Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 C1orf162-201ENST00000343534 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
SYNE4Q8N205 RNU6-1000P-201ENST00000391066 106 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SYNE4Q8N205 U3.28-201ENST00000391249 210 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SYNE4Q8N205 AL589655.1-201ENST00000405398 482 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SYNE4Q8N205 AL512504.1-201ENST00000415494 778 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SYNE4Q8N205 AC013268.2-201ENST00000420753 337 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SYNE4Q8N205 AL512661.1-201ENST00000434586 1253 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SYNE4Q8N205 AL590399.4-201ENST00000436561 601 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SYNE4Q8N205 AL138878.2-201ENST00000440581 1241 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SYNE4Q8N205 AC007179.2-204ENST00000444001 765 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SYNE4Q8N205 Z83846.1-201ENST00000446798 265 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SYNE4Q8N205 CASP12-207ENST00000447913 819 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
SYNE4Q8N205 AC009158.1-205ENST00000452511 895 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SYNE4Q8N205 AL445669.2-201ENST00000454425 421 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SYNE4Q8N205 AC093166.2-201ENST00000455969 1017 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SYNE4Q8N205 AL359915.2-203ENST00000457043 540 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SYNE4Q8N205 AC026316.2-201ENST00000473110 263 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SYNE4Q8N205 STRADBP1-201ENST00000478954 1281 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SYNE4Q8N205 TRBV8-1-201ENST00000481590 279 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SYNE4Q8N205 IGBP1P4-201ENST00000503202 879 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SYNE4Q8N205 AC117383.1-201ENST00000507698 422 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SYNE4Q8N205 BTF3P13-201ENST00000513224 490 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SYNE4Q8N205 AC012400.1-201ENST00000518452 381 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SYNE4Q8N205 EDDM3DP-201ENST00000554692 434 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SYNE4Q8N205 AL163932.1-201ENST00000555776 542 ntTSL 4 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SYNE4Q8N205 AL139022.1-201ENST00000556127 486 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SYNE4Q8N205 LINC02188-201ENST00000562064 550 ntTSL 4 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SYNE4Q8N205 C15orf65-201ENST00000569691 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
SYNE4Q8N205 AC096586.2-201ENST00000610260 441 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SYNE4Q8N205 AL445493.3-201ENST00000619568 477 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SYNE4Q8N205 MIR7703-201ENST00000620784 77 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SYNE4Q8N205 LINC01359-206ENST00000634775 888 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SYNE4Q8N205 NRCAM-210ENST00000425651 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
SYNE4Q8N205 DGKB-203ENST00000403951 6917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SYNE4Q8N205 ZNF83-202ENST00000536937 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SYNE4Q8N205 TLR5-205ENST00000540964 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SYNE4Q8N205 C2orf16-201ENST00000408964 6200 ntAPPRIS P2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
SYNE4Q8N205 OR4G1P-202ENST00000641173 1788 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
SYNE4Q8N205 DGKH-210ENST00000628433 3449 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SYNE4Q8N205 SERPINI2-206ENST00000471111 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
SYNE4Q8N205 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SYNE4Q8N205 UNC79-203ENST00000553484 9100 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SYNE4Q8N205 GEN1-202ENST00000381254 6367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SYNE4Q8N205 DNAH12-203ENST00000389536 2613 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SYNE4Q8N205 TRAPPC13-201ENST00000231526 2715 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SYNE4Q8N205 OR6C4-203ENST00000641851 4989 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SYNE4Q8N205 GAPDHP15-201ENST00000398586 975 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SYNE4Q8N205 AC073464.3-201ENST00000422564 712 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SYNE4Q8N205 AC016712.1-201ENST00000431088 378 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SYNE4Q8N205 AL450992.2-201ENST00000434182 506 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SYNE4Q8N205 TRIM31-AS1-204ENST00000440874 549 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SYNE4Q8N205 MTND5P8-201ENST00000449817 1083 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SYNE4Q8N205 SATB1-AS1-204ENST00000453361 726 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SYNE4Q8N205 AC069277.2-201ENST00000454211 432 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SYNE4Q8N205 C1DP3-201ENST00000455013 423 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SYNE4Q8N205 PANCR-201ENST00000503456 493 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SYNE4Q8N205 NAMPTP2-201ENST00000505629 1115 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SYNE4Q8N205 RN7SKP287-201ENST00000516546 266 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SYNE4Q8N205 AC008751.2-201ENST00000597885 980 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SYNE4Q8N205 AP001267.4-201ENST00000602598 545 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SYNE4Q8N205 LINC00632-204ENST00000602830 597 ntTSL 4 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SYNE4Q8N205 AL161616.1-201ENST00000611867 286 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SYNE4Q8N205 AC005156.1-201ENST00000613371 573 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SYNE4Q8N205 AC079395.3-201ENST00000615161 484 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
SYNE4Q8N205 RBMS3-AS3-202ENST00000635847 738 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SYNE4Q8N205 FOXP2-204ENST00000390668 1472 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
SYNE4Q8N205 RABGEF1-202ENST00000380828 3864 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SYNE4Q8N205 MYO3B-202ENST00000408978 5529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
SYNE4Q8N205 SELL-201ENST00000236147 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SYNE4Q8N205 SLC4A10-202ENST00000375514 5710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SYNE4Q8N205 NEGR1-202ENST00000357731 12811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SYNE4Q8N205 LINC02141-201ENST00000568279 6586 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SYNE4Q8N205 ZNF224-201ENST00000336976 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SYNE4Q8N205 ZEB1-219ENST00000560721 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SYNE4Q8N205 LINC01478-201ENST00000587877 2068 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SYNE4Q8N205 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SYNE4Q8N205 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SYNE4Q8N205 ELOVL6-202ENST00000394607 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SYNE4Q8N205 PDCL2-201ENST00000295645 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SYNE4Q8N205 OR10A5-201ENST00000299454 1054 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SYNE4Q8N205 GNAS-202ENST00000306090 477 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SYNE4Q8N205 OR10AG1-201ENST00000312345 1016 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SYNE4Q8N205 AC126755.2-208ENST00000327792 462 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SYNE4Q8N205 AC138969.1-213ENST00000331436 462 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SYNE4Q8N205 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SYNE4Q8N205 CXorf66-201ENST00000370540 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SYNE4Q8N205 RNU6-152P-201ENST00000384037 107 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SYNE4Q8N205 AC092111.3-201ENST00000402465 496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SYNE4Q8N205 MTERF4-204ENST00000406593 802 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SYNE4Q8N205 RN7SKP114-201ENST00000410327 279 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SYNE4Q8N205 AL133268.3-201ENST00000428903 577 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SYNE4Q8N205 AL450384.1-201ENST00000433526 413 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SYNE4Q8N205 AC073062.1-201ENST00000434509 455 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SYNE4Q8N205 MTND1P33-201ENST00000446251 917 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SYNE4Q8N205 Z99916.1-201ENST00000454253 482 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SYNE4Q8N205 AC073218.1-201ENST00000458413 171 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SYNE4Q8N205 AC104629.2-201ENST00000468627 598 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SYNE4Q8N205 AC068587.1-201ENST00000483613 781 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SYNE4Q8N205 NECTIN3-AS1-205ENST00000491709 792 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SYNE4Q8N205 UBA6-AS1-204ENST00000502758 547 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.3 ms