Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

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Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 FAM19A1-201ENST00000478136 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PTPRGP23470 KLHL28-202ENST00000396128 6545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PTPRGP23470 DZIP3-201ENST00000361582 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPRGP23470 AC125257.1-201ENST00000560400 2930 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPRGP23470 LINC00907-201ENST00000585627 3324 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPRGP23470 AC004076.2-201ENST00000620532 3323 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPRGP23470 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPRGP23470 ARPP19-208ENST00000566423 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPRGP23470 AC092650.1-201ENST00000447571 1808 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPRGP23470 AC037459.2-201ENST00000514980 4076 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPRGP23470 AL356387.2-201ENST00000422272 243 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPRGP23470 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPRGP23470 LINC00375-201ENST00000433074 601 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPRGP23470 GUSBP6-201ENST00000434932 640 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPRGP23470 APOOP5-203ENST00000565921 410 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPRGP23470 RN7SL652P-201ENST00000577769 300 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPRGP23470 AC004147.1-201ENST00000580658 299 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPRGP23470 AC092902.2-202ENST00000599350 686 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPRGP23470 AC010422.4-201ENST00000601420 533 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPRGP23470 AP000843.1-201ENST00000624880 701 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPRGP23470 RNF182-207ENST00000537663 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPRGP23470 AMY2A-201ENST00000414303 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPRGP23470 AP000641.1-201ENST00000531988 1639 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPRGP23470 FOCAD-201ENST00000338382 5765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPRGP23470 DICER1-202ENST00000393063 10220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPRGP23470 THAP6-202ENST00000380837 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPRGP23470 MTX3-203ENST00000512560 4799 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPRGP23470 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPRGP23470 MCF2L2-202ENST00000414362 3031 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPRGP23470 OR14L1P-202ENST00000641545 3009 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPRGP23470 MUC5AC-201ENST00000621226 17448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRGP23470 MGAM2-201ENST00000477922 7867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRGP23470 TLK1P1-201ENST00000456760 2440 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRGP23470 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRGP23470 DGKB-201ENST00000399322 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRGP23470 BDNF-210ENST00000438929 4059 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRGP23470 SNORA73.1-201ENST00000363107 205 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRGP23470 RN7SKP224-201ENST00000364140 325 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRGP23470 SNORA48.4-201ENST00000391089 134 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRGP23470 RN7SKP267-201ENST00000410381 285 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRGP23470 RN7SKP17-201ENST00000411242 351 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRGP23470 LINC01881-201ENST00000416103 412 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
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PTPRGP23470 NUTF2P3-201ENST00000448540 384 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRGP23470 AC108463.1-201ENST00000450258 347 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRGP23470 RPL36AP41-201ENST00000493820 306 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRGP23470 MIR2116-201ENST00000517221 80 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRGP23470 AC009652.2-201ENST00000527978 516 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
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PTPRGP23470 AC126178.1-201ENST00000548722 926 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRGP23470 LINC02186-201ENST00000575767 885 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRGP23470 AC006130.2-201ENST00000586202 326 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRGP23470 AC008543.3-201ENST00000586983 491 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRGP23470 AL391422.2-201ENST00000602854 361 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRGP23470 AL133338.2-201ENST00000604292 736 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRGP23470 ARF4P1-201ENST00000605447 541 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRGP23470 KCNA2-209ENST00000639048 10836 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRGP23470 KLHL13-201ENST00000262820 3972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRGP23470 KAT6A-202ENST00000396930 9285 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRGP23470 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRGP23470 ADGRL2-209ENST00000370727 5164 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRGP23470 AL359538.1-201ENST00000453498 1710 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRGP23470 CYP3A7-CYP3A51P-202ENST00000620220 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRGP23470 LINC02183-201ENST00000637822 1732 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRGP23470 ECT2L-205ENST00000541398 4483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRGP23470 LUZP1-203ENST00000418342 8421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRGP23470 ETV1-207ENST00000405358 4181 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRGP23470 PARD3B-214ENST00000622699 7442 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRGP23470 LINGO2-201ENST00000308675 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRGP23470 CD86-203ENST00000393627 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRGP23470 LRRC37A3-204ENST00000400877 3273 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPRGP23470 SLC35F5-213ENST00000638402 1554 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPRGP23470 GVINP1-201ENST00000526769 8438 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPRGP23470 UGT2B26P-201ENST00000508672 1613 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPRGP23470 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPRGP23470 ATG12-208ENST00000509910 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPRGP23470 RNU1-82P-201ENST00000390851 165 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPRGP23470 CASKP1-201ENST00000412870 582 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPRGP23470 AC087380.1-202ENST00000415970 1163 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPRGP23470 GLUD1P9-201ENST00000420997 1173 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPRGP23470 LINC01014-203ENST00000455307 548 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPRGP23470 VDAC1P8-204ENST00000589489 997 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPRGP23470 AL157938.2-204ENST00000589667 826 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPRGP23470 AL023881.1-201ENST00000621088 301 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPRGP23470 MECOM-203ENST00000460814 3374 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPRGP23470 AL449283.1-201ENST00000602631 3403 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPRGP23470 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPRGP23470 TMPRSS11F-201ENST00000356291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPRGP23470 LRMDA-208ENST00000496424 3923 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPRGP23470 PSMC6-218ENST00000606149 1560 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPRGP23470 ZNF573-208ENST00000536220 2257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPRGP23470 OPRM1-219ENST00000522555 2440 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPRGP23470 ANO3-204ENST00000531568 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPRGP23470 DPCR1-202ENST00000462446 5314 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPRGP23470 RNU1-13P-201ENST00000384499 162 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPRGP23470 RPL7AP25-201ENST00000423357 805 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPRGP23470 RPL34P6-201ENST00000432390 345 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPRGP23470 LINC01826-201ENST00000432894 584 ntTSL 4 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PTPRGP23470 NDUFA5P1-201ENST00000433858 341 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
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