Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 LINC01780-202ENST00000457683 391 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAM2Q15035 GYG1P1-201ENST00000460864 698 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAM2Q15035 RPL5P16-201ENST00000471467 790 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAM2Q15035 AC080162.1-201ENST00000480764 491 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAM2Q15035 AGGF1P3-201ENST00000493675 1213 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAM2Q15035 AC007370.1-201ENST00000503163 316 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAM2Q15035 RPS4XP20-201ENST00000505751 772 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAM2Q15035 AC008592.2-201ENST00000506070 571 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAM2Q15035 AC097491.1-201ENST00000507857 672 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAM2Q15035 HMGB3P16-201ENST00000508037 287 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAM2Q15035 AC011389.1-203ENST00000513790 573 ntTSL 4 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAM2Q15035 CA1-224ENST00000542576 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAM2Q15035 AC126177.5-201ENST00000549599 178 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAM2Q15035 AL136298.1-202ENST00000556520 518 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAM2Q15035 AC015845.2-201ENST00000581805 472 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAM2Q15035 SP2-AS1-204ENST00000585280 405 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAM2Q15035 AC009303.2-201ENST00000585381 1083 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAM2Q15035 AC092316.1-201ENST00000598703 297 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAM2Q15035 AC104695.2-201ENST00000605056 775 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAM2Q15035 AC127024.6-201ENST00000621598 424 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAM2Q15035 LINC01355-201ENST00000566551 5444 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAM2Q15035 ZNF83-203ENST00000541777 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAM2Q15035 DLX6-AS1-201ENST00000430027 15364 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAM2Q15035 EXO1-208ENST00000518483 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAM2Q15035 AL672167.1-204ENST00000641875 3017 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAM2Q15035 GPATCH2L-214ENST00000621494 12396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAM2Q15035 AC233968.1-201ENST00000611212 1300 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAM2Q15035 EIF2AK2-201ENST00000233057 10042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAM2Q15035 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAM2Q15035 LINC02261-201ENST00000512873 2802 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TRAM2Q15035 DNAH8-201ENST00000327475 14360 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAM2Q15035 FAM135A-210ENST00000505868 5173 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAM2Q15035 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAM2Q15035 SLC1A3-216ENST00000613445 4030 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAM2Q15035 MYBPC1-204ENST00000452455 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAM2Q15035 SLCO1A2-212ENST00000458504 2008 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAM2Q15035 OTC-201ENST00000039007 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAM2Q15035 MGP-201ENST00000228938 694 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAM2Q15035 RNASE9-201ENST00000338904 1049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAM2Q15035 AC005323.2-201ENST00000399342 583 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAM2Q15035 NUDT19P3-201ENST00000404698 555 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAM2Q15035 AC092675.1-201ENST00000409490 561 ntTSL 4 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAM2Q15035 DSCR4-IT1-201ENST00000417138 424 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAM2Q15035 LINC02518-201ENST00000421737 524 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAM2Q15035 TXNIP-201ENST00000425134 1225 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAM2Q15035 AL590999.1-204ENST00000430595 638 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAM2Q15035 NFYAP1-201ENST00000431953 972 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAM2Q15035 MAJIN-202ENST00000432175 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAM2Q15035 AL122019.1-201ENST00000438575 798 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAM2Q15035 LINC01133-202ENST00000443364 1266 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAM2Q15035 PRR16-203ENST00000446965 1152 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAM2Q15035 AL356981.1-201ENST00000454879 684 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAM2Q15035 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAM2Q15035 RN7SL466P-201ENST00000497546 295 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAM2Q15035 EGFLAM-AS3-201ENST00000505267 549 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAM2Q15035 RPL23AP53-201ENST00000521854 457 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAM2Q15035 PYM1-205ENST00000547925 499 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAM2Q15035 AL512310.9-201ENST00000553311 948 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAM2Q15035 RNASE9-204ENST00000553541 1136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAM2Q15035 RNASE9-206ENST00000554964 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAM2Q15035 RNASE9-208ENST00000556208 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAM2Q15035 RNASE9-210ENST00000557209 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAM2Q15035 AC018557.2-201ENST00000565082 536 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAM2Q15035 AC129510.2-201ENST00000582774 345 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAM2Q15035 RNA5SP440-201ENST00000612665 119 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAM2Q15035 Metazoa_SRP.93-201ENST00000622525 276 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAM2Q15035 Metazoa_SRP.130-201ENST00000622625 267 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAM2Q15035 AC093495.1-217ENST00000627385 428 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAM2Q15035 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAM2Q15035 CASC19-204ENST00000641001 2055 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAM2Q15035 ZFX-203ENST00000379177 7558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAM2Q15035 AC106895.2-201ENST00000511291 1824 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAM2Q15035 AL022393.1-201ENST00000625142 1677 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAM2Q15035 SSR1-202ENST00000397511 3248 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAM2Q15035 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TRAM2Q15035 GABRA2-211ENST00000514090 3401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TRAM2Q15035 SLC4A10-203ENST00000415876 5578 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
TRAM2Q15035 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
TRAM2Q15035 TDRD3-204ENST00000377894 2484 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TRAM2Q15035 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
TRAM2Q15035 SLC44A5-201ENST00000370855 4406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
TRAM2Q15035 THAP12P8-201ENST00000447914 2115 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TRAM2Q15035 C6-202ENST00000337836 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
TRAM2Q15035 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TRAM2Q15035 AC245407.1-201ENST00000621489 2538 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TRAM2Q15035 MTUS1-203ENST00000381861 3996 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TRAM2Q15035 TMBIM4-201ENST00000286424 989 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TRAM2Q15035 OR10A5-201ENST00000299454 1054 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TRAM2Q15035 TMSB4XP4-201ENST00000323496 618 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TRAM2Q15035 TRBV21OR9-2-201ENST00000331828 367 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TRAM2Q15035 OR5H1-201ENST00000354565 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TRAM2Q15035 UBBP2-201ENST00000376781 231 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TRAM2Q15035 SNORA67-201ENST00000384423 137 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TRAM2Q15035 MIR600-201ENST00000385007 98 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TRAM2Q15035 TRAV9-1-201ENST00000390431 338 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TRAM2Q15035 MIR1182-201ENST00000408363 97 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TRAM2Q15035 VN1R31P-201ENST00000417498 730 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TRAM2Q15035 OR51A6P-201ENST00000418680 1004 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TRAM2Q15035 EI24P4-201ENST00000423683 1078 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TRAM2Q15035 Z99289.1-206ENST00000425503 393 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.9 ms