Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 CEP97-201ENST00000341893 8361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
TDRD12Q587J7 AC006210.2-201ENST00000367074 1545 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TDRD12Q587J7 AL592494.2-201ENST00000425455 1548 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TDRD12Q587J7 TGFBR1-208ENST00000550253 1538 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TDRD12Q587J7 LINC01553-203ENST00000521074 4329 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TDRD12Q587J7 GLYATL1-202ENST00000317391 1627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TDRD12Q587J7 C4orf17-201ENST00000326581 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TDRD12Q587J7 BLZF1-203ENST00000367808 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TDRD12Q587J7 R3HDM1-204ENST00000410054 4442 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TDRD12Q587J7 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TDRD12Q587J7 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TDRD12Q587J7 AC016576.1-201ENST00000637153 3585 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TDRD12Q587J7 SELL-201ENST00000236147 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TDRD12Q587J7 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TDRD12Q587J7 LINC02227-201ENST00000619068 3748 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TDRD12Q587J7 KMO-203ENST00000366558 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TDRD12Q587J7 NFKBIZ-203ENST00000394054 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TDRD12Q587J7 RNA5SP234-201ENST00000363916 119 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TDRD12Q587J7 SSX3-202ENST00000376893 800 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TDRD12Q587J7 KLRC3-202ENST00000396439 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TDRD12Q587J7 SNORA79B-201ENST00000410557 148 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TDRD12Q587J7 ERI3-IT1-201ENST00000414156 619 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TDRD12Q587J7 AC063965.1-201ENST00000416679 499 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TDRD12Q587J7 AL606970.4-201ENST00000424343 455 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TDRD12Q587J7 NAP1L4P2-201ENST00000425958 899 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TDRD12Q587J7 AL161722.2-201ENST00000434731 981 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TDRD12Q587J7 AL606534.3-201ENST00000437499 373 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TDRD12Q587J7 LINC01986-201ENST00000440867 590 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TDRD12Q587J7 AL365204.2-201ENST00000446754 687 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TDRD12Q587J7 AL353718.1-201ENST00000451028 517 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TDRD12Q587J7 BX842559.2-201ENST00000451418 605 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TDRD12Q587J7 RANP1-206ENST00000455094 651 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TDRD12Q587J7 AC034195.1-203ENST00000455703 728 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TDRD12Q587J7 AL359265.3-201ENST00000456125 579 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TDRD12Q587J7 SLC9A9-AS1-201ENST00000479030 518 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TDRD12Q587J7 RPL7P40-201ENST00000481703 745 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TDRD12Q587J7 NECTIN3-AS1-205ENST00000491709 792 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TDRD12Q587J7 ATG10-AS1-201ENST00000504846 648 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TDRD12Q587J7 INPP4B-206ENST00000506217 673 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TDRD12Q587J7 SSX6-203ENST00000509958 336 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TDRD12Q587J7 AC025768.1-201ENST00000510057 267 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TDRD12Q587J7 AC011389.1-203ENST00000513790 573 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TDRD12Q587J7 AP003354.2-201ENST00000517983 563 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TDRD12Q587J7 AC104997.1-201ENST00000519761 717 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TDRD12Q587J7 AF117829.1-208ENST00000521996 915 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TDRD12Q587J7 AP003059.1-201ENST00000526206 432 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TDRD12Q587J7 AC068775.2-201ENST00000539033 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TDRD12Q587J7 LINC02316-201ENST00000553346 768 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TDRD12Q587J7 AC134669.2-201ENST00000578584 1008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TDRD12Q587J7 MIR1273E-201ENST00000581165 102 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TDRD12Q587J7 GTSCR1-201ENST00000582578 470 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TDRD12Q587J7 UBA2-208ENST00000592791 910 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TDRD12Q587J7 DNAJC19P3-201ENST00000594491 331 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TDRD12Q587J7 AL356580.1-201ENST00000604129 159 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TDRD12Q587J7 AC017076.1-201ENST00000607613 578 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TDRD12Q587J7 ASNSD1-209ENST00000607829 581 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TDRD12Q587J7 AC008147.4-201ENST00000617570 1204 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TDRD12Q587J7 HNF1A-AS1-205ENST00000619441 343 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TDRD12Q587J7 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TDRD12Q587J7 LINC01685-203ENST00000634464 1201 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TDRD12Q587J7 AL136520.1-201ENST00000600311 1322 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TDRD12Q587J7 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TDRD12Q587J7 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TDRD12Q587J7 MED23-203ENST00000368058 4576 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TDRD12Q587J7 AP001002.1-201ENST00000625148 1513 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TDRD12Q587J7 AP000542.2-201ENST00000623199 6179 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TDRD12Q587J7 NCOA7-202ENST00000368357 5521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TDRD12Q587J7 ARHGEF6-203ENST00000370622 4779 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TDRD12Q587J7 AMY1C-201ENST00000370079 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TDRD12Q587J7 NSUN3-201ENST00000314622 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TDRD12Q587J7 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TDRD12Q587J7 MTND5P23-201ENST00000430812 1655 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TDRD12Q587J7 CLDND1-208ENST00000503004 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
TDRD12Q587J7 OR9K1P-202ENST00000641111 3217 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TDRD12Q587J7 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TDRD12Q587J7 GAS2L3-203ENST00000539410 2229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TDRD12Q587J7 ZEB1-219ENST00000560721 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TDRD12Q587J7 NME5-201ENST00000265191 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
TDRD12Q587J7 OR1L8-201ENST00000304865 1061 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TDRD12Q587J7 SPHAR-201ENST00000366688 648 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TDRD12Q587J7 PAGE2B-202ENST00000374974 456 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TDRD12Q587J7 SMARCA2-207ENST00000382186 955 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TDRD12Q587J7 MIR137-201ENST00000385223 102 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TDRD12Q587J7 RN7SKP16-201ENST00000410180 299 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TDRD12Q587J7 AC109779.1-201ENST00000414475 573 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TDRD12Q587J7 AC011754.1-201ENST00000415201 491 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TDRD12Q587J7 LINC01752-201ENST00000417299 438 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TDRD12Q587J7 AL158013.1-202ENST00000419666 520 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TDRD12Q587J7 AC073310.1-201ENST00000423226 1033 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TDRD12Q587J7 Z99289.1-206ENST00000425503 393 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TDRD12Q587J7 DSTNP5-201ENST00000427921 523 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TDRD12Q587J7 AL512625.3-204ENST00000438699 1031 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TDRD12Q587J7 AP003774.2-202ENST00000449694 341 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TDRD12Q587J7 PPIAP20-201ENST00000449839 135 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TDRD12Q587J7 OR6C72P-201ENST00000451403 892 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TDRD12Q587J7 AC239798.3-201ENST00000454459 408 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TDRD12Q587J7 RN7SL174P-201ENST00000475578 289 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TDRD12Q587J7 AC025470.2-201ENST00000506106 897 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TDRD12Q587J7 FGB-207ENST00000509493 1164 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TDRD12Q587J7 AC074087.1-201ENST00000512059 724 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
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