Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 AC092941.2-201ENST00000444379 1008 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 AL160271.1-201ENST00000444708 829 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 RPL31P44-201ENST00000447680 377 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 TRY2P-201ENST00000448860 689 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 AC012123.2-201ENST00000485809 248 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 HMGN2P25-201ENST00000486956 268 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 RPL37AP8-201ENST00000494116 276 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 LINC02039-201ENST00000507428 566 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 LINC02200-202ENST00000508879 615 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 AC100784.1-201ENST00000522790 310 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 AC105177.1-201ENST00000523110 555 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 LINC02402-201ENST00000550337 1212 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 AC009137.2-201ENST00000568179 641 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 AC027216.1-201ENST00000577726 685 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 C18orf32-202ENST00000582392 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 AL442125.2-201ENST00000619338 418 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 AC109462.4-201ENST00000637882 581 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 FAM184A-204ENST00000368475 3392 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 AC092376.2-201ENST00000622621 4116 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 RIMS2-209ENST00000507740 8002 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 AL358975.1-203ENST00000413352 2932 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 CNGA1-202ENST00000402813 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 ZNF410-211ENST00000555044 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 LINC01923-203ENST00000456248 2528 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 MMRN1-201ENST00000264790 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 ATP2C1-210ENST00000505330 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 OFD1P9Y-201ENST00000417699 1491 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 HHLA2-210ENST00000491820 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 TTF2-201ENST00000369466 9462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 ENPP2-208ENST00000522826 2667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 ENPP2-201ENST00000075322 2651 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 MOCS2-203ENST00000450852 1337 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 AC022417.1-201ENST00000624768 1303 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 DDX4-211ENST00000511853 1984 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 HIST1H2BD-201ENST00000289316 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 AC007618.1-201ENST00000366455 732 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 AL035079.1-201ENST00000405210 287 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 KCNJ13-203ENST00000410029 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 RAB9AP4-201ENST00000415230 609 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 LINC02532-206ENST00000433965 570 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 AL034380.1-201ENST00000448791 306 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 RN7SL860P-201ENST00000473738 223 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 RN7SL441P-201ENST00000492388 296 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 AP002765.2-201ENST00000532961 666 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 AL512310.9-201ENST00000553311 948 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 DUXA-201ENST00000554048 1006 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 AL049874.4-201ENST00000557593 255 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 AC022196.1-202ENST00000559570 462 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 AP005059.1-201ENST00000578391 456 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 AC011487.3-201ENST00000593607 453 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 AC105254.2-201ENST00000603636 436 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 DARS-AS1-225ENST00000615163 824 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 AC107905.1-201ENST00000616204 426 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 GRIA2-202ENST00000296526 5621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 KIAA1328-202ENST00000586135 1863 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 NRG1-220ENST00000539990 2401 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 TDO2-208ENST00000536354 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 EIF4EBP2-201ENST00000373218 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 PINCR-201ENST00000440955 2228 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 ZNF836-204ENST00000597252 3209 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 PRR14L-201ENST00000327423 10826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 OPRM1-215ENST00000520708 1519 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 SYT14-206ENST00000537238 5208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 CKAP5-202ENST00000354558 6428 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 TRIM51GP-201ENST00000534741 1350 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 RBM5-214ENST00000469838 2716 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 DNTTIP2-202ENST00000436063 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 AC097063.1-201ENST00000426714 1797 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 RFC1-201ENST00000349703 4859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 MAPK10-236ENST00000638313 3971 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 WEE2-201ENST00000397541 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 OR5AS1-201ENST00000313555 975 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 MIR133A2-201ENST00000347538 102 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 TRPC4-203ENST00000358477 2955 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 RN7SKP113-201ENST00000363891 295 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 AL353625.1-202ENST00000366273 571 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 ATP5HP3-201ENST00000396994 486 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 SNORA77-201ENST00000408716 125 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 CFLAR-AS1-201ENST00000415011 1072 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 RPL26P29-201ENST00000415623 438 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 AC234781.4-201ENST00000419384 244 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 COX6CP13-201ENST00000428703 226 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 SNRPFP2-201ENST00000440710 251 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 AC096644.1-201ENST00000446169 390 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 LINC01765-201ENST00000448680 491 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CDKN3Q16667 NDUFA5P8-201ENST00000449019 346 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.9 ms