Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 RNA5SP114-201ENST00000363780 113 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 XAGE1A-202ENST00000375600 474 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 XAGE1B-202ENST00000375613 474 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 MIR191-201ENST00000384873 92 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 MT-TR-201ENST00000387439 65 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AC073264.1-201ENST00000411508 416 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 LINC00396-201ENST00000411690 439 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 FAM230B-202ENST00000415704 396 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AL672212.1-201ENST00000422246 400 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AC073900.1-201ENST00000429766 776 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AC239803.1-202ENST00000432038 590 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 RPEP2-201ENST00000432149 701 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AC244505.2-201ENST00000435089 759 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AC016722.1-201ENST00000453936 652 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 RPL31P11-202ENST00000454082 372 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AC013727.1-202ENST00000455716 580 ntTSL 4 BASIC6.96□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 RN7SL868P-201ENST00000485915 303 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AC083800.1-201ENST00000490594 246 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AC138517.1-201ENST00000515724 568 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AC103843.1-201ENST00000527318 682 ntTSL 4 BASIC6.96□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AC024405.1-201ENST00000532521 1042 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AL109766.1-201ENST00000555080 552 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 LINC00519-201ENST00000557518 682 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AC009117.1-201ENST00000563948 554 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC6.96□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AC019322.1-201ENST00000571869 389 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AC015912.1-201ENST00000574826 538 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AC012447.1-201ENST00000577914 682 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 MIR5682-201ENST00000584864 76 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AL589935.1-223ENST00000587015 808 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AC007786.1-202ENST00000590607 443 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 KCNMA1-AS1-204ENST00000595702 504 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AL953862.2-201ENST00000603089 820 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AC092032.1-201ENST00000603090 165 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AC104785.1-201ENST00000603220 588 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AC009027.1-201ENST00000604510 479 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 TP53TG1_2.1-201ENST00000611226 182 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AC023509.5-201ENST00000617434 807 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AC092683.1-207ENST00000620051 837 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 SOX9-AS1-218ENST00000628742 733 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 LINC01232-205ENST00000630421 1002 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 SNORA43.5-201ENST00000631270 138 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AC026634.1-201ENST00000634369 198 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 MIR193BHG-214ENST00000641765 509 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AL356585.10-201ENST00000641883 123 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 NOS2P3-202ENST00000458685 3328 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 OLR1-201ENST00000309539 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 SLC16A4-210ENST00000541986 2496 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 UGT2B27P-201ENST00000505092 1620 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 CENPN-205ENST00000439957 1699 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 ALS2-201ENST00000264276 6644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 NSD2-224ENST00000514045 3964 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 TNRC6A-202ENST00000395799 8438 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 PTPN14-205ENST00000543945 3842 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 ZNF396-201ENST00000306346 2788 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 CABS1-201ENST00000273936 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 TSPAN8-202ENST00000393330 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 GPX5-201ENST00000412168 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AC010894.3-201ENST00000442996 2400 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 DEPDC1B-201ENST00000265036 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 ACO1-201ENST00000309951 7466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 CKAP2L-201ENST00000302450 4533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 ZMYND8-211ENST00000446994 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 SLC17A4-202ENST00000397076 2331 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 CENPI-204ENST00000423383 2314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 LUARIS-201ENST00000436105 2916 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 TXNIP-204ENST00000582401 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 LEO1-201ENST00000299601 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 GALNT11-201ENST00000415421 2555 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AC012668.3-202ENST00000417485 1642 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 PROM1-206ENST00000505450 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 TOPORS-202ENST00000379858 3621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 OR5J1P-201ENST00000313544 939 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 OR52H1-201ENST00000322653 1057 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 MIR621-201ENST00000384919 96 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 ATP5E-203ENST00000395663 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 CREM-214ENST00000395887 849 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 GGA1-205ENST00000405147 575 ntTSL 4 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 MIR1305-201ENST00000408300 86 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 IFNAR2-206ENST00000413881 710 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AL691515.2-201ENST00000414765 466 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AL451164.1-201ENST00000417149 390 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 NFIA-AS2-202ENST00000421455 768 ntTSL 4 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AC023347.2-201ENST00000433994 462 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
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