Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 INTS2-207ENST00000617492 5805 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 SLC4A10-204ENST00000421911 3398 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 IFIT1P1-201ENST00000400497 1449 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 ZC3H13-201ENST00000242848 8018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 CLIP4-202ENST00000401605 2322 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 AP003175.1-201ENST00000641383 6658 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 SERPINB7-206ENST00000540675 2193 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 HIST1H1T-201ENST00000338379 718 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 DPH5-201ENST00000342173 1143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 IGHV6-1-201ENST00000390593 415 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 AC003045.1-201ENST00000398779 713 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 AL133260.1-201ENST00000405720 405 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 LINC00993-201ENST00000420453 540 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 LINC00387-201ENST00000422609 458 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 RPL32-206ENST00000435983 620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 FMO7P-201ENST00000436045 768 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 AP000146.1-203ENST00000444178 309 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 AC023271.1-201ENST00000445936 1090 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 RN7SL393P-201ENST00000463588 296 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 AC010307.1-201ENST00000467206 836 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 AADACP1-204ENST00000483636 1285 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 AC016933.1-201ENST00000504735 539 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 AC048346.1-201ENST00000510247 144 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 AC026719.2-201ENST00000515656 295 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 AC239860.2-201ENST00000525886 270 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 RPL27A-211ENST00000532359 406 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 PRH1-204ENST00000539853 837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 AP002754.2-201ENST00000542121 462 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 AL133166.1-201ENST00000551040 1034 ntTSL 4 BASIC7.21□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 AL096869.1-201ENST00000557622 559 ntTSL 4 BASIC7.21□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 ANKRD36BP2-206ENST00000575193 1245 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 AC090616.1-201ENST00000583895 447 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 AC012368.3-201ENST00000604190 219 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 AL356266.1-201ENST00000623311 483 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 AL136359.1-201ENST00000625090 565 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 OR51F2-202ENST00000641672 1136 ntAPPRIS P2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 CDR1-202ENST00000625883 1485 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 AC106799.3-201ENST00000562127 3300 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 NFAT5-201ENST00000349945 13362 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 FGFR1OP-202ENST00000366847 14166 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 TXNRD1-205ENST00000503506 3930 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 CCR9-204ENST00000422395 1331 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 AC107982.1-201ENST00000507171 1300 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 ZNF714-202ENST00000456283 6812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 DLG2-203ENST00000376104 5139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
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ECM1Q16610 LINC02092-201ENST00000455366 2472 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 FREM2-201ENST00000280481 16070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 GABRR1-206ENST00000611484 3259 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 DPY19L3-202ENST00000392250 5998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 FOXM1-202ENST00000359843 3315 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
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ECM1Q16610 FBXL17-203ENST00000496714 3773 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
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ECM1Q16610 CLEC7A-205ENST00000353231 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
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ECM1Q16610 LINC00630-201ENST00000416381 2012 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 ITPR1-204ENST00000443694 9513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 ZNF404-201ENST00000324394 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
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ECM1Q16610 OR51I2-202ENST00000641930 3302 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
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ECM1Q16610 RPS24-201ENST00000360830 514 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
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ECM1Q16610 CABYR-204ENST00000399499 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
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ECM1Q16610 MIR1284-201ENST00000408337 120 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 RPS7P13-201ENST00000413955 498 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 AP000221.1-201ENST00000419694 1046 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 AL445465.1-208ENST00000419709 506 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 Z82198.3-201ENST00000421145 199 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 RPL7AP51-201ENST00000422016 760 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
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ECM1Q16610 RPS24P8-201ENST00000431490 402 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 AC003989.1-201ENST00000434569 565 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 LINC00328-2P-201ENST00000436585 219 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 SPANXB1-201ENST00000449283 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 AC006947.1-201ENST00000457168 484 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 AL603882.1-201ENST00000463059 681 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 C1GALT1C1L-201ENST00000475092 1172 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 SELENOT-204ENST00000480740 783 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
ECM1Q16610 AC079841.1-201ENST00000481228 950 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
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