Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 ANP32BP1-202ENST00000568553 737 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 CTSLP2-201ENST00000580501 394 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AQP4-205ENST00000581374 1586 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 TTN-AS1-219ENST00000586707 834 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AL353593.3-201ENST00000602778 764 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 LAMTOR5-207ENST00000602858 553 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 CT45A2-201ENST00000605791 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AL008729.1-201ENST00000606627 553 ntTSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 STARD13-AS-232ENST00000609137 882 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AC244100.4-201ENST00000617747 388 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 GLRA2-204ENST00000443437 3182 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 FOXJ3-204ENST00000372572 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 LRRC7-202ENST00000310961 6507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 CCDC125-202ENST00000396496 4198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AC010132.4-201ENST00000569883 1368 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 CYP4A22-206ENST00000619754 2351 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 ERG-202ENST00000398897 4651 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 OR8B8-202ENST00000642064 3914 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 BLOC1S2-205ENST00000614731 2634 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 C2CD6-203ENST00000439802 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 CBLB-205ENST00000407712 1493 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 MEPE-203ENST00000424957 2022 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 PLD1-202ENST00000351298 5604 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 ESF1-201ENST00000202816 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 MATR3-203ENST00000502499 2664 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 PIGA-216ENST00000637296 2113 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 IL20-202ENST00000367098 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 PPHLN1-208ENST00000449194 1583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 UGT2B24P-201ENST00000514441 1597 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 ZNF121-202ENST00000586602 7177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 PPP1R2P3-201ENST00000522232 1991 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 RXFP2-201ENST00000298386 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 RBPJP6-201ENST00000411556 1431 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 ING3-204ENST00000431467 1447 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 LINC01677-205ENST00000635636 2362 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 PUM2-201ENST00000319801 6002 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AL023755.1-201ENST00000441851 1801 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 BNC1-202ENST00000569704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 CABYR-216ENST00000621648 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 OR13F1-201ENST00000334726 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 OR5B21-201ENST00000360374 931 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 RNA5SP321-201ENST00000362722 111 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 SNORA70.3-201ENST00000365075 132 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 GCSAML-201ENST00000366488 3820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AL451142.1-201ENST00000375867 775 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 RNU6-253P-201ENST00000384730 105 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 C2orf88-202ENST00000396974 998 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AC009237.5-201ENST00000414271 501 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AC023469.2-201ENST00000425983 657 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AC008072.1-201ENST00000434254 824 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 ATP6V1G1P4-201ENST00000438388 335 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AC083855.1-201ENST00000440041 258 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AL354754.1-201ENST00000449730 625 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AP001596.1-202ENST00000452460 644 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 PHKA2-AS1-202ENST00000452900 656 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AL606519.1-201ENST00000458146 580 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 DCUN1D1-204ENST00000469954 970 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AC099340.1-201ENST00000475247 599 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 SUB1-203ENST00000502897 562 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AC073358.1-201ENST00000505671 684 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AC098859.2-201ENST00000506232 563 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 SUB1-211ENST00000512913 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 LINC02482-202ENST00000515205 422 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 NRG1-IT3-201ENST00000519023 505 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 TPT1-AS1-216ENST00000522845 403 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 BAALC-AS1-208ENST00000523614 582 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AP003033.2-201ENST00000528901 805 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 RAB30-209ENST00000532548 644 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 OR9G2P-201ENST00000533326 880 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AC025419.1-204ENST00000539653 745 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AC092375.1-201ENST00000550410 637 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 LINC02345-203ENST00000558897 405 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AC066612.2-201ENST00000559875 695 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AC138305.2-201ENST00000561595 556 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AC016134.1-201ENST00000565259 701 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AC090826.1-203ENST00000569235 490 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AC010547.7-201ENST00000570323 333 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AC024267.2-201ENST00000582737 417 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AC040963.1-201ENST00000591900 564 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AC020914.2-201ENST00000598220 430 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 BNIP3P26-201ENST00000600827 554 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AC091133.5-201ENST00000603088 301 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AC103881.1-201ENST00000603476 538 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 Metazoa_SRP.129-201ENST00000619776 251 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AC211486.4-201ENST00000621495 113 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AC131009.3-201ENST00000621809 287 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AC027559.1-201ENST00000636288 271 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AF001550.2-201ENST00000636643 217 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.5 ms