Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 AMELX-201ENST00000348912 737 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NME3Q13232 RNA5SP507-201ENST00000363603 121 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NME3Q13232 RNA5SP455-201ENST00000365190 119 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NME3Q13232 MIR765-201ENST00000390226 114 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NME3Q13232 SPTLC1P2-201ENST00000407089 121 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NME3Q13232 AC023347.1-202ENST00000419223 440 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NME3Q13232 AL158835.2-201ENST00000430970 300 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NME3Q13232 AC007556.1-201ENST00000432133 307 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NME3Q13232 BX323845.1-201ENST00000432417 179 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NME3Q13232 AL627308.1-201ENST00000435693 821 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NME3Q13232 HMGN2P25-201ENST00000486956 268 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NME3Q13232 AC000372.1-201ENST00000488818 646 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NME3Q13232 AC023424.1-201ENST00000496058 459 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NME3Q13232 AC005674.1-201ENST00000503493 459 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NME3Q13232 AC010350.1-201ENST00000504908 231 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NME3Q13232 AC008638.1-201ENST00000506035 866 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NME3Q13232 FGB-207ENST00000509493 1164 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NME3Q13232 AC012055.1-201ENST00000511346 1144 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NME3Q13232 AC004980.4-201ENST00000513375 203 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NME3Q13232 BAALC-AS1-205ENST00000521102 613 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NME3Q13232 APPL2-203ENST00000546731 684 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NME3Q13232 AC025263.2-201ENST00000550437 548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NME3Q13232 AC015912.1-201ENST00000574826 538 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NME3Q13232 AC010761.5-201ENST00000579468 287 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NME3Q13232 NPM1P45-201ENST00000583151 559 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NME3Q13232 AC011447.4-201ENST00000587562 111 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NME3Q13232 AC009303.3-201ENST00000591103 736 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NME3Q13232 AC006363.1-201ENST00000603806 463 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NME3Q13232 AL024498.1-201ENST00000606522 1100 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NME3Q13232 AC108359.1-201ENST00000616451 1211 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NME3Q13232 CCT5-215ENST00000625723 135 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NME3Q13232 AL033384.1-202ENST00000431554 3104 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
NME3Q13232 FOXP2-204ENST00000390668 1472 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
NME3Q13232 ADAM5-202ENST00000399789 1942 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NME3Q13232 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
NME3Q13232 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
NME3Q13232 FUT9-201ENST00000302103 12783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
NME3Q13232 TRPC4-203ENST00000358477 2955 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
NME3Q13232 NAMPTP1-201ENST00000440465 2514 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NME3Q13232 PPP1R2P3-201ENST00000522232 1991 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NME3Q13232 AC011503.2-201ENST00000594230 1500 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NME3Q13232 CENPI-204ENST00000423383 2314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NME3Q13232 ASAH2-204ENST00000447815 2311 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
NME3Q13232 MYO3A-203ENST00000376302 2723 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
NME3Q13232 SCN11A-202ENST00000444237 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NME3Q13232 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NME3Q13232 ZNF429-209ENST00000618549 1889 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NME3Q13232 CFAP47-203ENST00000378653 9943 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NME3Q13232 NAP1L4P1-201ENST00000319092 1157 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NME3Q13232 Y_RNA.62-201ENST00000362840 99 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NME3Q13232 RN7SKP213-201ENST00000410746 298 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NME3Q13232 CASKP1-201ENST00000412870 582 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NME3Q13232 AL591468.1-201ENST00000417932 573 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NME3Q13232 AC093162.1-201ENST00000419682 124 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NME3Q13232 COX6CP13-201ENST00000428703 226 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NME3Q13232 RGS1-203ENST00000469578 1034 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NME3Q13232 AC109462.1-201ENST00000491087 368 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NME3Q13232 RN7SL808P-201ENST00000496066 299 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NME3Q13232 MYL12BP2-201ENST00000503948 512 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NME3Q13232 FTH1P11-201ENST00000517577 551 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NME3Q13232 TBCA-207ENST00000520039 157 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NME3Q13232 AC016180.1-201ENST00000567945 403 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NME3Q13232 AC013244.1-201ENST00000604279 193 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NME3Q13232 ASAH1-224ENST00000636269 685 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NME3Q13232 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NME3Q13232 STXBP4-202ENST00000398391 2160 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
NME3Q13232 INTU-201ENST00000335251 13233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
NME3Q13232 RNF217-201ENST00000359704 1784 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
NME3Q13232 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
NME3Q13232 PAK3-213ENST00000620137 2130 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NME3Q13232 LINC01933-204ENST00000524295 3591 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NME3Q13232 LMNTD1-207ENST00000539744 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
NME3Q13232 NRG1-220ENST00000539990 2401 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NME3Q13232 OPRM1-215ENST00000520708 1519 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
NME3Q13232 ERI2-202ENST00000357967 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NME3Q13232 ATP8B4-211ENST00000559829 4894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NME3Q13232 NXF4-202ENST00000416098 1465 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NME3Q13232 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
NME3Q13232 SNORA66-201ENST00000384792 133 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NME3Q13232 RNF212B-201ENST00000399905 1071 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NME3Q13232 RNU6ATAC7P-201ENST00000408111 127 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NME3Q13232 COX5BP7-201ENST00000414780 274 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NME3Q13232 DDX39BP1-205ENST00000422507 192 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NME3Q13232 AL606970.4-201ENST00000424343 455 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NME3Q13232 MAGI2-AS3-204ENST00000426835 738 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NME3Q13232 RPL34P20-201ENST00000442771 351 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NME3Q13232 TCEA1P3-201ENST00000443005 880 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NME3Q13232 AC092647.3-201ENST00000443044 633 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NME3Q13232 CYP3A43-210ENST00000444905 733 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NME3Q13232 AC004980.3-201ENST00000447046 365 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NME3Q13232 CLEC2A-202ENST00000455827 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
NME3Q13232 AC073486.1-202ENST00000458437 489 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NME3Q13232 AC245028.2-201ENST00000458673 253 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NME3Q13232 RN7SL515P-201ENST00000463999 297 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NME3Q13232 AC005412.2-201ENST00000492004 341 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NME3Q13232 AC020551.1-201ENST00000512036 539 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NME3Q13232 ZBED3-AS1-209ENST00000512213 681 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NME3Q13232 RN7SKP147-201ENST00000517154 244 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NME3Q13232 HMGN2P6-201ENST00000551091 273 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NME3Q13232 AC022196.1-202ENST00000559570 462 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.1 ms