Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 AC073333.1-201ENST00000418907 648 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CLDN19Q8N6F1 AL592078.1-201ENST00000421866 321 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CLDN19Q8N6F1 RCC2P2-201ENST00000422174 918 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CLDN19Q8N6F1 AC104333.2-201ENST00000422630 192 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CLDN19Q8N6F1 FMR1-IT1-201ENST00000441414 343 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CLDN19Q8N6F1 AC009487.1-201ENST00000444164 403 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
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CLDN19Q8N6F1 AL035454.1-201ENST00000470758 433 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CLDN19Q8N6F1 AC104071.1-201ENST00000505636 602 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
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CLDN19Q8N6F1 L34079.2-201ENST00000597119 561 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CLDN19Q8N6F1 AC104687.2-201ENST00000604442 342 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
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CLDN19Q8N6F1 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CLDN19Q8N6F1 AC087632.1-216ENST00000625619 487 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
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CLDN19Q8N6F1 ZNF273-204ENST00000476120 2000 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
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CLDN19Q8N6F1 HGF-201ENST00000222390 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
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CLDN19Q8N6F1 IL5-201ENST00000231454 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
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CLDN19Q8N6F1 OR10A5-201ENST00000299454 1054 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CLDN19Q8N6F1 AC135895.1-201ENST00000360528 1058 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CLDN19Q8N6F1 SH3BGR-203ENST00000380634 816 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CLDN19Q8N6F1 RNU6-1320P-201ENST00000390838 107 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CLDN19Q8N6F1 RNU6-1269P-201ENST00000391139 107 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CLDN19Q8N6F1 TBCAP2-201ENST00000416175 326 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
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