Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NME3Q13232 ESRRG-202ENST00000360012 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
NME3Q13232 LCMT1-AS2-202ENST00000565214 5666 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NME3Q13232 UQCRC2P1-201ENST00000417777 1332 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NME3Q13232 HHLA2-210ENST00000491820 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
NME3Q13232 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
NME3Q13232 BAZ2B-203ENST00000392782 8058 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
NME3Q13232 LRRC53-201ENST00000294635 3859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
NME3Q13232 MAP3K7-201ENST00000369320 3328 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
NME3Q13232 OR8A1-201ENST00000284287 1146 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
NME3Q13232 RNA5SP428-201ENST00000365129 132 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NME3Q13232 RAB9AP4-201ENST00000415230 609 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NME3Q13232 AL031428.1-201ENST00000427154 666 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
NME3Q13232 AL450384.1-201ENST00000433526 413 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
NME3Q13232 KCNIP1-205ENST00000434108 726 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
NME3Q13232 AF064858.2-201ENST00000440714 292 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
NME3Q13232 AL139120.1-201ENST00000443652 358 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
NME3Q13232 AL137845.2-201ENST00000444292 988 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NME3Q13232 LRRC77P-202ENST00000463642 457 ntTSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
NME3Q13232 AC004453.1-201ENST00000487895 408 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NME3Q13232 AGGF1P3-201ENST00000493675 1213 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NME3Q13232 AL133372.2-203ENST00000508469 922 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
NME3Q13232 AC027308.1-201ENST00000517993 110 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NME3Q13232 AC006206.2-202ENST00000537714 648 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
NME3Q13232 AC127024.5-201ENST00000580085 462 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NME3Q13232 AC006504.5-201ENST00000588122 655 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
NME3Q13232 AC117490.2-201ENST00000610042 594 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NME3Q13232 Metazoa_SRP.55-201ENST00000618452 275 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NME3Q13232 AP000550.3-201ENST00000637734 379 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NME3Q13232 VDAC3-201ENST00000022615 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
NME3Q13232 ECT2L-201ENST00000367682 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
NME3Q13232 CD69-201ENST00000228434 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
NME3Q13232 MARCH1-202ENST00000339875 2476 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
NME3Q13232 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
NME3Q13232 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
NME3Q13232 AC123767.1-201ENST00000519537 1439 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
NME3Q13232 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NME3Q13232 EMSY-205ENST00000524767 4116 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
NME3Q13232 OR8B3-202ENST00000641139 2170 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NME3Q13232 IKZF3-202ENST00000346243 1296 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NME3Q13232 CHMP1B2P-201ENST00000399581 597 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NME3Q13232 METTL5-204ENST00000409340 472 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NME3Q13232 IFNA17-201ENST00000413767 980 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NME3Q13232 AC013472.2-201ENST00000416226 306 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NME3Q13232 AC013429.2-201ENST00000418798 781 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NME3Q13232 RBMY2QP-201ENST00000429799 1147 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NME3Q13232 AL133247.1-201ENST00000435713 646 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NME3Q13232 IKZF3-212ENST00000439016 1246 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NME3Q13232 RPS29P9-201ENST00000440360 171 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NME3Q13232 SNRPFP2-201ENST00000440710 251 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NME3Q13232 FAM237A-201ENST00000441223 773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NME3Q13232 LINC01704-202ENST00000442358 649 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NME3Q13232 RPL7AP61-201ENST00000443410 636 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NME3Q13232 OR7E125P-201ENST00000443450 846 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NME3Q13232 EIF4EBP2P1-201ENST00000450009 343 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NME3Q13232 AL691482.1-201ENST00000453255 87 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NME3Q13232 HMGB1P4-201ENST00000455362 567 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NME3Q13232 TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 488 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NME3Q13232 RN7SL441P-201ENST00000492388 296 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NME3Q13232 TM4SF1-AS1-202ENST00000496491 754 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NME3Q13232 ENPP7P11-201ENST00000505915 627 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NME3Q13232 AC019133.1-201ENST00000508292 420 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NME3Q13232 HAGLR-211ENST00000549329 609 ntTSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NME3Q13232 AL121839.1-201ENST00000556233 1185 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NME3Q13232 AC004862.1-203ENST00000598433 1020 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NME3Q13232 AL159169.2-201ENST00000610061 1269 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NME3Q13232 AC005972.4-201ENST00000636248 1131 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NME3Q13232 ZNRD1ASP-221ENST00000637794 1074 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NME3Q13232 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
NME3Q13232 PEX2-201ENST00000357039 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
NME3Q13232 EHBP1-202ENST00000405015 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
NME3Q13232 AC104623.2-202ENST00000623477 4002 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
NME3Q13232 HGF-201ENST00000222390 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
NME3Q13232 SMG1P4-204ENST00000523028 4131 ntBASIC5.21□□□□□ -1.57
NME3Q13232 CFH-206ENST00000630130 1658 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
NME3Q13232 CLVS1-205ENST00000519846 3622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
NME3Q13232 AC105411.1-201ENST00000568776 1470 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NME3Q13232 RGS5-212ENST00000618415 5812 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NME3Q13232 CASP10-204ENST00000346817 3926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NME3Q13232 PLCH1-201ENST00000334686 6128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
NME3Q13232 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
NME3Q13232 EAF2-201ENST00000273668 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
NME3Q13232 OR14A16-201ENST00000357627 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NME3Q13232 AL672167.2-201ENST00000377164 879 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NME3Q13232 LRRC37BP1-201ENST00000398851 714 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NME3Q13232 CTSL3P-202ENST00000412179 788 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NME3Q13232 RCC2P2-201ENST00000422174 918 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NME3Q13232 IGKV1OR9-1-201ENST00000424370 284 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NME3Q13232 AL354956.1-201ENST00000424487 467 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NME3Q13232 AL450023.3-201ENST00000440592 271 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NME3Q13232 AC009487.1-201ENST00000444164 403 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NME3Q13232 AL161722.1-201ENST00000446972 1032 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NME3Q13232 AL161630.1-201ENST00000450938 1299 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
NME3Q13232 AC093166.2-201ENST00000455969 1017 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NME3Q13232 TFDP2-211ENST00000479040 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
NME3Q13232 RN7SL319P-201ENST00000480656 221 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NME3Q13232 RPL37AP8-201ENST00000494116 276 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NME3Q13232 AC135457.1-201ENST00000503553 664 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NME3Q13232 AC119150.1-201ENST00000507143 563 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NME3Q13232 RPL37-204ENST00000508493 553 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
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