Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 FBXW12-203ENST00000436231 1117 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 TXNP5-201ENST00000441043 315 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AL935212.3-201ENST00000450729 284 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AL365318.1-201ENST00000453128 705 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 RN7SL706P-201ENST00000460079 292 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 TAF8-207ENST00000482432 556 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 LEKR1-206ENST00000483177 546 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 CREM-236ENST00000487763 429 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AC093722.1-201ENST00000504882 489 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AC069208.1-201ENST00000540811 676 ntTSL 4 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 PRR13-204ENST00000547368 688 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 NELL2-211ENST00000548826 559 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 LINC02277-201ENST00000553386 453 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 TRIM69-204ENST00000558329 1211 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 TEX46-202ENST00000566855 510 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AC011516.1-201ENST00000599129 180 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 ZNF675-204ENST00000599168 592 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 BCRP9-201ENST00000605312 388 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 CACNB2-213ENST00000612134 3825 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AC211433.3-201ENST00000623770 375 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 MIR665-201ENST00000635949 72 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 PEAK1-202ENST00000558305 4644 ntTSL 4 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 CAST-236ENST00000511782 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 CEP97-206ENST00000494050 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 DGKB-205ENST00000406247 3257 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 FAR2P1-201ENST00000325390 3679 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 HPSE2-204ENST00000404542 3681 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 SLC30A6-201ENST00000282587 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AC009690.2-201ENST00000570175 3148 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 MYLK-206ENST00000418370 7282 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AGXT2-201ENST00000231420 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AC090198.1-201ENST00000518639 2355 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 MMS22L-201ENST00000275053 8643 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 OR10K2-202ENST00000641042 3023 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 LINC00922-203ENST00000569736 1760 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 C9orf135-AS1-201ENST00000439418 1375 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AL137058.3-201ENST00000624531 3099 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 CORO1C-202ENST00000420959 3921 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AC021074.3-201ENST00000476385 1825 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 LPAR1-205ENST00000541779 2490 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 HKR1-201ENST00000324411 2929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 TMPRSS11F-201ENST00000356291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 SPRY1-202ENST00000394339 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 NAMPTP1-201ENST00000440465 2514 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 SLC37A3-202ENST00000340308 2955 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 FASLG-202ENST00000367721 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 ERAP1-202ENST00000443439 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 HYDIN2-203ENST00000614586 13885 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AL592429.1-201ENST00000403909 1473 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 WDYHV1-208ENST00000523984 1491 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 PSMC2-203ENST00000435765 3054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 IL1RAP-201ENST00000072516 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 CTAGE3P-201ENST00000454280 2404 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 OR9K1P-201ENST00000326513 941 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AC005294.1-201ENST00000355509 281 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 RNU6-777P-201ENST00000364265 104 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 MUC1-209ENST00000368396 516 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 S100A9-201ENST00000368738 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 MIR506-201ENST00000384998 124 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 SNRPD3-202ENST00000402849 567 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 ZSCAN12P1-201ENST00000406489 419 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 ATP5JP1-201ENST00000431631 322 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 CACYBPP1-201ENST00000438592 684 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AL353754.1-201ENST00000440219 340 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 CXCR2P1-202ENST00000443392 1074 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AL133319.1-201ENST00000447848 777 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 CYCSP44-201ENST00000448560 313 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AC068631.1-205ENST00000455926 409 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 HNRNPDLP3-201ENST00000456745 380 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 RN7SL372P-201ENST00000461982 298 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 RPL34P34-201ENST00000465389 354 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 MYL6P4-201ENST00000477911 453 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 RPS3AP50-201ENST00000487064 803 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AL035404.1-201ENST00000497982 568 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AC112206.2-201ENST00000503106 557 ntTSL 4 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AC105914.2-201ENST00000507525 233 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AC063979.2-201ENST00000513767 958 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AC106800.2-201ENST00000514009 1103 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 LINC01489-201ENST00000542689 605 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
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