 AL391645.1-201ENST00000417409 506 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 OXSM-202ENST00000420173 1256 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 AC021035.1-201ENST00000421597 427 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 AL136131.2-201ENST00000424283 348 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 AC113412.1-201ENST00000425840 504 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 AL021153.1-201ENST00000427360 308 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 OR6D1P-201ENST00000436165 939 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 AC024597.1-201ENST00000442753 706 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
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GPS1Q13098 AP000797.2-201ENST00000475768 606 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
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GPS1Q13098 AC093607.1-202ENST00000499715 559 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
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GPS1Q13098 FRG1EP-201ENST00000634469 770 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 AL589740.1-205ENST00000635561 565 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 AC099654.6-201ENST00000636487 512 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 DTNA-227ENST00000597599 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 PRUNE2-207ENST00000428286 12437 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 CDH19-201ENST00000262150 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 ZNF677-201ENST00000333952 3422 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
GPS1Q13098 PLCB1-211ENST00000617005 6458 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 MECOM-217ENST00000494292 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 KCNJ10-205ENST00000638728 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 RBM44-206ENST00000611254 1427 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 UACA-211ENST00000560441 4723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 PSG1-202ENST00000312439 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 ZNF83-202ENST00000536937 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 RAB3GAP1-207ENST00000539493 3161 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 AC018557.1-201ENST00000569274 1790 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 C10orf120-201ENST00000329446 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 RN7SKP6-201ENST00000364795 319 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
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