Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 AC018467.1-203ENST00000440785 506 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 AC073850.1-201ENST00000449243 255 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 LINC01436-201ENST00000457157 1048 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 TPPP2-202ENST00000460647 568 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 AC108161.1-201ENST00000461060 402 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 AC092691.2-201ENST00000461787 803 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 AC104982.1-201ENST00000478775 574 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 METTL15P1-201ENST00000481421 1045 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 AC058823.1-201ENST00000485315 474 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 AC005412.2-201ENST00000492004 341 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 AC010627.1-201ENST00000503819 1294 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 LINC02200-202ENST00000508879 615 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 LNX1-AS1-204ENST00000514364 495 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 RNA5SP228-201ENST00000516232 133 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 LDHC-203ENST00000535809 757 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 LDHC-205ENST00000537486 583 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 AC007688.2-201ENST00000545158 369 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 AC091814.1-201ENST00000545258 719 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 AC144548.2-201ENST00000550231 946 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 AL512310.9-201ENST00000553311 948 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 OR11H3P-201ENST00000554547 982 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 AC103810.2-203ENST00000584959 631 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 AC091132.5-204ENST00000586348 630 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 AC009163.6-201ENST00000612367 342 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 AL158062.1-201ENST00000619632 745 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 AC007275.1-201ENST00000621243 671 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 AC090617.9-201ENST00000623751 147 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 AC135068.5-201ENST00000624197 983 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 TCP1P3-201ENST00000414406 1498 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 AC124017.1-201ENST00000508112 1594 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 AC104964.3-201ENST00000606115 2860 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 MIR4500HG-201ENST00000436290 1675 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 RPE65-201ENST00000262340 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 CASC1-201ENST00000320267 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 AC089984.1-201ENST00000552780 1431 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 AC083899.1-201ENST00000454465 3819 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 HSPA8P18-201ENST00000439846 1928 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 LRRK2-201ENST00000298910 9158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 FAM205BP-203ENST00000455647 3752 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 ZNF521-201ENST00000361524 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 ESRRG-219ENST00000487276 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 PPP1R42-201ENST00000324682 1084 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 RPL26P37-201ENST00000411983 438 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
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TCIRG1Q13488 AC093084.1-201ENST00000424233 687 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
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TCIRG1Q13488 LINC01867-201ENST00000435357 604 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
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TCIRG1Q13488 ELOCP16-201ENST00000444494 332 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 AL122001.1-201ENST00000457027 370 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 AC006148.2-201ENST00000467017 650 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 AC068756.1-201ENST00000482003 403 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
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TCIRG1Q13488 LINC02097-201ENST00000419257 2063 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 TERB1-203ENST00000558713 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 TRIP12-204ENST00000389045 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 ELOVL6-202ENST00000394607 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 KIAA1109-201ENST00000264501 15896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 FAM205A-201ENST00000378788 4225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 OFD1P6Y-201ENST00000432335 1637 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 TTTY9B-201ENST00000433794 1637 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 ADAM29-213ENST00000615367 3386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 NLRP11-204ENST00000592953 3077 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 ABCA10-201ENST00000269081 6362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 DNM1P47-203ENST00000571780 12667 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 SLC7A11-201ENST00000280612 9645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 SH3YL1-203ENST00000403657 3540 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 AC107021.2-201ENST00000567714 2095 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 ZNF90P1-201ENST00000480493 1951 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 AC023421.1-201ENST00000590535 1785 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 NDRG3-202ENST00000359675 2917 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 AC003973.3-201ENST00000624863 2822 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 DOPEY1-201ENST00000237163 7995 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 OR8G5-203ENST00000641992 1560 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 AL359955.1-201ENST00000455242 3275 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 U3.10-201ENST00000364459 214 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 TAF9BP2-201ENST00000400856 499 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 AL109941.1-201ENST00000401925 229 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
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