Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 RMST-209ENST00000639542 3269 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 IFRD1-217ENST00000621379 3232 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 AC073429.2-201ENST00000569694 1444 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 PLCB1-210ENST00000612075 6576 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 CYP3A43-204ENST00000354829 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 EEF1A1P33-201ENST00000554413 1362 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 HSPD1P7-201ENST00000447985 1686 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 FABP7-202ENST00000368444 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 SNORA70.6-201ENST00000383934 134 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 SNORA40.4-201ENST00000390971 128 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 LINC01740-201ENST00000423842 332 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 RPS27P18-201ENST00000431701 247 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 MTND2P21-201ENST00000436242 1042 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 RPL12P3-201ENST00000440080 396 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 CBX1P2-201ENST00000453841 458 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 RN7SL329P-201ENST00000467740 299 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 SEPT7P9-201ENST00000475691 413 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 AC106864.1-201ENST00000510655 640 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 SNORA26.10-201ENST00000516427 141 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 AC069113.2-201ENST00000517735 359 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 AP001267.3-204ENST00000528578 423 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 AC039056.1-201ENST00000552704 467 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 LINC02301-201ENST00000553760 773 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 OR4C13-201ENST00000555099 1029 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 AC087190.2-201ENST00000565648 731 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 AC069307.1-201ENST00000602820 447 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 BANCR-201ENST00000624238 473 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 AC092159.4-201ENST00000624944 550 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 AJ009632.2-203ENST00000634708 1205 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 A1CF-205ENST00000374001 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 DTNA-227ENST00000597599 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 OR4F13P-202ENST00000560066 2054 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 TJP1-202ENST00000356107 6747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 VNN3-211ENST00000509351 1700 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 MIR4500HG-201ENST00000436290 1675 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 PINCR-201ENST00000440955 2228 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 AC020633.1-201ENST00000468439 2247 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 ADGRL3-217ENST00000514591 6297 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 OR55B1P-203ENST00000641518 2602 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 Y_RNA.110-201ENST00000363220 99 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 MRRF-203ENST00000373723 1176 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 RNU6-1263P-201ENST00000384601 106 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 RN7SKP279-201ENST00000411383 298 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 AL731575.1-201ENST00000413564 418 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 MTND4P24-201ENST00000424002 397 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 RPL7P56-201ENST00000429441 717 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 AC006055.1-201ENST00000432423 411 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 ZNF965P-201ENST00000432501 817 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 AC074367.1-201ENST00000438685 1125 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 AC093581.1-201ENST00000446411 461 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 LINC01767-201ENST00000451914 545 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 AL137005.1-201ENST00000452944 719 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 VN1R5-201ENST00000472952 1239 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 CBX1P5-201ENST00000475330 559 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 RPSAP51-201ENST00000497462 645 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 HMGB1P3-201ENST00000502802 616 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 AC012629.1-201ENST00000503953 342 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 AC134349.2-201ENST00000535136 910 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 AC122688.1-201ENST00000541494 223 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 MTCO2P22-201ENST00000603246 681 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 AC002128.2-201ENST00000604161 618 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 CR589904.2-201ENST00000612533 440 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 AC084816.1-212ENST00000625240 1114 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 LINC00254-202ENST00000633813 439 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 GVQW2-203ENST00000641401 327 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 FAM170B-AS1-203ENST00000442525 2000 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 MYBPC1-221ENST00000551300 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 EXO1-201ENST00000348581 3192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 ABCC13-202ENST00000463099 3842 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 AC009962.1-201ENST00000567327 3813 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 DNAJC16-210ENST00000616884 5882 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 PCDH15-209ENST00000395433 6942 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 DCLK1-204ENST00000379893 4612 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 AC068446.1-201ENST00000556425 1549 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 BX664718.1-201ENST00000439824 3224 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 METTL15-201ENST00000303459 4068 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 SPINK14-201ENST00000356972 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 OR6K3-202ENST00000368146 996 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 SAR1A-201ENST00000373236 437 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 AL158835.2-201ENST00000430970 300 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 LINC00969-211ENST00000438608 525 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 AL672138.1-201ENST00000450604 1015 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 AL590764.1-201ENST00000450860 726 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 BX284632.1-201ENST00000478218 541 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 OR9N1P-202ENST00000494289 481 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 LINC02488-201ENST00000504287 652 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 AC021087.2-201ENST00000504656 1203 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 MTND3P24-201ENST00000506306 329 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 AC109464.1-201ENST00000511091 819 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 LINC02480-201ENST00000511875 612 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 AC034244.2-201ENST00000514668 858 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
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