Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 AC060766.1-201ENST00000590824 627 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
VAX2Q9UIW0 AC012616.1-201ENST00000600294 197 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
VAX2Q9UIW0 AL031601.1-201ENST00000605702 394 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
VAX2Q9UIW0 AC026979.4-201ENST00000606555 645 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
VAX2Q9UIW0 MIR6778-201ENST00000617912 73 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
VAX2Q9UIW0 AL023881.1-201ENST00000621088 301 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
VAX2Q9UIW0 AC073592.6-201ENST00000624271 415 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
VAX2Q9UIW0 DUXB-201ENST00000633875 1079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
VAX2Q9UIW0 AP002008.2-205ENST00000637111 1091 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
VAX2Q9UIW0 AC104966.1-201ENST00000467010 1464 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
VAX2Q9UIW0 AC107027.3-201ENST00000565095 3473 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
VAX2Q9UIW0 USP8-204ENST00000425032 3559 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
VAX2Q9UIW0 CASC19-281ENST00000642118 1554 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
VAX2Q9UIW0 LINC02261-201ENST00000512873 2802 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
VAX2Q9UIW0 ZNF700-202ENST00000482090 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
VAX2Q9UIW0 SDCBP-213ENST00000630925 2076 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
VAX2Q9UIW0 SYTL2-217ENST00000528231 3536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
VAX2Q9UIW0 FAM107B-229ENST00000622567 3510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
VAX2Q9UIW0 SMAD5-212ENST00000545620 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
VAX2Q9UIW0 TES-202ENST00000393481 2763 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
VAX2Q9UIW0 BCAP29-203ENST00000379119 5773 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
VAX2Q9UIW0 OR2L5-201ENST00000355281 2429 ntAPPRIS P1 BASIC3.95□□□□□ -1.78
VAX2Q9UIW0 PIGN-242ENST00000640145 4505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
VAX2Q9UIW0 STON1-GTF2A1L-203ENST00000402114 3790 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
VAX2Q9UIW0 MYRFL-201ENST00000299350 820 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
VAX2Q9UIW0 CLEC7A-202ENST00000304084 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
VAX2Q9UIW0 OR56A3-201ENST00000329564 948 ntAPPRIS P1 BASIC3.95□□□□□ -1.78
VAX2Q9UIW0 AC008549.2-201ENST00000333482 706 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
VAX2Q9UIW0 AC106870.1-201ENST00000359823 200 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
VAX2Q9UIW0 RNU1-83P-201ENST00000363426 164 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
VAX2Q9UIW0 RNA5SP232-201ENST00000364144 119 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
VAX2Q9UIW0 RN7SKP171-201ENST00000364417 303 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
VAX2Q9UIW0 OR5L2-201ENST00000378397 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.95□□□□□ -1.78
VAX2Q9UIW0 IFNA8-201ENST00000380205 1039 ntAPPRIS P1 BASIC3.95□□□□□ -1.78
VAX2Q9UIW0 AMELX-202ENST00000380712 835 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
VAX2Q9UIW0 AMELX-203ENST00000380714 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
VAX2Q9UIW0 CCL7-203ENST00000394630 687 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
VAX2Q9UIW0 PPP1R7-203ENST00000401987 820 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
VAX2Q9UIW0 STON1-GTF2A1L-204ENST00000405008 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
VAX2Q9UIW0 GLS-203ENST00000409215 632 ntTSL 4 BASIC3.95□□□□□ -1.78
VAX2Q9UIW0 GLS-204ENST00000409428 816 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
VAX2Q9UIW0 AC097717.1-233ENST00000413557 460 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
VAX2Q9UIW0 AC010745.4-201ENST00000420130 740 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
VAX2Q9UIW0 AL021153.1-201ENST00000427360 308 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
VAX2Q9UIW0 PPIAP13-201ENST00000434706 478 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
VAX2Q9UIW0 TH2LCRR-202ENST00000435042 472 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
VAX2Q9UIW0 AL450996.1-201ENST00000445574 1202 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
VAX2Q9UIW0 AL035551.1-201ENST00000446931 348 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
VAX2Q9UIW0 AC107072.1-201ENST00000449007 110 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
VAX2Q9UIW0 AC132807.1-201ENST00000449613 458 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
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VAX2Q9UIW0 BBIP1-208ENST00000454061 812 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
VAX2Q9UIW0 AC068228.1-201ENST00000461723 211 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
VAX2Q9UIW0 GTPBP8-204ENST00000467752 686 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
VAX2Q9UIW0 ARPP21-231ENST00000474696 572 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
VAX2Q9UIW0 PFN1P8-201ENST00000497012 543 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
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VAX2Q9UIW0 OR51K1P-201ENST00000510214 950 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
VAX2Q9UIW0 SPINK9-202ENST00000511717 604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
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VAX2Q9UIW0 snoU109.6-201ENST00000516831 118 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
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VAX2Q9UIW0 LINC02284-202ENST00000560924 566 ntTSL 4 BASIC3.95□□□□□ -1.78
VAX2Q9UIW0 AC092123.1-202ENST00000565310 405 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
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VAX2Q9UIW0 AC114684.1-201ENST00000587659 352 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
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VAX2Q9UIW0 OR8H1-202ENST00000610894 927 ntAPPRIS ALT1 BASIC3.95□□□□□ -1.78
VAX2Q9UIW0 AC015722.2-201ENST00000622210 551 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
VAX2Q9UIW0 UGT2B4-207ENST00000639621 1154 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
VAX2Q9UIW0 TM4SF1-202ENST00000472441 3115 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
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VAX2Q9UIW0 YES1P1-201ENST00000418510 1628 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
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VAX2Q9UIW0 LINC01189-201ENST00000428440 3321 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
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VAX2Q9UIW0 OR10K1-203ENST00000641432 3775 ntAPPRIS P1 BASIC3.94□□□□□ -1.78
VAX2Q9UIW0 KCNU1-201ENST00000399881 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
VAX2Q9UIW0 ZBTB21-201ENST00000310826 7449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
VAX2Q9UIW0 LINC02476-201ENST00000426413 1577 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
VAX2Q9UIW0 TAB3-204ENST00000378932 3698 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
VAX2Q9UIW0 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
VAX2Q9UIW0 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
VAX2Q9UIW0 MS4A1-202ENST00000389939 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
VAX2Q9UIW0 CLPS-201ENST00000259938 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
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VAX2Q9UIW0 COX6B1P3-201ENST00000312310 260 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
VAX2Q9UIW0 YAF2-202ENST00000380790 1211 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
VAX2Q9UIW0 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
VAX2Q9UIW0 RPL34-203ENST00000394668 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
VAX2Q9UIW0 VDAC1P9-201ENST00000412766 841 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
VAX2Q9UIW0 AC087380.1-202ENST00000415970 1163 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
VAX2Q9UIW0 SRSF1P1-201ENST00000424058 520 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
VAX2Q9UIW0 AL031428.1-201ENST00000427154 666 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
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