Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 BX276092.6-201ENST00000430476 250 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 AC073410.1-201ENST00000435125 589 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
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CCDC93Q567U6 BX276092.8-201ENST00000455722 250 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 EIF2S2P5-201ENST00000457635 968 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
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CCDC93Q567U6 AC087283.1-201ENST00000604029 1074 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 AL355802.4-201ENST00000607635 548 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
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CCDC93Q567U6 FILIP1-202ENST00000370020 4051 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 EIF4E-203ENST00000450253 11523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
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CCDC93Q567U6 MAPK10-236ENST00000638313 3971 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 CLIP1-AS1-201ENST00000535976 1745 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 LINC02141-201ENST00000568279 6586 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
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CCDC93Q567U6 ZNF248-201ENST00000357328 4795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 GABRA2-206ENST00000507460 5812 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
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CCDC93Q567U6 OR13C3-202ENST00000641090 1108 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 AIMP1-202ENST00000394701 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 CYP3A43-201ENST00000222382 1515 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 MTRNR2L3-201ENST00000543500 1539 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 ZNF525-201ENST00000467003 6107 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 C6orf163-202ENST00000388923 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 KIAA1841-205ENST00000453873 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 INTS6P1-201ENST00000504674 2530 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 AC110792.3-201ENST00000595906 1614 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 OR10A6-204ENST00000642108 6104 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 IL15-204ENST00000477265 6026 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 SMARCA2-201ENST00000302401 2242 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 RAPGEF4-215ENST00000540783 3974 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 TSPAN6-204ENST00000612152 3796 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 TSPAN8-202ENST00000393330 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 CFAP221-215ENST00000598644 1532 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 OR5AS1-201ENST00000313555 975 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 MIR133A2-201ENST00000347538 102 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 RNA5SP91-201ENST00000390902 119 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 OR4K12P-201ENST00000406538 961 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 MTATP6P31-201ENST00000406985 692 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 AC007557.4-201ENST00000421907 430 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC93Q567U6 AL121882.1-201ENST00000422893 417 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
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