Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 ACAP2-IT1-201ENST00000419899 690 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 LINC01589-201ENST00000422971 548 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 RPS6P14-201ENST00000425165 719 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 LBX1-AS1-202ENST00000434878 418 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 AC092447.2-201ENST00000435487 669 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 RAB9AP5-201ENST00000437794 597 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 RAB9AP2-201ENST00000443911 597 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 LINC00189-203ENST00000447125 783 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 KCNMB2-AS1-205ENST00000451742 844 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 AL591473.1-201ENST00000464297 313 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 RPL7P41-201ENST00000485823 957 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 SETSIP-201ENST00000485873 879 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 OR11I1P-201ENST00000486033 954 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 RPS21P4-201ENST00000487122 248 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 ATXN3-206ENST00000502250 1259 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 AC024558.1-201ENST00000505008 528 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 BTG4P1-201ENST00000510421 183 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 AC090833.1-202ENST00000511073 781 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 AC138938.1-201ENST00000515431 782 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 MSC-AS1-205ENST00000519068 569 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 TBCA-207ENST00000520039 157 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 AC131254.2-201ENST00000521908 550 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 AC134775.1-201ENST00000531268 464 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 ASB8-215ENST00000540782 659 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 AC144548.2-201ENST00000550231 946 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 LINC02402-201ENST00000550337 1212 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 AC131532.1-201ENST00000555596 519 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 AC129510.2-201ENST00000582774 345 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 NPM1P45-201ENST00000583151 559 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 AC022916.4-201ENST00000585646 475 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 AL512329.2-201ENST00000607350 548 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 AC097376.2-202ENST00000608345 433 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 AC109309.2-201ENST00000612597 332 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 HPVC1-201ENST00000629899 1198 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 DARS-AS1-230ENST00000631306 530 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 CYP4F35P-202ENST00000636121 390 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 STXBP4-202ENST00000398391 2160 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 OR4K1-203ENST00000641429 1358 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 KMO-203ENST00000366558 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 AC092747.4-201ENST00000620519 1861 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 LMNTD1-201ENST00000282881 1718 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 SSR1-202ENST00000397511 3248 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 SOCS5P3-201ENST00000425115 1576 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 DNAH12-203ENST00000389536 2613 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 SPATA4-201ENST00000280191 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 SNORA51.1-201ENST00000363243 140 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 OR8V1P-201ENST00000395193 873 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 AC005522.1-201ENST00000395416 346 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 AC007068.1-201ENST00000396690 844 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 AL136116.2-201ENST00000404020 785 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 AF015720.1-201ENST00000412240 349 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 LINC01614-201ENST00000415479 648 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 AL592402.1-201ENST00000417161 440 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 AC104333.2-201ENST00000422630 192 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 Z85994.2-201ENST00000434327 452 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 AC009948.1-206ENST00000436616 1020 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 AC099063.1-201ENST00000437128 324 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 AL161629.1-201ENST00000446201 457 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 NOP56P2-201ENST00000447491 769 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 OR2AF1P-201ENST00000454899 889 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 TRAPPC2-204ENST00000458511 678 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 AP000942.1-201ENST00000463969 747 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 COPS8P2-201ENST00000473228 627 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 RN7SL814P-201ENST00000487715 300 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 TIFA-202ENST00000500655 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 AC016651.1-201ENST00000502680 822 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 RPS4XP20-201ENST00000505751 772 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 PGAM1P13-201ENST00000507497 754 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 AC019133.1-201ENST00000508292 420 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 LINC02429-202ENST00000513836 694 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 AC012400.1-201ENST00000518452 381 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 AC090022.1-201ENST00000546569 311 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 BNIP3P1-201ENST00000547295 580 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 AC004825.1-201ENST00000555068 586 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 AC104365.1-202ENST00000587080 398 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 ZNF561-AS1-207ENST00000591932 676 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 AC097467.3-209ENST00000595760 615 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 AC092474.3-201ENST00000603022 568 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 SUMO2P15-201ENST00000604285 278 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 AP005131.7-201ENST00000610087 611 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 AC015871.5-202ENST00000623252 701 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 AC104820.1-201ENST00000624183 307 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 AC004808.2-201ENST00000627965 773 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 LEUTX-202ENST00000638280 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 SRRM1-203ENST00000447431 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 AP3B1-204ENST00000519295 3986 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 SELL-201ENST00000236147 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 CR382285.2-201ENST00000624662 1495 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 CKAP5-202ENST00000354558 6428 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 MPDZ-204ENST00000381022 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 XKR4-201ENST00000327381 19880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 AC023421.1-201ENST00000590535 1785 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
ITGA9Q13797 ADAM29-213ENST00000615367 3386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.9 ms