Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 UBFD1P1-201ENST00000473259 814 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 F11-205ENST00000492972 1204 ntTSL 2 BASIC8.53□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 AP000424.2-201ENST00000523784 233 ntTSL 3 BASIC8.53□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 GLYCAM1-202ENST00000546607 553 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 AC093014.1-201ENST00000548926 724 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 AL133166.1-201ENST00000551040 1034 ntTSL 4 BASIC8.53□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 AL356804.1-201ENST00000553791 448 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 LINC00929-203ENST00000556213 713 ntTSL 2 BASIC8.53□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 AC091078.2-201ENST00000557145 559 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 AC090607.1-201ENST00000560057 449 ntTSL 3 BASIC8.53□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 AC092121.1-201ENST00000569452 202 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 AC022211.1-201ENST00000579554 717 ntTSL 3 BASIC8.53□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 AP001496.3-201ENST00000580230 913 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 UBA2-208ENST00000592791 910 ntTSL 2 BASIC8.53□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 AC145423.1-201ENST00000605712 336 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 TTN-AS1-267ENST00000628826 662 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 AC129915.3-201ENST00000634128 948 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 NOSTRIN-201ENST00000317647 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 AC010266.2-201ENST00000564741 3255 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 OOSP2-201ENST00000278855 1633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 AC011503.2-201ENST00000594230 1500 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 CYLD-201ENST00000311559 5371 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 SEM1-202ENST00000356686 2667 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 AC089984.1-201ENST00000552780 1431 ntTSL 3 BASIC8.53□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 C17orf78-203ENST00000611038 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.53□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 SLAMF6-202ENST00000368057 2712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
NEUROD1Q13562 ZNF876P-202ENST00000398732 1485 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 LRRC49-204ENST00000544974 6605 ntTSL 2 BASIC8.52□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 CASC19-248ENST00000641674 1356 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 PDE4D-202ENST00000317118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 SSH1-202ENST00000326495 13040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 PCDH15-202ENST00000361849 7017 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 PCDH15-205ENST00000373957 7032 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 BX284613.1-201ENST00000452221 1641 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 SCGB3A2-201ENST00000296694 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 REP15-201ENST00000310791 1078 ntAPPRIS P1 BASIC8.52□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 WFDC8-202ENST00000357199 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 RPS24-201ENST00000360830 514 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 RNU1-150P-201ENST00000362491 162 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 AL626787.1-201ENST00000366136 594 ntTSL 4 BASIC8.52□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 AL121904.1-202ENST00000416638 656 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 AC002069.1-201ENST00000429649 1159 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 LINC00411-201ENST00000436722 461 ntTSL 3 BASIC8.52□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 MTCO2P16-201ENST00000436962 677 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 MED28P3-201ENST00000444288 531 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 AC019117.1-204ENST00000451792 442 ntTSL 3 BASIC8.52□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 AC093663.2-201ENST00000484625 313 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 TRBV5-2-201ENST00000489095 273 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 STK26-205ENST00000496850 1186 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 SOX2-OT-216ENST00000497122 578 ntTSL 4 BASIC8.52□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 AC112206.2-204ENST00000504068 793 ntTSL 3 BASIC8.52□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 SCGB3A2-202ENST00000504320 440 ntTSL 3 BASIC8.52□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 AC139713.2-213ENST00000505000 796 ntTSL 2 BASIC8.52□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 B4GALNT2P1-201ENST00000508857 307 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 AC060775.1-201ENST00000518241 520 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 LINC01033-204ENST00000523194 715 ntTSL 2 BASIC8.52□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 LONRF1-203ENST00000525024 841 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 AC068135.2-201ENST00000569293 1028 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 AC090286.3-201ENST00000573133 187 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 DPRXP4-201ENST00000578053 568 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 AC099785.1-201ENST00000605697 437 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 VIS1.1-201ENST00000610517 203 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 MIR6778-201ENST00000617912 73 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 AP005431.1-201ENST00000618479 319 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 AC015804.1-201ENST00000622935 435 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 SNHG5-221ENST00000624295 632 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 AL390318.1-201ENST00000624564 687 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 AC069542.2-201ENST00000624816 216 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 AL392088.2-201ENST00000637607 285 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 5S_rRNA.28-201ENST00000638107 119 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 GRIA4-204ENST00000428631 2778 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 DENND4A-201ENST00000431932 5875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 RNASEL-202ENST00000539397 4046 ntTSL 2 BASIC8.52□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 MIR4500HG-201ENST00000436290 1675 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 ANGPT2-201ENST00000325203 5416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 ADH6-202ENST00000394897 3337 ntTSL 2 BASIC8.52□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 TRPC5OS-201ENST00000371970 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 GTF2IP4-201ENST00000453092 2054 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC8.51□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 INPP4B-214ENST00000508116 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 ADAMDEC1-201ENST00000256412 2348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 LINC00824-203ENST00000520206 2055 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 CLEC1A-204ENST00000457018 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.51□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 CLEC2D-201ENST00000261339 465 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 APOOL-201ENST00000373173 1279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 HTN3-201ENST00000381057 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.51□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 AC004022.2-201ENST00000413824 193 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 BBIP1-203ENST00000423273 492 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 AL162408.1-201ENST00000428853 433 ntTSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 AL354896.1-201ENST00000430214 561 ntTSL 4 BASIC8.51□□□□□ -1.05
NEUROD1Q13562 ZNF965P-201ENST00000432501 817 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms