Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 AC105411.1-201ENST00000568776 1470 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 IGSF10-201ENST00000282466 11067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 HMMR-203ENST00000393915 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 ADGRL2-209ENST00000370727 5164 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 AC104964.3-201ENST00000606115 2860 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 CCNB3-201ENST00000276014 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 AC004076.2-201ENST00000620532 3323 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 LINC01684-203ENST00000453784 2908 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 RAD1P1-201ENST00000231383 813 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 TAS2R8-201ENST00000240615 1243 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 RNA5SP326-201ENST00000363209 110 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 GPR52-201ENST00000367685 1088 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 KRTAP22-2-201ENST00000382830 293 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 RNU1-136P-201ENST00000384181 164 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 MIR105-2-201ENST00000385083 81 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 TAS2R15P-201ENST00000390674 928 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 HIGD1AP15-201ENST00000416198 280 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 AC005005.2-201ENST00000420779 380 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 AC000095.2-201ENST00000424407 768 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 LINC00348-201ENST00000428761 948 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 BX119904.1-201ENST00000432026 348 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 AL035246.1-201ENST00000433554 1255 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 USP12-AS1-201ENST00000440657 268 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 AL035416.1-201ENST00000443012 767 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 AL161629.1-201ENST00000446201 457 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 AL627224.1-201ENST00000448334 444 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 CCRL1P1-201ENST00000449542 1053 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 AC096992.1-201ENST00000459808 709 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 AC104849.1-201ENST00000462623 405 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 RN7SL515P-201ENST00000463999 297 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 AC090058.1-201ENST00000498788 435 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 PTPN20-212ENST00000502254 599 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 AC024558.1-201ENST00000505008 528 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 AC087664.1-201ENST00000521456 358 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 AC099520.1-205ENST00000524083 316 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 OR10G5P-201ENST00000532733 358 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 AP001266.2-201ENST00000534505 464 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 TRDV3-201ENST00000535880 425 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 AC063947.1-201ENST00000549036 557 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 SPIC-201ENST00000551346 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 HNRNPCP1-201ENST00000556181 766 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 AC084756.1-201ENST00000558237 606 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 AC092078.1-201ENST00000558370 325 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 AC009019.1-203ENST00000568603 515 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 AC113418.1-201ENST00000569928 517 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 ARL2BPP3-202ENST00000580773 420 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 AC008894.1-201ENST00000587693 367 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 ZRANB2-AS2-212ENST00000590186 686 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 AC100775.1-201ENST00000590942 522 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 AL021707.7-201ENST00000607991 416 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 MYCBP2-AS1-209ENST00000631152 412 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 AC000095.2-202ENST00000637415 154 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 LINC01179-201ENST00000507838 2163 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 MAP3K7-203ENST00000369327 4558 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 RAPH1-209ENST00000439222 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 MAK-204ENST00000536370 3767 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 DLG1-210ENST00000422288 2854 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 LIPJ-201ENST00000371939 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 AC137056.2-201ENST00000624055 1958 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 MAP3K19-204ENST00000392915 5030 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 ZNF432-202ENST00000594154 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 LINC01963-201ENST00000562038 3148 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 ALCAM-205ENST00000472644 4189 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 LINC01630-202ENST00000578152 3188 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 TRPC4-204ENST00000379673 2760 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 CDY11P-201ENST00000447168 1651 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 TM4SF20-201ENST00000304568 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 PEAK1-201ENST00000312493 11512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 EPB41L2-220ENST00000528282 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 SLC4A7-206ENST00000428386 7385 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 RPL39P5-201ENST00000273411 449 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 ASB17-201ENST00000284142 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 FCER1G-201ENST00000289902 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 C10orf120-201ENST00000329446 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 IFNA10-201ENST00000357374 963 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 RNU1-19P-201ENST00000363306 165 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 AC234772.1-201ENST00000377927 937 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 MIR223-201ENST00000385204 110 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 AC005042.1-201ENST00000393397 800 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 TAF9BP2-201ENST00000400856 499 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 AL390774.1-201ENST00000411924 246 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 AC025946.1-201ENST00000413286 430 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 RPS7P2-201ENST00000435134 607 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 MED6P1-201ENST00000439659 713 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 MTCYBP21-201ENST00000443300 1113 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 AL355601.1-201ENST00000444701 427 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 AL157884.3-201ENST00000448273 1184 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 AL031313.1-201ENST00000448435 256 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 RN7SL172P-201ENST00000460535 303 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 RPS17P11-201ENST00000474297 293 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 CBX1P5-201ENST00000475330 559 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 AC020779.1-201ENST00000478757 796 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 AC092691.3-201ENST00000482766 510 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CIPCQ9C0C6 AADACP1-204ENST00000483636 1285 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.8 ms