Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 SLC19A3-202ENST00000409287 644 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD13P35453 ATP6V1G1P7-201ENST00000415853 349 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD13P35453 AL390036.1-201ENST00000419428 734 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD13P35453 BX510359.3-201ENST00000422168 306 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD13P35453 MTND4P24-201ENST00000424002 397 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD13P35453 AC066595.1-201ENST00000426697 399 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD13P35453 AL357832.1-201ENST00000427460 420 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD13P35453 NDUFA5P10-201ENST00000432147 357 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD13P35453 AC023128.1-201ENST00000432431 799 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD13P35453 Z82198.2-201ENST00000434741 567 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD13P35453 MTND4P15-201ENST00000437913 1033 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD13P35453 CACYBPP1-201ENST00000438592 684 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD13P35453 IKZF3-212ENST00000439016 1246 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD13P35453 AC091685.1-201ENST00000442436 448 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD13P35453 AL606490.1-201ENST00000452266 765 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD13P35453 OR2AF1P-201ENST00000454899 889 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD13P35453 RPL7P39-201ENST00000481157 744 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD13P35453 AC005412.2-201ENST00000492004 341 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD13P35453 GTF2F2P1-201ENST00000511083 675 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD13P35453 LINC02057-202ENST00000511794 577 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD13P35453 HAPLN1-206ENST00000514416 1145 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD13P35453 AC091814.1-201ENST00000545258 719 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD13P35453 AC012464.2-201ENST00000551257 779 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD13P35453 CKS1BP1-201ENST00000555221 240 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD13P35453 AC113418.1-201ENST00000569928 517 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD13P35453 AC007922.3-201ENST00000581648 543 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD13P35453 AC015802.3-201ENST00000590241 570 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD13P35453 AC005702.2-201ENST00000591035 481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD13P35453 AC022154.1-203ENST00000594850 493 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD13P35453 AC095055.1-201ENST00000603472 1113 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD13P35453 AC006363.1-201ENST00000603806 463 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD13P35453 AL008635.1-201ENST00000609073 385 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD13P35453 PROX1-AS1-219ENST00000610094 791 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD13P35453 DUXB-201ENST00000633875 1079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD13P35453 AC135068.12-201ENST00000637370 931 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD13P35453 DAOA-212ENST00000640578 378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD13P35453 PDE5A-203ENST00000394439 6770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD13P35453 NUP107-202ENST00000378905 2859 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD13P35453 KSR2-201ENST00000339824 17726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD13P35453 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD13P35453 AC089984.1-201ENST00000552780 1431 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD13P35453 RGS4-202ENST00000367908 2606 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD13P35453 TEX26-201ENST00000380473 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD13P35453 PRUNE2-201ENST00000223609 2697 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD13P35453 MOXD1-201ENST00000336749 2950 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD13P35453 BICD1-204ENST00000548411 8811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD13P35453 FANCD2-203ENST00000419585 5185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD13P35453 TCN1-201ENST00000257264 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD13P35453 ART3-203ENST00000355810 1561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD13P35453 ZNF733P-202ENST00000444809 1573 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD13P35453 OR1L8-201ENST00000304865 1061 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD13P35453 OR51A2-201ENST00000380371 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD13P35453 MIR600-201ENST00000385007 98 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD13P35453 FAIM-204ENST00000393035 946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD13P35453 AL356057.1-202ENST00000402263 756 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD13P35453 NT5C3A-206ENST00000409787 840 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD13P35453 RN7SKP273-201ENST00000411392 314 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD13P35453 LINC01829-201ENST00000414404 571 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD13P35453 AL360227.1-201ENST00000425364 433 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD13P35453 HSPE1P16-201ENST00000426640 348 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD13P35453 HMGN2P27-201ENST00000427352 270 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD13P35453 AC005033.1-201ENST00000428904 813 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD13P35453 LINC02532-206ENST00000433965 570 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD13P35453 GAPDHP58-201ENST00000438477 1006 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD13P35453 AC006326.1-201ENST00000445465 787 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD13P35453 FAR2P1-206ENST00000449736 709 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD13P35453 AL389915.2-201ENST00000454576 441 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD13P35453 AC091976.1-201ENST00000458002 448 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD13P35453 RN7SL172P-201ENST00000460535 303 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD13P35453 OR2AO1P-201ENST00000476497 403 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD13P35453 AC079841.1-201ENST00000481228 950 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD13P35453 AC004889.1-208ENST00000489077 423 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD13P35453 AC106864.1-201ENST00000510655 640 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD13P35453 CASC19-203ENST00000523510 575 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD13P35453 AP006259.1-201ENST00000528520 561 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD13P35453 AC110275.1-201ENST00000534420 623 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD13P35453 LINC02366-202ENST00000541949 696 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD13P35453 NELL2-211ENST00000548826 559 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD13P35453 AC079035.1-201ENST00000551713 848 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD13P35453 AC084757.2-201ENST00000559165 540 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD13P35453 AC021483.2-201ENST00000567415 758 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD13P35453 RN7SL753P-201ENST00000581238 290 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD13P35453 AC104365.3-201ENST00000587011 625 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD13P35453 BNIP3P35-201ENST00000604530 490 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD13P35453 DARS-AS1-220ENST00000607985 660 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD13P35453 ZNF75A-210ENST00000617839 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD13P35453 AC008115.4-201ENST00000619780 775 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD13P35453 ZNF479-203ENST00000620639 1239 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD13P35453 OR2L8-201ENST00000623922 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD13P35453 PCBP1-AS1-278ENST00000625518 864 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD13P35453 AC093495.1-217ENST00000627385 428 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD13P35453 SLC1A3-201ENST00000265113 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
HOXD13P35453 IKZF2-207ENST00000434687 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
HOXD13P35453 ESRRG-206ENST00000366938 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
HOXD13P35453 ZNF431-201ENST00000311048 13894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
HOXD13P35453 SLC4A4-202ENST00000340595 7640 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
HOXD13P35453 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
HOXD13P35453 TRIM51GP-201ENST00000534741 1350 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
HOXD13P35453 ARHGEF6-203ENST00000370622 4779 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
HOXD13P35453 AC105411.1-201ENST00000568776 1470 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.5 ms