Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUW8

TDP1, Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 608 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDP1Q9NUW8 AC073254.1-207ENST00000600482 714 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 AC010245.2-201ENST00000606908 1167 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 AC092683.1-209ENST00000612970 1105 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 AC010975.3-201ENST00000618727 978 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 TADA2A-212ENST00000620367 1043 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 GPR34-203ENST00000620846 1282 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 AC069234.4-201ENST00000621276 412 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 ST6GALNAC3-203ENST00000621530 617 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 AC026422.1-201ENST00000623961 452 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 AC024023.1-201ENST00000624530 922 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 ZNF546-201ENST00000347077 7987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 BIRC3-207ENST00000615299 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 NOS1-201ENST00000317775 12158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 RABGAP1L-203ENST00000347255 1744 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 KBTBD3-201ENST00000526793 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 CALN1-203ENST00000395276 9189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 OR2AG1-202ENST00000641258 6993 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 POGZ-213ENST00000491586 4130 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 C17orf105-201ENST00000449302 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 RANBP3L-202ENST00000502994 2278 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 TOP2B-201ENST00000264331 5358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 ALKBH8-205ENST00000428149 4079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 CALN1-204ENST00000405452 8571 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 POLR1D-218ENST00000636817 4592 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 SCAPER-207ENST00000563290 5028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 ST7-204ENST00000393444 2113 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 AC116158.1-201ENST00000560231 2129 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 ARIH1-201ENST00000379887 21681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 STAG2-202ENST00000371144 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 GAPDHP24-201ENST00000328713 983 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 RNA5SP27-201ENST00000363839 119 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 RNU4-7P-201ENST00000364758 141 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 AL139095.4-201ENST00000379928 500 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 S100G-201ENST00000380200 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 SNORA70H-201ENST00000383910 135 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 RNU6-224P-201ENST00000384055 107 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 SNORA70J-201ENST00000384182 135 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 Y_RNA.472-201ENST00000384322 102 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 AC007179.2-204ENST00000444001 765 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 AL513412.1-201ENST00000445708 553 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 OR7E116P-201ENST00000448529 957 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 AC017067.1-201ENST00000448570 447 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 CD200R1L-202ENST00000448932 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 AL035446.1-201ENST00000455011 453 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 FO393415.3-201ENST00000456424 375 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 AC004129.2-201ENST00000457229 287 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 AC100832.1-201ENST00000471945 383 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 AC082651.2-201ENST00000496833 166 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 AC023050.1-201ENST00000498198 304 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 AC012055.1-201ENST00000511346 1144 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 AC246817.2-206ENST00000520570 582 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 MAL2-207ENST00000522828 603 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 AC025370.1-201ENST00000523775 583 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 AP001267.3-202ENST00000525992 448 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 LINC01493-201ENST00000530102 460 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 CDKN3-206ENST00000541304 1070 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 AC006518.2-201ENST00000542513 940 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 AC090109.1-201ENST00000548885 819 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 AC126615.2-201ENST00000553003 515 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 MRPS21P7-201ENST00000566937 238 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
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TDP1Q9NUW8 AC244517.5-203ENST00000624778 517 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
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TDP1Q9NUW8 LZTFL1-215ENST00000536047 4342 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 ZFYVE16-206ENST00000510158 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
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TDP1Q9NUW8 ESRRG-208ENST00000391890 5542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 NFE2L2-206ENST00000446151 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 FGL1-209ENST00000522444 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 DCX-211ENST00000637570 6162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 AC127164.1-201ENST00000548738 4196 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 FSCB-201ENST00000340446 2938 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 KLHL4-201ENST00000373114 2445 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 ZNF33A-203ENST00000432900 3994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 TBC1D32-204ENST00000398212 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 HOMER1-201ENST00000282260 774 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 NDRG3-201ENST00000349004 2964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 RNA5SP319-201ENST00000362768 119 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 RNU6-1263P-201ENST00000384601 106 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 DNAJC19P6-201ENST00000401853 280 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 BTBD9-203ENST00000403056 1155 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 AL136310.1-201ENST00000404926 654 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 AF015720.1-201ENST00000412240 349 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 AP000534.2-201ENST00000412729 568 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 BTF3P8-201ENST00000414577 526 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 RPS7P9-201ENST00000414704 586 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
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