Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 NRCAM-210ENST00000425651 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 SRSF3-202ENST00000373715 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 WDR72-208ENST00000614174 4224 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 ANKRD12-201ENST00000262126 11288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 ADAMTS9-AS2-203ENST00000481312 1970 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 GCNT2-203ENST00000379597 4525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 FGFR2-218ENST00000478859 3990 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 CHN1-204ENST00000409597 1445 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 LINC00702-203ENST00000608792 6300 ntTSL 4 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 ZNF780A-205ENST00000594395 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 DGKB-202ENST00000402815 5595 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 ATP13A4-204ENST00000400270 1458 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AC125793.1-201ENST00000565238 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 SCARB2-207ENST00000638295 4507 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 TCF12-213ENST00000559703 1544 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 SRGAP1-207ENST00000631006 8406 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AL158064.2-205ENST00000640346 4082 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 RPL6-201ENST00000202773 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 OCM2-201ENST00000257627 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 DEFB1-201ENST00000297439 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 RN7SKP130-201ENST00000364924 301 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 RNU6-1011P-201ENST00000384668 107 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 UBBP1-201ENST00000392399 473 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 LDHAP5-201ENST00000394996 622 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AC084030.1-202ENST00000413385 880 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 LINC01198-201ENST00000416521 500 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AL160163.1-201ENST00000417465 403 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AP001136.1-201ENST00000425058 635 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AL031767.1-201ENST00000426374 386 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AP003385.1-201ENST00000426387 893 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AC010148.1-201ENST00000427619 707 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AL158212.1-201ENST00000428766 315 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AC009227.2-201ENST00000432599 511 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 ENOX1-AS2-201ENST00000434273 609 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AC087501.1-201ENST00000445617 715 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 CASP12-206ENST00000446862 1196 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 DPP10-AS2-201ENST00000446992 624 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AC009244.1-201ENST00000450566 258 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AP000302.1-201ENST00000450928 666 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 OR9M1P-201ENST00000459641 921 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 PLSCR5-AS1-201ENST00000473817 450 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 SCG5-207ENST00000497208 949 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 LINC00483-204ENST00000502517 940 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 RCHY1-206ENST00000507014 650 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AC008572.1-201ENST00000507269 442 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AC096661.1-201ENST00000515870 822 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 SCARNA11.1-201ENST00000516918 132 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AZIN1-AS1-208ENST00000519257 619 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AC015468.2-201ENST00000519605 550 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AC092709.1-201ENST00000521355 1045 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AC130366.1-201ENST00000526505 1192 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 KCTD9P4-201ENST00000526766 1166 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 OR52K3P-201ENST00000531655 943 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AC116535.2-201ENST00000532365 441 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 ELK3-206ENST00000552142 1242 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AL121839.1-201ENST00000556233 1185 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AC066612.2-201ENST00000559875 695 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 NR2F2-AS1-208ENST00000560395 441 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AC026462.4-202ENST00000564331 532 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AC040977.1-201ENST00000573222 343 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AC008770.4-201ENST00000586394 468 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AC106028.5-201ENST00000610332 395 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AC007497.1-201ENST00000610421 561 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 HOXA11-AS1_3.1-201ENST00000613383 98 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AC004241.2-201ENST00000614562 444 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AC005858.3-201ENST00000624756 589 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 TEX41-256ENST00000626411 368 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 RORB-201ENST00000376896 9551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 ZNF92-201ENST00000328747 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 FOPNL-201ENST00000255759 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 PARP4P1-201ENST00000435945 2337 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 TPH1-201ENST00000250018 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 GRXCR2-201ENST00000377976 2002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 ZNF215-205ENST00000529903 1396 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 IGIP-201ENST00000333305 3458 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 PIGN-220ENST00000638167 4195 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 SLC9A6-212ENST00000637195 4858 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 IKZF3-210ENST00000377958 1837 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AC011604.2-201ENST00000381541 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 ZNF763-202ENST00000358987 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 AL022323.4-201ENST00000623980 13120 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 ATMIN-204ENST00000564241 4803 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 TRAPPC3L-201ENST00000356128 2421 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 CASP1-215ENST00000533400 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 MROH2B-203ENST00000506092 3745 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 FRMD6-205ENST00000554167 4176 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 CD200R1-201ENST00000295863 1692 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CHRNEQ04844 CLEC6A-201ENST00000382073 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76 ms