Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 AC093770.1-201ENST00000511559 571 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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CLIP4Q8N3C7 MTND1P33-201ENST00000446251 917 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
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