Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 PCDH11X-207ENST00000406881 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
RPS29P62273 MYO9A-209ENST00000564571 8111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
RPS29P62273 ZNF334-203ENST00000593880 2635 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
RPS29P62273 AP000473.2-201ENST00000602659 1537 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RPS29P62273 SLC4A10-206ENST00000446997 5551 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
RPS29P62273 SPINK5-201ENST00000256084 3535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
RPS29P62273 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
RPS29P62273 ZNF845-201ENST00000458035 4311 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RPS29P62273 IQCG-201ENST00000265239 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
RPS29P62273 MCF2L2-202ENST00000414362 3031 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RPS29P62273 EAF2-201ENST00000273668 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
RPS29P62273 IGLV5-48-201ENST00000390293 369 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RPS29P62273 Z98745.1-201ENST00000402553 494 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RPS29P62273 RN7SKP125-201ENST00000410481 302 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RPS29P62273 ARSD-AS1-201ENST00000414053 816 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RPS29P62273 COX6B1P1-201ENST00000415962 213 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RPS29P62273 CKS1BP6-201ENST00000424932 240 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RPS29P62273 AL353689.2-201ENST00000433837 440 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RPS29P62273 AC084149.1-201ENST00000437233 284 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RPS29P62273 AC073052.1-201ENST00000440417 714 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RPS29P62273 FAM237A-201ENST00000441223 773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RPS29P62273 LINC01431-201ENST00000442440 514 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RPS29P62273 AL157385.1-201ENST00000446973 268 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RPS29P62273 HIGD1AP8-201ENST00000453927 274 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RPS29P62273 LINC01150-201ENST00000455671 315 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
RPS29P62273 RPS4XP12-201ENST00000461747 709 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RPS29P62273 RPL23AP65-201ENST00000475608 468 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RPS29P62273 BX284632.1-201ENST00000478218 541 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RPS29P62273 LINC02508-201ENST00000504165 426 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RPS29P62273 AC139718.2-201ENST00000506068 481 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RPS29P62273 LINC02236-201ENST00000508881 552 ntTSL 4 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RPS29P62273 RNU6-709P-201ENST00000517257 104 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RPS29P62273 AC244502.1-203ENST00000541008 576 ntTSL 4 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RPS29P62273 AC008033.2-201ENST00000542626 177 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RPS29P62273 NOVA1-AS1-203ENST00000552101 468 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RPS29P62273 AC016987.1-201ENST00000558587 499 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RPS29P62273 RN7SL802P-201ENST00000577858 299 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RPS29P62273 AC015802.3-201ENST00000590241 570 ntTSL 4 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RPS29P62273 MIR99AHG-211ENST00000602323 475 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RPS29P62273 AC010531.5-201ENST00000602779 450 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RPS29P62273 AC020910.3-201ENST00000603701 874 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RPS29P62273 AL391358.1-201ENST00000605342 190 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RPS29P62273 AC016769.4-201ENST00000616893 535 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RPS29P62273 AC048338.2-201ENST00000623601 684 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RPS29P62273 AC087632.1-216ENST00000625619 487 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RPS29P62273 ASAH1-224ENST00000636269 685 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RPS29P62273 AP002512.4-201ENST00000641310 4672 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RPS29P62273 OR4E1-202ENST00000641792 3742 ntAPPRIS P5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RPS29P62273 OR56A1-202ENST00000641423 6096 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RPS29P62273 SLC35A5-206ENST00000492406 4399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
RPS29P62273 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
RPS29P62273 FGF13-202ENST00000315930 19519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
RPS29P62273 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
RPS29P62273 MIPEPP2-201ENST00000422560 1819 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RPS29P62273 TPTE2-205ENST00000400230 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RPS29P62273 BCLAF1-214ENST00000531224 7263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
RPS29P62273 RGS5-201ENST00000313961 5862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
RPS29P62273 LMNTD1-207ENST00000539744 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
RPS29P62273 ZNF568-216ENST00000619231 3797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RPS29P62273 OR51H2P-202ENST00000641424 3046 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RPS29P62273 AC025574.1-201ENST00000554784 1653 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RPS29P62273 FTX-210ENST00000603037 8347 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RPS29P62273 AC009643.2-201ENST00000603543 1448 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RPS29P62273 FLRT3-202ENST00000378053 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
RPS29P62273 AC008695.1-201ENST00000514667 6393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RPS29P62273 AL583808.2-201ENST00000418078 1382 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RPS29P62273 DICER1-212ENST00000541352 5621 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
RPS29P62273 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RPS29P62273 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
RPS29P62273 CPEB2-AS1-202ENST00000501916 1806 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RPS29P62273 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
RPS29P62273 AC106799.3-201ENST00000562127 3300 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RPS29P62273 OR8I2-201ENST00000302124 1010 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RPS29P62273 LINC00314-201ENST00000324988 607 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
RPS29P62273 ASXL1-203ENST00000375689 812 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RPS29P62273 RN7SKP267-201ENST00000410381 285 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RPS29P62273 GLUD1P9-201ENST00000420997 1173 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RPS29P62273 OR5M12P-201ENST00000423388 929 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RPS29P62273 EIF4HP2-201ENST00000424380 563 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RPS29P62273 AC008073.2-201ENST00000428344 792 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RPS29P62273 RBMY2QP-201ENST00000429799 1147 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RPS29P62273 LINC01506-201ENST00000432148 495 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RPS29P62273 RPS17P8-201ENST00000434525 335 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RPS29P62273 SCAND3P1-201ENST00000439854 1060 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RPS29P62273 CLEC5A-203ENST00000439991 501 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RPS29P62273 AC112498.1-201ENST00000444401 332 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RPS29P62273 TSACC-207ENST00000470342 601 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RPS29P62273 TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 488 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RPS29P62273 AC004453.1-201ENST00000487895 408 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RPS29P62273 AC104971.1-201ENST00000495117 578 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RPS29P62273 AC084048.1-201ENST00000505494 640 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RPS29P62273 AP001574.1-201ENST00000519566 546 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RPS29P62273 AC026688.1-201ENST00000520639 1168 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RPS29P62273 AC114550.3-201ENST00000524073 579 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RPS29P62273 AP001922.4-201ENST00000526967 290 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RPS29P62273 LINC02306-201ENST00000546412 529 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RPS29P62273 CYCSP40-201ENST00000575927 294 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RPS29P62273 AC004862.1-203ENST00000598433 1020 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
RPS29P62273 AL512782.1-201ENST00000603093 364 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RPS29P62273 MIR4500HG-205ENST00000606590 579 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
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