Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 PLCH1-201ENST00000334686 6128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 AC091045.1-201ENST00000561460 2277 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 UGP2-203ENST00000445915 1955 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 STAU2-220ENST00000522695 2646 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 MTHFD2L-207ENST00000433372 1407 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 TMEM99-201ENST00000301665 2058 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 AC131971.1-201ENST00000332881 1482 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 NUP107-202ENST00000378905 2859 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 CREM-202ENST00000342105 1541 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 ARHGEF6-203ENST00000370622 4779 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 ASAH2-204ENST00000447815 2311 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 IKZF3-202ENST00000346243 1296 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 AL353625.1-202ENST00000366273 571 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 C1orf194-204ENST00000369949 731 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 RNU6-1176P-201ENST00000390955 107 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 LINC02528-201ENST00000417800 381 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 AL591468.1-201ENST00000417932 573 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 CR848007.2-201ENST00000424918 787 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 AL590623.1-201ENST00000427864 105 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 COX6CP13-201ENST00000428703 226 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 TNKS2-AS1-201ENST00000432246 609 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 TMEM196-204ENST00000433641 768 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 KCNIP1-205ENST00000434108 726 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 TMEM244-202ENST00000438392 565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 IKZF3-212ENST00000439016 1246 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 SCAND3P1-201ENST00000439854 1060 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 CLEC5A-203ENST00000439991 501 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 AC079760.2-201ENST00000449361 681 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 AL591623.2-201ENST00000449978 222 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 EIF4A2P2-201ENST00000455776 1070 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 TMEM212-IT1-201ENST00000456146 470 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 AP000942.1-201ENST00000463969 747 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 AC026316.2-201ENST00000473110 263 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 LINC02066-201ENST00000492731 580 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 AC231760.1-201ENST00000498002 260 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 GNPDA2-202ENST00000507534 1050 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 AC008628.1-201ENST00000508663 265 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 SPINK13-202ENST00000511106 661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 AC021733.2-201ENST00000518830 497 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 AC246817.2-206ENST00000520570 582 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 AC137590.1-201ENST00000542422 495 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 LINC02307-201ENST00000553827 257 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 AC055874.1-201ENST00000561458 479 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 AC005692.2-201ENST00000566521 596 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 PPIAL4F-202ENST00000581138 660 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 PPIAL4E-201ENST00000581164 785 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 AC233702.9-201ENST00000581528 203 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 AC091132.5-202ENST00000587078 501 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 AC011487.3-201ENST00000593607 453 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 LINC01676-204ENST00000595309 871 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 AL355816.2-201ENST00000610049 647 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 AC015660.5-201ENST00000623238 564 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 PCDHB2-203ENST00000624874 565 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 AC106858.1-201ENST00000637497 429 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 HTR1F-201ENST00000319595 3140 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TRAF1Q13077 NPIPB9-201ENST00000357796 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 PSG1-204ENST00000436291 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 PNPLA4-203ENST00000444736 2752 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 VDAC3-201ENST00000022615 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 SAMD12-202ENST00000409003 8866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 HEMGN-202ENST00000616898 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 VPS50-202ENST00000305866 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 GJA9-202ENST00000360786 1901 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 GLRA2-202ENST00000355020 1730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 LINC01847-202ENST00000523311 1762 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 AC007618.1-201ENST00000366455 732 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 RGS10-201ENST00000369101 738 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 SNORA66-201ENST00000384792 133 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 TRAV16-201ENST00000390444 329 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 AL390316.1-201ENST00000406279 553 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 RN7SKP125-201ENST00000410481 302 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 NPM1P40-201ENST00000412758 733 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 ZFAND6P1-201ENST00000434138 605 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 PARGP1-202ENST00000440803 790 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 OR7E125P-201ENST00000443450 846 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 AC092957.1-201ENST00000473299 570 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 BX284632.1-201ENST00000478218 541 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 AC091544.1-201ENST00000484702 348 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 TM4SF1-AS1-202ENST00000496491 754 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 LINC02383-201ENST00000508563 582 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 OR4R2P-201ENST00000530815 597 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 SDHAF2-208ENST00000543265 438 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 C8orf59-206ENST00000545322 491 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 AC079328.3-201ENST00000558905 691 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 PWRN1-206ENST00000565512 433 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 MIR4472-2-201ENST00000582069 67 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 MIR3936-201ENST00000584304 110 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 AC005084.1-201ENST00000605160 304 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 AC044839.1-205ENST00000614989 542 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 LINC01338-201ENST00000627179 632 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 ZBTB8A-202ENST00000373510 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
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