Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 SAMSN1-206ENST00000619120 2028 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 KSR2-202ENST00000425217 17008 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 USF3-202ENST00000478658 8461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 CYP2C8-210ENST00000535898 1799 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 SLFN12L-205ENST00000628453 1767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 LMNTD1-207ENST00000539744 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 AL034549.2-201ENST00000618285 3373 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 CNTN1-202ENST00000348761 3328 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 CSPP1-201ENST00000262210 4367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 RAB3GAP1-207ENST00000539493 3161 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 NPY6R-202ENST00000510937 2988 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 AC022417.1-201ENST00000624768 1303 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 OR5AN1-203ENST00000641998 7647 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 LIMA1-203ENST00000547825 3920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 SNURFL-201ENST00000309296 343 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 RNU6-670P-201ENST00000364312 104 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 SNORA5.1-201ENST00000384275 131 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 DEFB113-201ENST00000398718 249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 OR4K12P-201ENST00000406538 961 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 COX6B1P1-201ENST00000415962 213 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 IL23R-203ENST00000425614 1295 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 AL136140.1-201ENST00000436113 473 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 AC016292.1-201ENST00000438344 235 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 AC245427.2-201ENST00000438839 263 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 TRY2P-201ENST00000448860 689 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 AC092754.1-201ENST00000472975 479 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 RN7SL481P-201ENST00000477764 299 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 AC000372.1-201ENST00000488818 646 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 OR9N1P-201ENST00000491296 333 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 EDNRA-204ENST00000506066 1032 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 ACTR6P1-201ENST00000514311 1104 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 ZFAND1-208ENST00000519523 698 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 AC092112.1-201ENST00000538329 640 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 YWHABP2-201ENST00000540201 713 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 AC007527.1-202ENST00000543347 382 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 BNIP3P1-201ENST00000547295 580 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 TWF1-207ENST00000548315 1170 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 AL929601.2-201ENST00000549951 381 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 LINC00871-201ENST00000555246 408 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 C14orf2-211ENST00000557040 472 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 AC126323.3-201ENST00000565136 564 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 AC046158.2-201ENST00000568764 707 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 uc_338.18-201ENST00000615451 175 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 OR2A7-202ENST00000641841 2062 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ACTN1P12814 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 CYP3A43-201ENST00000222382 1515 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 BICRAL-201ENST00000314073 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 TRAPPC13-201ENST00000231526 2715 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 ARHGAP5-210ENST00000556611 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 MAPK10-263ENST00000641052 4307 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 RNU2-22P-201ENST00000411266 212 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 AC062021.1-201ENST00000429008 557 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 AL139819.1-201ENST00000429420 471 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 SPATA13-AS1-201ENST00000430733 433 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 RPS29P33-201ENST00000456717 146 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 AC097484.1-201ENST00000471148 389 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 RPL7P16-201ENST00000479738 738 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 PLGLA-202ENST00000482249 475 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 AC058823.1-201ENST00000485315 474 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 AC093763.1-201ENST00000512464 699 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 AC018682.2-201ENST00000517716 399 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 RAB9BP1-201ENST00000519581 626 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 ARL6IP1P3-201ENST00000524544 560 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 AP002373.2-201ENST00000541631 1060 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 MIR4307HG-201ENST00000548170 822 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 AC016987.1-201ENST00000558587 499 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 LINC02157-201ENST00000558885 447 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 C15orf41-205ENST00000563167 772 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 FOPNL-207ENST00000575073 530 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 AC006116.4-201ENST00000589671 452 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 MIR378J-201ENST00000611988 109 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 AC104307.1-201ENST00000616142 196 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 AC008691.1-207ENST00000636819 4154 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 GHR-207ENST00000537449 4419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 NPSR1-AS1-202ENST00000419766 4821 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 LINC01676-202ENST00000435253 1849 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 RGS6-204ENST00000404301 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 RGS6-206ENST00000407322 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 DOCK9-207ENST00000442173 7643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 GJA9-201ENST00000357771 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 PI15-202ENST00000523773 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 AC092111.2-201ENST00000611627 1414 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 ZNF765-201ENST00000396408 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 ATP2C1-210ENST00000505330 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 OR56A4-202ENST00000641156 3768 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
ACTN1P12814 LINC02203-203ENST00000625989 1600 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 190.7 ms